笠原雅弘

カサハラマサヒロ | Kasahara Masahiro

所属機関・部署：
職名：准教授

研究分野 (1件)：ゲノム生物学

研究キーワード (5件)：ゲノムアセンブリ , ハイパフォーマンスサイエンス , ゲノム情報学 , アルゴリズム , ゲノム

競争的資金等の研究課題 (11件)：

2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
2020 - 2023 不揮発メモリーを用いたゲノム情報学の新展開
2020 - 2023 植物の巨大なゲノムを解読・解析する手法
2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
2016 - 2019 大規模ゲノム情報解析を加速する並列計算システム

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論文 (31件)：

Takeshi Fujino, Katsushi Yamaguchi, Toshiyuki T. Yokoyama, Toshiya Hamanaka, Yoritaka Harazono, Hiroaki Kamada, Wataru Kobayashi, Tokuko Ujino-Ihara, Kentaro Uchiyama, Asako Matsumoto, et al. A chromosome-level genome assembly of a model conifer plant, the Japanese cedar, Cryptomeria japonica D. Don. BMC Genomics. 2024. 25. 1
Junji Konuma, Tomochika Fujisawa, Tomoaki Nishiyama, Masahiro Kasahara, Tomoko F Shibata, Masafumi Nozawa, Shuji Shigenobu, Atsushi Toyoda, Mitsuyasu Hasebe, Teiji Sota. Odd-Paired is Involved in Morphological Divergence of Snail-Feeding Beetles. Molecular Biology and Evolution. 2024. 41. msae110-msae110
Ryosuke Sato, Yoshihiko Nanasato, Naoki Takata, Soichiro Nagano, Eitaro Fukatsu, Takeshi Fujino, Katushi Yamaguchi, Yoshinari Moriguchi, Shuji Shigenobu, Yutaka Suzuki, et al. Efficient selection of a biallelic and nonchimeric gene-edited tree using Oxford Nanopore Technologies sequencing. Tree Physiology. 2023
Akiko Satake, Ryosuke Imai, Takeshi Fujino, Sou Tomimoto, Kayoko Ohta, Mohammad Na’iem, Sapto Indrioko, Widiyatno, Susilo Purnomo, Almudena Mollá-Morales, et al. Somatic mutation rates scale with time not growth rate in long-lived tropical trees. eLife. 2023
Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, et al. A single-nucleotide substitution of CjTKPR1 determines pollen production in the gymnosperm plant Cryptomeria japonica. PNAS nexus. 2023. 2. 8. pgad236

MISC (23件)：

藤野健, 山口勝司, 横山稔之, 濵中俊哉, 原薗陛正, 鎌田寛彬, 小林航, 伊原徳子, 内山憲太郎, 松本麻子, et al. スギ (Cryptomeria japonica D. Don) の全ゲノム配列の決定. 日本森林学会大会発表データベース. 2023. 134. 371
清水佳奈, 坂本一憲, 笠原雅弘. アルゴリズムの頂が持つ力はいかに? -ゲノコン2021 開催記録-. 情報処理. 2022. 63. 7. none
角井宏行, 伊原徳子, 長谷川陽一, 釣崎恵里子, 二村典宏, 岩井淳治, 樋口有未, 藤野健, 鈴木穣, 笠原雅弘, et al. 無花粉スギMS4の原因はCjTKPR1の1塩基置換変異である. 育種学研究. 2022. 24
横山稔之, 坂本祥駿, 関真秀, 鈴木穣, 笠原雅弘. ゲノム構造の差異を可視化するグラフゲノムブラウザ. 可視化情報学会誌. 2020. 40. 156
笠原雅弘. スギゲノムの解読と解析. 京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム研究成果報告書. 2019. 2018. 83-83

書籍 (1件)：

Large-scale genome sequence processing
Imperial College Press, Distributed by World Scientific 2006 ISBN:9781860946356

講演・口頭発表等 (9件)：

分離集団の薄いショットガンシーケンシングによるシャジクモ遺伝学的地図の構築
(日本植物分類学会大会研究発表要旨集 2018)
ロングリードによるヒトゲノム構造多型検出に向けて
(日本生化学会大会(Web) 2017)
グラフゲノムブラウザ
(日本生化学会大会(Web) 2017)
カイコの雄化誘導遺伝子Mascの進化に迫る
(日本応用動物昆虫学会大会講演要旨 2016)
1分子シークエンシングによる非モデル生物の新規ゲノム解析
(日本動物学会大会予稿集 2014)

学位 (1件)：

博士(科学) (東京大学)

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