研究者
J-GLOBAL ID：201701006627511620   更新日: 2024年11月19日

中山 卓郎

ナカヤマ タクロウ | NAKAYAMA Takuro
所属機関・部署：
筑波大学 計算科学研究センター

筑波大学 計算科学研究センター について


職名： 助教
ホームページURL (1件)： https://www.u.tsukuba.ac.jp/~nakayama.takuro.gb/
研究分野 (1件)： 進化生物学
競争的資金等の研究課題 (8件)：
  • 2024 - 2027 二次共生の中間段階にある共生者ゲノムの解読
  • 2020 - 2024 海洋微生物多様性の盲点-真核微生物に潜在する原核微生物叢の実態を探る
  • 2019 - 2024 光合成補助色素フコキサンチンの未知なる生合成系の解明とその誕生の謎を紐解く
  • 2018 - 2023 海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明
  • 2017 - 2020 渦鞭毛藻細胞に見られるシアノバクテリア共生体の機能および進化の解明
全件表示
論文 (38件)：
  • Nakayama, Takuro, Nomura, Mami, Yabuki, Akinori, Shiba, Kogiku, Inaba, Kazuo, Inagaki, Yuji. Convergent reductive evolution of cyanobacteria in symbiosis with Dinophysiales dinoflagellates. Scientific Reports. 2024. 14. 1. 12774-12774
  • Sakamoto, Fuku, Kanamori, Shunsuke, Díaz, Luis M, Cádiz, Antonio, Ishii, Yuu, Yamaguchi, Katsushi, Shigenobu, Shuji, Nakayama, Takuro, Makino, Takashi, Kawata, Masakado. Detection of evolutionary conserved and accelerated genomic regions related to adaptation to thermal niches in Anolis lizards. ECOLOGY AND EVOLUTION. 2024. 14. 3
  • Takako Mochizuki, Mika Sakamoto, Yasuhiro Tanizawa, Takuro Nakayama, Goro Tanifuji, Ryoma Kamikawa, Yasukazu Nakamura. A practical assembly guideline for genomes with various levels of heterozygosity. Briefings in Bioinformatics. 2023. 24. 6
  • Mami Nomura, Keisuke Ohta, Yukinori Nishigami, Takuro Nakayama, Kei-Ichiro Nakamura, Kenjiro Tadakuma, Josephine Galipon. Three-dimensional architecture and assembly mechanism of the egg-shaped shell in testate amoeba Paulinella micropora. Frontiers in Cell and Developmental Biology. 2023. 11
  • Harada, Ryo, Kume, Keitaro, Horie, Kazumasa, Nakayama, Takuro, Inagaki, Yuji, Amagasa, Toshiyuki. AtLASS: A scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2023. 16. 20-27
もっと見る
MISC (53件)：
  • 望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一. 様々なヘテロ接合性レベルを持つゲノムで検証された実用的なアセンブリガイドライン. 育種学研究. 2024. 26
  • 中山卓郎, 稲垣祐司. 緑色渦鞭毛藻Lepidodinium chlorophorumにおけるヌクレオモルフゲノムの存在検証. 藻類. 2022. 70. 1
  • 野村真未, 西上幸範, 市川正敏, 中山卓郎, 太田啓介, 中村桂一郎. 有殻アメーバ直伝,卵型シェルターの作り方. 日本植物生理学会年会(Web). 2021. 62nd
  • 望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一. 様々なヘテロ接合度の生物を用いたハプロイドセット構築のためのゲノムアセンブリ手法の評価. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2021. 44th
  • 望月孝子, 坂本美佳, 谷澤靖洋, 矢倉勝, 中山卓郎, 谷藤吾朗, 神川龍馬, 中村保一. 珪藻のゲノム解析支援:Nitzschia sp.PL1-4株のゲノムアセンブリ. 日本植物生理学会年会(Web). 2021. 62nd
もっと見る
書籍 (1件)：
  • 原生生物学事典
    朝倉書店 2023 ISBN:4254171811
講演・口頭発表等 (42件)：
  • 単細胞ゲノム増幅産物から発見された極小古細菌ゲノム.
    (日本微生物生態学会第37回大会)
  • 原生生物の核ゲノム転写物におけるRNA Editingの探索.
    (日本共生生物学会第8回大会)
  • Metamonadaとの近縁性が示唆される好気性原生生物の系統分類学的研究.
    (日本共生生物学会第8回大会)
  • 緑色渦鞭毛藻TGD株にみられるヌクレオモルフのゲノム解析 ー既知ヌクレオモルフゲノムとの共通点・相違点を探るー
    (日本共生生物学会第8回大会)
  • 光合成関連遺伝子に着目した緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムの解析.
    (日本藻類学会第48回大会)
もっと見る
経歴 (7件)：
  • 2021/04 - 現在 筑波大学 計算科学研究センター 助教
  • 2016/11 - 2021/03 東北大学 データ科学国際共同大学院 助教
  • 2016/11 - 2021/03 東北大学 生命科学研究科 助教
  • 2013/06 - 2016/10 筑波大学 計算科学研究センター 研究員
  • 2011/06 - 2013/06 ダルハウジー大学 日本学術振興会 海外特別研究員
全件表示
受賞 (4件)：
  • 2022/04 - 科学技術分野の文部科学大臣表彰 若手科学者賞
  • 2022/04 - 筑波大学若手教員特別奨励賞
  • 2021/09 - 日本植物学会賞奨励賞
  • 2015/03 - 日本藻類学会 日本藻類学会研究奨励賞
所属学会 (1件)：
日本植物学会
※　J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。 登録・更新については、こちらをご覧ください。

前のページに戻る

TOP

BOTTOM