- 2024 - 2027 絶滅危惧種ウシモツゴの健全な個体群増加のための遺伝的多様性と適応的形質の解析
- 2024 - 2025 ぎふ保全生物学研究会
- 2023 - 2024 ぎふ保全生物学研究会
- 2023 - 2024 森林生態系におけるサンショウウオ類の多様性の解明と保全
- 2019 - 2022 ゲノム情報で解き明かすジュズカケハゼ種群の多様性と進化プロセス
- 2014 - 2016 国内淡水魚の遺伝子かく乱予測モデルの開発-共存関係に基づくリスク評価
- 2014 - 2016 国内および東アジアからの淡水魚の移入による影響実態と在来遺伝子資源の保全及び復元
- 2014 - 2015 地域の自然環境保全のための官学民連携基盤形成と市民への啓発
- 2011 - 2013 ため池生態系の保全と復元のための高精度調査に基づく淡水魚の「保全単位マップ」作成
- 2009 - 2012 国内移殖による淡水魚類の遺伝子かく乱の現状把握および遺伝子かく乱侵攻予測モデルの構築
- 2009 - 2012 大規模遺伝子データセットに基づく西日本の淡水魚類相形成史の総合的解明
- 2008 - 2011 インド亜大陸の衝突と気候変動による淡水魚類の進化と生物地理の解明
- 2007 - 2009 国内移入魚による生態系攪乱メカニズム究明とその監視手法の構築
- 2005 - 2007 揖斐川下流域におけるヨシ群落の魚類による利用調査
- 2005 - 2006 絶滅が危惧される魚類の繁殖に必要な環境特性の解明
- 2005 - 2006 日本列島-琉球列島間における汽水域生物群集の地理的分断と汽水魚の生態的分化の解析
- 1999 - 2001 汽水域エコトーンにおけるチチブ属魚類の生態的多様化と生殖隔離の維持機構
- 1997 - 1998 汽水域におけるチチブ属魚類(スズキ目ハゼ科)の雑種形成と生殖隔離の維持機構に関する研究
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