研究者
J-GLOBAL ID:201801013972596054   更新日: 2024年07月29日

甲田 信一

コウダ シンイチ | Koda Shin-ichi
所属機関・部署:
職名: 助教
研究分野 (3件): 基礎物理化学 ,  生物物理学 ,  生物物理、化学物理、ソフトマターの物理
競争的資金等の研究課題 (4件):
  • 2022 - 2025 シアノバクテリア時計タンパク質振動子の出力分子機構の理論的解明
  • 2018 - 2022 時計タンパク質における時空間階層運動の協奏が創る機能発現機構の理論的解明
  • 2013 - 2016 生体分子の構造遍歴ダイナミクスと機能発現の分子機構の理論的解明
  • 2012 - 2013 集光デンドリマーのエネルギー移動機構の階層的非断熱理論による研究
論文 (14件):
  • Shin-ichi Koda, Shinji Saito. A Correlated Flat-bottom Elastic Network Model for Improved Bond Rearrangement in Reaction Paths. 2024
  • Shin-ichi Koda, Shinji Saito. A Flat-bottom Elastic Network Model for Generating Improved Plausible Reaction Paths. ChemRxiv. 2024
  • Shin-ichi Koda, Shinji Saito. Locating Transition States by Variational Reaction Path Optimization with an Energy-Derivative-Free Objective Function. Journal of Chemical Theory and Computation. 2024
  • Yoshihiko Furuike, Atsushi Mukaiyama, Shin-ichi Koda, Damien Simon, Dongyan Ouyang, Kumiko Ito-Miwa, Shinji Saito, Eiki Yamashita, Taeko Nishiwaki-Ohkawa, Kazuki Terauchi, et al. Regulation mechanisms of the dual ATPase in KaiC. Proceedings of the National Academy of Sciences. 2022. 119. 19. e2119627119
  • Shin-ichi Koda, Shinji Saito. Multimeric structure enables the acceleration of KaiB-KaiC complex formation induced by ADP/ATP exchange inhibition. PLOS Computational Biology. 2022. 18. 3. e1009243-e1009243
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学歴 (3件):
  • 2009 - 2015 東京大学 大学院総合文化研究科 広域科学専攻相関基礎科学系
  • 2006 - 2009 東京大学 教養学部 基礎科学科
  • 2004 - 2006 東京大学 教養学部 理科一類
経歴 (4件):
  • 2016/10 - 現在 総合研究大学院大学 助教
  • 2016/08 - 現在 自然科学研究機構 分子科学研究所 助教
  • 2015/04 - 2016/07 自然科学研究機構 分子科学研究所 博士研究員
  • 2012/04 - 2014/03 東京大学 大学院総合文化研究科 日本学術振興会特別研究員DC2
受賞 (2件):
  • 2017/03 - The Journal of Chemical Physics The Journal of Chemical Physics 2016 Editors' Choice Initial-value semiclassical propagators for the Wigner phase space representation: Formulation based on the interpretation of the Moyal equation as a Schrödinger equation.
  • 2013/09 - 分子科学会 第7回分子科学討論会 優秀ポスター賞
所属学会 (3件):
日本生物物理学会 ,  理論化学会 ,  分子科学会
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