二井手哲平

ニイデテッペイ | Niide Teppei

所属機関・部署：
職名：助教
ホームページURL (1件)： http://www-shimizu.ist.osaka-u.ac.jp/hp/index.html

研究分野 (2件)：バイオ機能応用、バイオプロセス工学 , 分子生物学

研究キーワード (3件)：合成生物学 , 代謝工学 , タンパク質工学

競争的資金等の研究課題 (8件)：

2024 - 2026 進化情報と塩基エディターによる酵素大規模ライブラリーの作製と活性機能情報抽出
2022 - 2025 進化情報を構造シミュレーションに組み入れた合理的酵素設計とそのプロセス化
2021 - 2024 微細藻類の変動光に対する光化学系と代謝のシステム解析
2020 - 2022 要求駆動型合理的蛋白質設計技術が切り拓くナノ分子標的薬の創製
2020 - 2022 構造情報に基づいたin silico酵素改変が先導するスマート代謝経路設計

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論文 (24件)：

Chinatsu Matsuyama, Taisuke Seike, Nobuyuki Okahashi, Teppei Niide, Kiyotaka Y Hara, Yoko Hirono-Hara, Jun Ishii, Hiroshi Shimizu, Yoshihiro Toya, Fumio Matsuda. Metabolome analysis of metabolic burden in Escherichia coli caused by overexpression of green fluorescent protein and delta-rhodopsin. Journal of bioscience and bioengineering. 2024. 137. 3. 187-194
Kenta Miyoshi, Ryutaro Kawai, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Functional evaluation of non-oxidative glycolysis in Escherichia coli in the stationary phase under microaerobic conditions. JOURNAL OF BIOSCIENCE AND BIOENGINEERING. 2023. 135. 4. 291-297
Sou Sugiki, Teppei Niide, Yoshihiro Toya, Hiroshi Shimizu. Logistic Regression-Guided Identification of Cofactor Specificity-Contributing Residues in Enzyme with Sequence Datasets Partitioned by Catalytic Properties. ACS SYNTHETIC BIOLOGY. 2022. 11. 12. 3973-3985
Ryutaro Kawai, Yoshihiro Toya, Kenta Miyoshi, Manami Murakami, Teppei Niide, Takaaki Horinouchi, Tomoya Maeda, Atsushi Shibai, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu. Acceleration of target production in co-culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution. BIOTECHNOLOGY AND BIOENGINEERING. 2022. 119. 3. 936-945
Hikaru Nakazawa, Tomoko Onodera-Sugano, Aruto Sugiyama, Yoshikazu Tanaka, Takamitsu Hattori, Teppei Niide, Hiromi Ogata, Ryutaro Asano, Izumi Kumagai, Mitsuo Umetsu. Association behavior and control of the quality of cancer therapeutic bispecific diabodies expressed in Escherichia coli. BIOCHEMICAL ENGINEERING JOURNAL. 2020. 160. 107636-107636

MISC (63件)：

二井手哲平, 杉木創, 森聖也, 戸谷吉博, 清水浩. 酵素の基質特異性決定残基の同定におけるロジスティック回帰モデルの有用性. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th
宮脇佳汰, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩. 進化と構造の情報を組み込んだ酵素の耐熱化デザイン. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th
三吉健太, 一色衣香, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩. 非酸化的解糖経路を導入した大腸菌によるブチロラクタム生産のための代謝経路改変. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th
水谷夏希, 二井手哲平, 清水浩, 岡村康司. AI解析を足掛かりとした電位依存性ホスファターゼVSPの基質特異性形成機構の解明. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
森聖也, 二井手哲平, 戸谷吉博, 清水浩. 機械学習を用いた代謝酵素の基質特異性決定残基の推定と変換. 日本生物工学会大会講演要旨集. 2023. 75th

特許 (6件)：

難水溶性薬物の複合体及びその製造方法
プラスミド一周PCR法を用いたランダム遺伝子プラスミドライブラリー作成方法、それを用いた形質転換体作成方法、および、その方法に使用するキット
標的分子と結合するポリペプチド
抗体断片及び該抗体断片を含む二重特異性抗体
METHOD OF PRODUCING METAL NANOPARTICLES DECORATED WITH A PROTEIN

講演・口頭発表等 (17件)：

バイオモノづくりにおけるデータ駆動酵素工学
(応用物理学会 M&BE未来技術研究会 2024 2024)
機械学習を活用した酵素の分子認識特性の変換
(化学工学会第54回秋季大会)
モデル基盤代謝デザインと指向性進化による微生物創製
(化学工学会第54回秋季大会)
機械学習を用いた代謝酵素の基質特異性決定残基の推定と変換
(第75回日本生物工学会大会)
進化と構造の情報を組み込んだ酵素の耐熱化デザイン
(第75回日本生物工学会大会)

委員歴 (2件)：

2023/01 - 現在生物工学会誌バイオミディア委員
2021/01 - 2022/12 化学工学会誌トピックス委員

所属学会 (3件)：

日本化学会 , 日本生物工学会 , 化学工学会

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