国田勝行

KUNIDA Katsuyuki

所属機関・部署：
職名：准教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：

奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス領域客員准教授

ホームページURL (1件)： https://sites.google.com/view/kkunidalab

研究分野 (4件)：生命、健康、医療情報学 , 細胞生物学 , システムゲノム科学 , 医化学

研究キーワード (13件)：システム生物学 , 細胞生物学 , データ科学 , 数理モデリング , シミュレーション , システム同定 , 最適制御 , 細胞運動、細胞増殖、神経分化 , シグナル伝達、遺伝子発現、代謝変動 , 有用物質生産 , 画像解析 , 生細胞イメージング , マイクロ流体デバイス

競争的資金等の研究課題 (6件)：

2024 - 2025 癌細胞における細胞極性関連因子RhoGEF の機能解析
2019 - 2023 協調的な分子情報と力で駆動する細胞運動プロセスのデータ同化予測
2019 - 2021 計測・解析・制御が融合したデータ駆動型細胞制御システムの開発
2019 - 2020 細胞システムの最適制御アルゴリズム創出に向けた課題調査
2016 - 2019 骨格筋におけるインスリンシグナル伝達経路の選択的制御機構の解明

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論文 (27件)：

Yoji Nomura, Takanori Suzuki, Katsuyuki Kunida, Hidetoshi Uchida, Ryoichi Ito, Yasunori Oshima, Machiko Kito, Yuki Imai, Satoru Kawai, Kei Kozawa, et al. Analysis of cytokine profiles in pediatric fulminant myocarditis and acute myocarditis multicenter study. Pediatric Cardiology. 2024
Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. On-Line Reoptimization of Mammalian Fed-Batch Culture Using a Nonlinear Model Predictive Controller. New Generation Computing. 2023
Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. Extracting quantitative relationships between cell motility and molecular activities: analytical approaches and implications. Journal of Biomechanical Science and Engineering. 2023. 18. 4. 23-00336
Tomoki Ohkubo, Yuki Soma, Yuichi Sakumura, Taizo Hanai, Katsuyuki Kunida. A hybrid in silico/in-cell controller for microbial bioprocesses with process-model mismatch. Scientific Reports. 2023. 13. 1
Tomohiro Kinugasa, Masaaki Nagahara, Yuichi Sakumura, Katsuyuki Kunida. Design of Optimal Control Input in Glycolytic Oscillation System. Proceedings of IFAC World Congress 2023. 2023

MISC (8件)：

Tomoki Ohkubo, Yuichi Sakumura, Fuzhong Zhang, Katsuyuki Kunida. Designing a hybrid in silico/in-cell controller robust to process-model mismatch associated with dynamically regulated enzyme overexpression. bioRxiv. 2024
Tomoki Ohkubo, Haruyuki Kinoshita, Toshiro Maekawa, Katsuyuki Kunida, Hiroshi Kimura, Shinya Kuroda, Teruo Fujii. Development of a microfluidic cell culture and monitoring system for intracellular signaling studies. bioRxiv. 2018
小西克巳, 藤井雅史, 国田勝行, 宇田新介, 黒田真也. システム同定に基づく細胞内シグナル伝達機構の解明. 「システム/制御/情報」. 2017. 61. 7. 259-264
木下晴之, 前川敏郎, 国田勝行, 黒田真也, 藤井輝夫. 細胞応答計測のためのマイクロ流体制御技術と細胞培養システム. 「システム/制御/情報」. 2017. 61. 7
小西克巳, 土屋貴穂, 国田勝行, 藤井雅史, 宇田新介, 黒田真也. 不等間隔サンプリングデータによるシステム同定のための繰り返し核ノルム最小化法. システム制御情報学会研究発表講演会講演論文集. 2016. 60. 6p

特許 (1件)：

時系列画像を用いた多核で細長い細胞の自動的細胞認識法

講演・口頭発表等 (40件)：

Model selection algorithm for metabolite-enzyme networks including allosteric feedback
(EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg))
Integrated analysis for identifying the network controllability of intracellular molecular signaling
(EMBL Symposium AI and biology (EMBL Heidelberg))
アロステリックフィードバックを含む代謝物-酵素間ネットワーク推定のためのモデル選択アルゴリズム
(情報処理学会第77回バイオ情報学研究会(北陸先端科学技術大学院大学) 2024)
最適制御と特徴選択による細胞内分子ネットワークモデルの可制御性要因の探索
(情報処理学会第77回バイオ情報学研究会(北陸先端科学技術大学院大学) 2024)
Development of a data-driven method for estimating metabolite-enzyme networks
(APSIPA Japan Chapter Workshop 2023 (Kitami Institute of Technology) 2023)

学位 (1件)：

博士(医学) (京都大学)

経歴 (14件)：

2024/04 - 現在藤田医科大学精神・神経病態解明センター計算科学部門(兼) 准教授
2024/04 - 現在藤田医科大学医学部情報生命科学准教授
2021/04 - 現在奈良先端科学技術大学院大学バイオサイエンス領域客員准教授
2021/04 - 2024/03 藤田医科大学精神・神経病態解明センター計算科学部門(兼) 講師
2021/04 - 2024/03 藤田医科大学医学部情報生命科学講師

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委員歴 (6件)：

2024 - 現在日本細胞生物学会代議員
2024 - 現在情報処理学会数理モデル化と問題解決(MPS)研究会運営委員
2021 - 現在藤田医大医学部指導教員
2021 - 現在藤田医大医学部広報委員会委員
2017 - 現在 Faculty of 1000 Associate Faculty Member

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受賞 (2件)：

2019/11 - Asia-Pacific Signal and Information Processing Association Annual Summit and Conference (APSIPA ASC) 2019 Best Special Session Paper Award
2009/10 - 第82回日本生化学会大会一般口答発表優秀プレゼンテーション賞

所属学会 (5件)：

定量生物学の会 , 日本分子生物学会 , 日本細胞生物学会 , 日本生物物理学会 , 情報処理学会

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