研究者
J-GLOBAL ID:201801010706159189
更新日: 2024年12月12日
坂本 光央
サカモト ミツオ | Sakamoto Mitsuo
所属機関・部署:
職名:
専任研究員
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
ホームページURL (2件):
https://jcm.brc.riken.jp/ja/
,
http://jcm.brc.riken.jp/en/
研究分野 (2件):
多様性生物学、分類学
, 応用微生物学
研究キーワード (5件):
カルチャーコレクション
, 腸内細菌
, 微生物分類
, Bacteroides
, 常在細菌
競争的資金等の研究課題 (12件):
- 2021 - 2027 リバーストランスレーショナル創薬に向けた包括的マイクロバイオーム制御基盤技術開発-マイクロバイオーム創薬エコシステム構築に向けて-
- 2021 - 2025 口腔マイクロバイオームの新機能:「副代謝系」の解明による口腔と全身の健康増進戦略
- 2018 - 2020 ヒトマイクロバイオームの産業利用に向けた、解析技術及び革新的制御技術の開発
- 2016 - 2020 難培養微生物の分離培養と微生物間共生機構の解明
- 2017 - 2020 健全な口腔マイクロバイオームとは何か?代謝的復元力に基づく口腔健康指標の提案
- 2014 - 2017 口腔バイオフィルムのメタボローム解析:細菌叢代謝活性から探る口腔疾患リスク指標
- 2015 - 2016 ヒト腸内からの難培養性微生物の単離とその分類およびバイオリソース整備
- 2011 - 2013 多遺伝子座位配列解析による嫌気性グラム陰性桿菌の種の定義
- 2010 - 2013 口腔バイオフィルム・唾液のメタボローム解析で拓く「口腔疾患リスク指標」
- 2009 - 2011 嫌気性グラム陰性桿菌の系統分類学的研究
- 2007 - 2009 口腔バイオフィルムのメタボローム解析とその口腔健康指標として応用
- 2001 - 2002 分子生物学的手法による口腔内微生物群集の構造解析ならびにそのシステム化
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論文 (197件):
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Kobayashi, H, Tanizawa, Y, Sakamoto, M, Ohkuma, M, Tohno, M. Lacrimispora brassicae sp. nov. isolated from fermented cabbage, and proposal of Clostridium indicum Gundawar et al. 2019 and Clostridium methoxybenzovorans Mechichi et al. 1999 as heterotypic synonyms of Lacrimispora amygdalina (Parshina et al. 2003) Haas and Blanchard 2020 and Lacrimispora indolis (McClung and McCoy 1957) Haas and Blanchard 2020, respectively. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2024. 74. 7. 006456
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Kato, S, Itoh, T, Iino, T, Sakamoto, M, Ohkuma, M. Rhodoferax lithotrophicus sp. nov., a neutrophilic iron-oxidizing and -reducing bacterium isolated from iron-rich freshwater sediments. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2024. 74. 6. 006439
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Sakamoto, M, Hisatomi, A, Ohkuma, M. Isolation and characterization of a new Waltera species and reclassification of Brotolimicola acetigignens Hitch et al. 2022 as Waltera acetigignens comb. nov. Int. J. Syst. Evol. Microbiol. 2024. 74. 5. 006381
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Hisatomi, A, Tourlousse, D. M, Hamajima, M, Ohkuma, M, Sekiguchi, Y, Sakamoto, M. Complete genome sequences of Ruminococcus torques strains JCM 36208 and JCM 36209, isolated from the feces of a healthy Japanese male. Microbiol. Resour. Announc. 2023. 12. 11. e00632-23
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Anda, M, Yamanouchi, S, Cosentino, S, Sakamoto, M, Ohkuma, M, Takashima, M, Toyoda, A, Iwasaki, W. Bacteria can maintain rRNA operons solely on plasmids for hundreds of millions of years. Nat. Commun. 2023. 14. 7232
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MISC (27件):
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久富 敦, 大熊 盛也, 坂本 光央. 液液共培養法による腸内細菌の分離と同定. Microb. Resour. Syst. 2024. 40. 1. 39-45
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坂本 光央. ヒト腸内からの新規微生物の分離. Microb. Resour. Syst. 2023. 39. 1. 3-10
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牧野 磨音, 坂本 光央, 清水 謙多郎, 門田 幸二. 次世代シーケンサーデータの解析手法 第20回 RNA-seq カウントデータの性質と統計モデル. 日本乳酸菌学会誌. 2023. 34. 1. 21-29
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坂本 光央. 微生物の分離・培養および分類. 日本乳酸菌学会誌. 2023. 34. 1. 3-8
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Siqueira, J. F. Jr, Sakamoto, M, Rosado, A. S. Microbial community profiling using terminal restriction fragment length polymorphism (T-RFLP) and denaturing gradient gel electrophoresis (DGGE). Methods Mol. Biol. 2022. 2588. 91-104
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特許 (1件):
書籍 (16件):
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微生物資源の整備と利活用の戦略
NTS 2023 ISBN:9784860438586
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未培養微生物研究の最新動向
シーエムシー出版 2023 ISBN:9784781317328
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実験医学別冊 改訂版 もっとよくわかる!腸内細菌叢
