- 2024 - 2027 土壌微生物と水田害虫の共生阻害に基づく環境負荷低減型害虫防除技術の開発
- 2021 - 2025 中途半端な共生を科学する:異宿主への適応プロセスから導く共生進化ロジック
- 2020 - 2025 鉄還元窒素固定の増強による低肥料バイオマス生産
- 2020 - 2025 水田土壌の窒素供給力を支える鉄還元菌窒素固定の学術的基盤解明と低窒素農業への応用
- 2021 - 2024 微生物がつなぐ土壌と昆虫の関係性の解明とその制御技術基盤の開発
- 2021 - 2023 土壌に特異的に優占する難培養細菌門アシドバクテリアのバイオリソース拡充
- 2020 - 2023 資源循環の最適化による農地由来の温室効果ガスの排出削減
- 2018 - 2022 全地球規模で解き明かすカメムシ共生細菌の多様性と進化
- 2019 - 2021 土壌微生物が昆虫に及ぼす生態系サービスの解明
- 2018 - 2021 ミバエ類の腸内細菌が土壌環境の改変により寄主植物に与える影響の解明
- 2019 - 2021 腸内細菌をねらった害虫防除技術の基盤創出
- 2018 - 2021 土を肥やす新たな微生物基盤の解明
- 2018 - 2020 陸域環境の窒素固定を担う微生物基盤の刷新
- 2017 - 2020 水田土壌の自律的な窒素肥沃度維持を担う微生物メカニズムの解明
- 2017 - 2018 高成長アワビの腸内環境移植・形成によるアワビの陸上加温養殖方法の開発
- 2015 - 2017 メダカの腸内細菌叢解析:魚類腸内細菌叢の機能解明に向けたモデル研究
- 2012 - 2013 メタゲノム情報を活用した土壌の亜酸化窒素還元酵素遺伝子の多様性研究の新展開
- 2010 - 2011 次世代シーケンス技術を用いた農耕地土壌の微生物群集の構造と変遷の網羅的解明
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