研究者
J-GLOBAL ID:201801012877083043   更新日: 2024年12月10日

新海 創也

シンカイ ソウヤ | Shinkai Soya
所属機関・部署:
職名: 上級研究員
ホームページURL (1件): http://soyashinkai.com/
研究分野 (4件): システムゲノム科学 ,  生物物理学 ,  生物物理、化学物理、ソフトマターの物理 ,  数理物理、物性基礎
研究キーワード (9件): 3次元ゲノム ,  クロマチン動態 ,  クロマチン構造 ,  染色体動態 ,  染色体構造 ,  フィジカルバイオロジー ,  統計物理学 ,  マイクロレオロジー ,  非線形科学
競争的資金等の研究課題 (11件):
  • 2023 - 2029 マルチモーダル時空間統合オミクス解析による哺乳類細胞運命制御基盤の理解
  • 2023 - 2025 Hi-Cデータに基づいたクロマチンの粘弾性とループ形成のモダリティ
  • 2022 - 2025 クロマチンの運動性から捉える転写制御のゆらぎとがん細胞の悪性化
  • 2022 - 2025 高次ゲノム構造動態と遺伝子発現の連関解明
  • 2021 - 2023 流体力学的相互作用下における3次元ゲノム組織化のモダリティ
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論文 (28件):
  • Hiroaki Ohishi, Soya Shinkai, Hitoshi Owada, Takeru Fujii, Kazufumi Hosoda, Shuichi Onami, Takashi Yamamoto, Yasuyuki Ohkawa, Hiroshi Ochiai. Transcription-coupled changes in genomic region proximities during transcriptional bursting. Science Advances. 2024. 10. 49. adn0020
  • Soya Shinkai, Shuichi Onami, Tomoshige Miyaguchi. Generalized Langevin dynamics for single beads in linear elastic networks. Physical Review E. 2024. 110. 4. 044136
  • Soya Shinkai, Shuichi Onami. 4D Genome Analysis Using PHi-C2. Methods in Molecular Biology. 2024. 2856. 271-279
  • Kazuko Okamoto, Hideaki Fujita, Yasushi Okada, Soya Shinkai, Shuichi Onami, Kuniya Abe, Kenta Fujimoto, Kensuke Sasaki, Go Shioi, Tomonobu M Watanabe. Single-molecule tracking of Nanog and Oct4 in living mouse embryonic stem cells uncovers a feedback mechanism of pluripotency maintenance. The EMBO Journal. 2023. e112305
  • Masatoshi Hara, Mariko Ariyoshi, Tomoki Sano, Ryu-Suke Nozawa, Soya Shinkai, Shuichi Onami, Isabelle Jansen, Toru Hirota, Tatsuo Fukagawa. Centromere/kinetochore is assembled through CENP-C oligomerization. Molecular Cell. 2023. 83. 13. 2188-2205.e13
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MISC (14件):
  • Soya Shinkai, Yuichi Togashi. Quantitative Theory of Active Diffusion Trajectories by Instantaneous Diffusion Coefficient. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2015. 108. 2. 471A-472A
  • 田宮 裕治, 新海 創也, 相澤 洋二. 28aAK-1 ハミルトン系カオスのlog-Weibull則とNekhoroshevの定理(28aAK 保存力学系・多体系,領域11(物性基礎論・統計力学・流体物理・応用数学・社会経済物理)). 日本物理学会講演概要集. 2014. 69. 1. 317-317
  • 新海 創也, 冨樫 祐一. 28aPS-121 異常拡散の出現機構の新たな提案とその動的解析(領域12ポスターセッション,領域12(ソフトマター物理,化学物理,生物物理)). 日本物理学会講演概要集. 2013. 68. 2. 334-334
  • 新海 創也, 冨樫 祐一. 26aXR-10 エンハンスされた拡散時系列のエネルギー論(26aXR 確率過程・確率モデル1,領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)). 日本物理学会講演概要集. 2013. 68. 1. 322-322
  • 杉山 功敏, 新海 創也, 相澤 洋二. 27aBD-2 非定常写像力学系における無限エルゴード性に由来する異常拡散(27aBD 非平衡定常系(熱・統計力学基礎論を含む),領域11(統計力学,物性基礎論,応用数学,力学,流体物理)). 日本物理学会講演概要集. 2012. 67. 1. 366-366
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講演・口頭発表等 (88件):
  • 細胞の中のゲノムDNA のカタチとウゴキ
    (2024年度バイオメカニクス研究会 2024)
  • 細胞の中のゲノムDNA のカタチとウゴキ
    (2024複雑系研究会 2024)
  • Theory of viscoelasticity of chromatin and its surrounding environment
    (IUPAB2024 2024)
  • 3次元ゲノム構造とクロマチン動態をつなぐ高分子物理学
    (第97回 日本薬理学会年会 2023)
  • Polymer physics of Hi-C data reveals linear viscoelasticity of the 3D physics
    (第61回 日本生物物理学会年会 2023)
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学歴 (2件):
  • 2004 - 2009 早稲田大学 大学院理工学研究科 物理学及応用物理学専攻
  • 2000 - 2004 早稲田大学 理工学部 物理学科
学位 (1件):
  • 博士(理学) (早稲田大学)
経歴 (7件):
  • 2023/04 - 現在 理化学研究所 生命機能科学研究センター 上級研究員
  • 2018/04 - 2023/03 理化学研究所 生命機能科学研究センター 研究員
  • 2017/05 - 2018/03 理化学研究所 生命システム研究センター 研究員
  • 2017/04 - 2017/04 広島大学 理学研究科 研究員
  • 2013/05 - 2017/03 広島大学 クロマチン動態数理研究拠点 特任助教
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受賞 (1件):
  • 2016/06 - CREST「生命動態の理解と制御のための基盤技術の創出」研究領域 第6回数理デザイン道場 最優秀ポスター発表賞
所属学会 (4件):
日本物理学会 ,  BIOPHYSICAL SOCIETY ,  日本分子生物学会 ,  日本生物物理学会
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