羊土社 2022 ISBN:9784758122115
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ヒトマイクロバイオーム Vol.2
NTS 2020 ISBN:9784860436599
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実験医学別冊 もっとわかる!腸内細菌叢
羊土社 2019 ISBN:9784758122061
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講演・口頭発表等 (224件):
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ICSPと分類学
(日本微生物資源学会 公益財団法人発酵研究所 学会・研究部会助成 公開シンポジウム 「ゲノム時代の微生物分類学を考える」 2025)
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Polyphasic taxonomic characterization of a novel Waltera species, isolated from human feces
(18th Congress of the International Union of Microbiological Societies (IUMS 2024) 2024)
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Isolation and identification of gut microbes by liquid-liquid co-culture method
(18th Congress of the International Union of Microbiological Societies (IUMS 2024) 2024)
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芽胞形成細菌の発芽誘導法の検討
(第97回日本細菌学会総会 2024)
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ヒト腸内から分離されたWaltera属の新菌種
(第97回日本細菌学会総会 2024)
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学歴 (3件):
- 1997 - 東京農業大学大学院 農学研究科農芸化学専攻 博士後期課程修了
- 1994 - 東京農業大学大学院 農学研究科農芸化学専攻 博士前期課程修了
- 1992 - 東京農業大学 農学部 農芸化学科卒業
学位 (2件):
- 博士(農芸化学) (東京農業大学)
- 博士(歯学) (東北大学)
経歴 (10件):
- 2024/04 - 現在 東京農業大学 総合研究所 客員教授
- 2018/04 - 現在 国立研究開発法人理化学研究所 バイオリソース研究センター 微生物材料開発室 専任研究員
- 2017/04 - 2018/03 国立研究開発法人理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室 専任研究員
- 2013/04 - 2017/03 国立研究開発法人理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室 研究員
- 2004/07 - 2013/03 独立行政法人理化学研究所 バイオリソースセンター 微生物材料開発室 協力研究員
- 2003/10 - 2004/06 独立行政法人理化学研究所 微生物機能解析室 協力研究員
- 2002/04 - 2003/09 理化学研究所 生物基盤研究部 微生物機能解析室 協力研究員
- 2000/10 - 2002/03 理化学研究所 生物基盤研究部 微生物分類室 協力研究員
- 1997/10 - 2000/09 理化学研究所 生物基盤研究部 微生物分類室 基礎科学特別研究員
- 1997/04 - 1997/09 理化学研究所 培養生物部 ライフサイエンス研究協力員
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委員歴 (20件):
- 2024/07 - 現在 日本乳酸菌学会 評議員
- 2023/09 - 現在 国際原核生物分類命名委員会 理事
- 2023/06 - 現在 腸内細菌学会 理事
- 2022/12 - 現在 国際原核生物分類命名委員会 委員
- 2022/11 - 現在 独立行政法人医薬品医療機器総合機構 専門委員
- 2019/04 - 現在 日本微生物資源学会 理事(庶務、2019年4月〜2023年3月;系統分類部会、2023年4月〜)
- 2011/02 - 現在 国際グラム陰性嫌気性桿菌命名小委員会 委員
- 2009/11 - 現在 日本乳酸菌学会 セミナー委員
- 2022/04 - 2024/03 日本乳酸菌学会 乳酸菌・腸内細菌分類・培養専門委員会委員
- 2021/04 - 2023/12 日本細菌学会関東支部 評議員
- 2015/06 - 2023/07 BMFH出版会 編集委員
- 2019/06 - 2023/06 腸内細菌学会 評議員
- 2014/07 - 2023/03 日本乳酸菌学会 編集委員
- 2020/08 - 2022/07 独立行政法人医薬品医療機器総合機構 マイクロバイオーム専門部会委員
- 2015/06 - 2019/07 BMFH出版会 理事(編集担当:副編集委員長)
- 2014/07 - 2019/07 日本乳酸菌学会 理事(編集担当:編集委員長、2015年7月〜2019年7月)
- 2008 - 2019 日本微生物資源学会 実務担当小委員会委員
- 2015 - 2017 日本微生物資源学会 実務担当小委員会委員長
- 2008/04 - 2014/06 日本乳酸菌学会 評議員
- 2005/04 - 2007/03 日本農芸化学会 代議員
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受賞 (10件):
- 2024/07 - 日本微生物資源学会 日本微生物資源学会第30回大会口頭発表賞 液液共培養法によって得られた腸内細菌種について
- 2023/07 - 日本乳酸菌学会 日本乳酸菌学会2023年度大会若手優秀発表賞(分類・培養部門) クマバチに分布する新種の乳酸菌群で構成される腸内菌叢の解析
- 2022/06 - Wiley Top Downloaded Article Microbial interaction between the succinate-utilizing bacterium Phascolarctobacterium faecium and the gut commensal Bacteroides thetaiotaomicron
- 2022/03 - Wiley Top Cited Article 2020-2021 Microbial interaction between the succinate-utilizing bacterium Phascolarctobacterium faecium and the gut commensal Bacteroides thetaiotaomicron
- 2020/01 - 日本農芸化学会 日本農芸化学会2020年度大会トピックス演題選出 ヒトマイクロバイオーム解析のためのMock Communityの開発
- 2019/07 - 日本農芸化学会北海道支部 2019年度日本農芸化学会北海道支部第1回講演会優秀発表賞 酪酸産生菌のフルクトオリゴ糖代謝
- 2019/06 - 日本微生物資源学会 日本微生物資源学会第26回大会ポスター賞 シロアリから単離した新規Lactococcus属細菌の分類学的検討
- 2018/07 - 日本微生物生態学会 日本微生物生態学会第32回大会ポスター賞 rRNA遺伝子をプラスミドだけで維持するバクテリアの進化
- 2008/07 - 日本微生物資源学会 日本微生物資源学会奨励賞 嫌気性グラム陰性桿菌の分類学的研究
- 2004/04 - 日本細菌学会 黒屋奨学賞 分子生物学的手法による歯周病原性細菌の検出・定量系の確立と口腔内細菌叢の多様性解析に関する研究
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所属学会 (7件):
American Society for Microbiology
, 腸内細菌学会
, 日本細菌学会
, 日本微生物生態学会
, 日本微生物資源学会
, 日本農芸化学会
, 日本乳酸菌学会
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