- 2022 - 2026 ナラ枯れにおける植物-菌-昆虫3者関係のフェノロジーと樹木の枯死の関係
- 2020 - 2024 森林昆虫の多様性研究の新展開:駆動力としての昆虫関連微生物の存在意義の検証
- 2019 - 2024 鉱山跡地の自生植物と土着微生物を利用した新しい緑化技術の構築
- 2019 - 2023 養菌性キクイムシ随伴Fusarium属菌の生存戦略:樹木病原菌化の条件とは?
- 2018 - 2023 樹木病原菌と養菌性キクイムシの遭遇から協働への源流を探る
- 2019 - 2022 ヒバ漏脂病に対する個体と林分の抵抗性機構の解明
- 2018 - 2021 日本における樹木疫病菌被害の発生リスク評価
- 2016 - 2019 寄生細菌“ボルバキア”によって引き起こされるビロウドカミキリの生殖撹乱現象の解明
- 2015 - 2018 Ash dieback病原菌の起源地周辺での生態、多様性と移入病原菌リスク評価
- 2014 - 2018 漆生成メカニズムに基づく高品質漆の開発
- 2013 - 2018 放射性核種が樹木実生の重金属ストレス耐性に与える影響評価
- 2014 - 2017 開放系森林生態に導入した菌類微生物の動態解明と環境への影響評価
- 2014 - 2017 共生スパイラルに着目した森林昆虫関連微生物の探索とその多様性創出機構の解明
- 2013 - 2016 ナラ枯れにおける防御物質と毒素による樹木と病原菌の相互作用の解明
- 2011 - 2016 養菌性キクイムシが媒介する樹木萎凋病の国際的なリスク評価に必要な基礎データの収集
- 2012 - 2014 共生生物の多様性は大発生を回避させるか、助長するか?
- 2012 - 2014 バイオインサイジング可能な微生物の探索
- 2011 - 2014 ニレ類立枯病の日本における被害発生リスク評価
- 2011 - 2013 樹皮内生菌における宿主樹木の後天的防御機構への貢献に関する研究
- 2010 - 2012 共生系を基本単位とする微生物多様性の保全
- 2008 - 2011 菌類と共生する昆虫の生態解明とそのリスク評価:害虫化の根源を探るための日米間比較
- 2009 - 2010 微生物多様性のキーストーンを探す
- 2008 - 2010 博物館を介したボランティア参加型菌類相調査
- 2008 - 2010 媒介昆虫と病原菌の遺伝的変異と病原性の変異からナラ枯れの起源に迫る
- 2007 - 2009 虫えいを侵入門戸とする樹木病原菌の感染機構の解明
- 2006 - 2007 菌類の"匂い"の適応の意義の解明
- 2005 - 2007 地域間DNA多型解析によるナラ枯れの媒介者カシノナガキクイムシの外来種仮説の検証
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