- 2018 - 2021 東南アジア産樹木の種多様性・系統多様性・形質多様性の地理的パターン
- 2016 - 2019 東南アジアの森林植物を対象とした種および遺伝子多様性の包括的解析
- 2015 - 2018 ボルネオ島・スマトラ島での野外調査にもとづく東南アジアの樹木フロラの網羅的解明
- 2012 - 2017 東南アジア林冠部植物多様性と地理的生態的な群集分化解明のための広域インベントリー
- 2010 - 2016 複合適応形質進化の遺伝子基盤解明
- 2012 - 2015 植物の対照的適応戦略に関する次世代分子生態学
- 2010 - 2012 最終氷期以降の分布拡大に伴う森林樹木の遺伝的適応に関する集団遺伝学的研究
- 2009 - 2011 協調的送粉形質のシフトに関する実験分子生態学的研究:キスゲ属をモデルに
- 2007 - 2009 対照的な集団構造を持つ樹種での遺伝子進化特性に関する集団遺伝学的研究
- 2007 - 2008 送粉シンドロームのシフトに関する実験進化生態学的研究:キスゲとハマカンゾウを例に
- 2002 - 2005 QTLマッピング法を利用した実験進化生態学的研究
- 2002 - 2003 メキシコ・ブラジル産ステビア属の種分化
- 2000 - 2001 ツチガエルにおける性比調節:ZW型集団の比較
- 2000 - 2001 メキシコ産ステビア属における有性生殖・無性生殖型の変異と進化
- 1999 - 2001 絶滅危惧植物保全を目的とした絶滅リスク評価法の開発
- 1999 - 2000 ヒヨドリバナ属有性型・無性型におけるLRR型耐病性遺伝子の文子進化
- 1998 - 1999 北米・メキシコ産キク科マリゴールド連の分子系統と染色体進化
- 1998 - 1998 利己的遺伝子と性の進化
- 1998 - 1998 ノネコのメスによる配偶者選択:MCH認識の検証
- 1996 - 1998 系統樹にもとづく種間比較法による共進化と性的二型の解析
- 1996 - 1998 性の進化生態学
- 1997 - 1997 ヒヨドリバナに感染するジェミニウイルスの分子生態学
- 1997 - 1997 メキシコ産ステビア属植物の分子系統と比較生態
- 1996 - 1996 有性・無性植物に感染するジェミニウイルスの分子進化
- 1995 - 1996 ステビア属植物における形態・生態・染色体の進化傾向:分子系統学的アプローチ
- 1995 - 1996 絶滅と存続の集団生物学
- 1995 - 1996 メキシコ産ステビア属植物の分子系統と比較生態
- 1995 - 1995 東アジアにおけるシオン属およびヨメナ属の植物地理の分子系統学的解析
- 1994 - 1994 寄主植物と寄生者の空間分布動態がもたらす遺伝的多様性:レフュージ効果のモデル解析
- 1994 - 1994 ジェミニウイルスと宿主植物の分子共進化
- 1993 - 1994 固有値感度分析による分散-定着型昆虫の生活史パラメータの進化の実験・モデル解析
- 1993 - 1994 新大陸熱帯・亜熱帯地域における無性生殖植物の進化
- 1992 - 1994 陸上植物の絶滅と保全の生物学
- 1992 - 1994 変動環境の集団遺伝学理論の整備と検証
- 1993 - 1993 植物資源をめぐる共生者と寄生者の共存機構
- 1992 - 1993 オーストラリア産ブラキスコーム属における染色体進化と分子進化の比較研究
- 1992 - 1992 ヒヨドリバナ有性型・無性型における寄生植物・病原菌・植食昆虫の相互作用
- 1991 - 1992 新大陸産キク科ヒヨドリバナ属近縁植物の分子系統学的研究
- 1991 - 1991 ヒヨドリバナ有性型・無性型における寄主植物・病原菌・植食昆虫の相互作用
- 1990 - 1991 DNAを用いたキク科ヒヨドリバナ連の分子分類学的研究
- 1990 - 1991 被子植物における交配システムの進化
- 1988 - 1989 ヒヨドリバナ属における遺伝子重複とその系統学的意義
- 1988 - 1989 北米東南部におけるヒヨドリバナ属の種分化
- 1985 - 1986 高等植物における無配生殖の進化機構
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