研究者
J-GLOBAL ID:201801013210684835
更新日: 2024年05月22日
沖山 佳生
Okiyama Yoshio
所属機関・部署:
研究キーワード (10件):
相互作用解析
, 物理化学
, 量子化学
, 核酸
, タンパク質
, 溶媒効果
, 分子力場
, 分子動力学
, インシリコ創薬
, フラグメント分子軌道法
競争的資金等の研究課題 (2件):
- 2023 - 2026 FMOデータベースを用いた抗原-抗体のPPI相互作用エネルギー予測モデルの構築
- 2015 - 2017 次世代インシリコ創薬のための高解像度相互作用エネルギー空間分割法の開発
論文 (52件):
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Kaori Sakaguchi, Yoshio Okiyama, Shigenori Tanaka. In Silico Search for Drug Candidates Targeting the PAX8-PPARγ Fusion Protein in Thyroid Cancer. International Journal of Molecular Sciences. 2024. 25. 10. 5347-5347
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Hirotomo Moriwaki, Yusuke Kawashima, Chiduru Watanabe, Kikuko Kamisaka, Yoshio Okiyama, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma. FMOe: Preprocessing and visualizing package of the fragment molecular orbital method for Molecular Operating Environment and its applications in covalent ligand and metalloprotein analyses. 2024
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Chiduru Watanabe, Shigenori Tanaka, Yoshio Okiyama, Hitomi Yuki, Tatsuya Ohyama, Kikuko Kamisaka, Daisuke Takaya, Kaori Fukuzawa, Teruki Honma. Quantum Chemical Interaction Analysis between SARS-CoV-2 Main Protease and Ensitrelvir Compared with Its Initial Screening Hit. The Journal of Physical Chemistry Letters. 2023. 14. 15. 3609-3620
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Akiko Ohno, Yoshio Okiyama, Akihiko Hirose, Kiyoshi Fukuhara. The position of the nitro group affects the mutagenicity of nitroarenes. Toxicology and Applied Pharmacology. 2022. 441. 115974-115974
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Shigenori Tanaka, Shusuke Tokutomi, Ryo Hatada, Koji Okuwaki, Kazuki Akisawa, Kaori Fukuzawa, Yuto Komeiji, Yoshio Okiyama, Yuji Mochizuki. Dynamic Cooperativity of Ligand-Residue Interactions Evaluated with the Fragment Molecular Orbital Method. The Journal of Physical Chemistry B. 2021. 125. 24. 6501-6512
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MISC (31件):
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渡邉千鶴, 田中成典, 沖山佳生, 大山達也, 神坂紀久子, 幸瞳, 高谷大輔, 福澤薫, 本間光貴. FMO法を用いたSARS-CoV-2メインプロテアーゼ-阻害薬S-217622結合メカニズムの解明. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2022. 50th (CD-ROM)
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堺大輔, 半田佑磨, 平井優樹, 奥脇弘次, 古石誉之, 米持悦生, 沖山佳生, 田中成典, 福澤薫. FMO法を用いたJAK2とイミダゾピロロピリジン系化合物の結合性および選択性評価. 構造活性相関シンポジウム講演要旨集. 2021. 49th (CD-ROM)
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望月祐志, 望月祐志, 坂倉耕太, 渡邊啓正, 奥脇弘次, 加藤幸一郎, 渡辺尚貴, 沖山佳生, 福澤薫, 福澤薫, et al. FMOプログラムABINIT-MPの整備状況2020. 日本コンピュータ化学会年会講演予稿集. 2020. 2020
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堺大輔, 半田佑磨, 町田大樹, 平井優樹, 奥脇弘次, 沖山佳生, 古石誉之, 福澤薫, 米持悦生. FMO法を用いたJAK2とイミダゾピロロピリジン系化合物の結合性評価. 日本薬学会関東支部大会講演要旨集. 2020. 64th
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山川和也, 飯島洋, 沖山佳生, 古石誉之, 福澤薫, 米持悦生. COMT賦活化における基質認識機構の理論的解析. 日本コンピュータ化学会年会講演予稿集. 2019. 2019
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講演・口頭発表等 (2件):
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フラグメント分子軌道法から古典力場を捉え直す
(第19回創薬インフォマティクス研究会&第11回FMO研究会共催「FMO法に基づいた新規な力場の構築に向けて」 2016)
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FMO計算プログラムABINIT-MPの開発と溶媒効果
(第8回FMO研究会「ナノバイオ分子計算とデザイン」 2014)
学位 (1件):
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