研究者
J-GLOBAL ID:201801016994455127   更新日: 2024年03月06日

笠原 雅弘

カサハラ マサヒロ | Kasahara Masahiro
所属機関・部署:
職名: 准教授
研究分野 (1件): ゲノム生物学
研究キーワード (5件): ゲノムアセンブリ ,  ハイパフォーマンスサイエンス ,  ゲノム情報学 ,  アルゴリズム ,  ゲノム
競争的資金等の研究課題 (11件):
  • 2022 - 2028 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2020 - 2023 不揮発メモリーを用いたゲノム情報学の新展開
  • 2020 - 2023 植物の巨大なゲノムを解読・解析する手法
  • 2016 - 2021 先進ゲノム解析研究推進プラットフォーム
  • 2016 - 2019 大規模ゲノム情報解析を加速する並列計算システム
全件表示
論文 (30件):
  • Ryosuke Sato, Yoshihiko Nanasato, Naoki Takata, Soichiro Nagano, Eitaro Fukatsu, Takeshi Fujino, Katushi Yamaguchi, Yoshinari Moriguchi, Shuji Shigenobu, Yutaka Suzuki, et al. Efficient selection of a biallelic and nonchimeric gene-edited tree using Oxford Nanopore Technologies sequencing. Tree Physiology. 2023
  • Akiko Satake, Ryosuke Imai, Takeshi Fujino, Sou Tomimoto, Kayoko Ohta, Mohammad Na’iem, Sapto Indrioko, Widiyatno, Susilo Purnomo, Almudena Mollá-Morales, et al. Somatic mutation rates scale with time not growth rate in long-lived tropical trees. eLife. 2023
  • Hiroyuki Kakui, Tokuko Ujino-Ihara, Yoichi Hasegawa, Eriko Tsurisaki, Norihiro Futamura, Junji Iwai, Yuumi Higuchi, Takeshi Fujino, Yutaka Suzuki, Masahiro Kasahara, et al. A single-nucleotide substitution of CjTKPR1 determines pollen production in the gymnosperm plant Cryptomeria japonica. PNAS nexus. 2023. 2. 8. pgad236
  • Ryosuke Imai, Takeshi Fujino, Sou Tomimoto, Kayoko Ohta, Mohammad Na’iem, Sapto Indrioko, Widiyatno, Susilo Purnomo, Almudena Mollá-Morales, Viktoria Nizhynska, et al. The molecular clock in long-lived tropical trees is independent of growth rate. 2023
  • Hiroyuki Sekimoto, Ayumi Komiya, Natsumi Tsuyuki, Junko Kawai, Naho Kanda, Ryo Ootsuki, Yutaka Suzuki, Atsushi Toyoda, Asao Fujiyama, Masahiro Kasahara, et al. A divergent RWP-RK transcription factor determines mating type in heterothallic Closterium. New Phytologist. 2023
もっと見る
MISC (23件):
  • 藤野 健, 山口 勝司, 横山 稔之, 濵中 俊哉, 原薗 陛正, 鎌田 寛彬, 小林 航, 伊原 徳子, 内山 憲太郎, 松本 麻子, et al. スギ (Cryptomeria japonica D. Don) の全ゲノム配列の決定. 日本森林学会大会発表データベース. 2023. 134. 371
  • 清水 佳奈, 坂本 一憲, 笠原 雅弘. アルゴリズムの頂が持つ力はいかに? -ゲノコン2021 開催記録-. 情報処理. 2022. 63. 7. none
  • 角井宏行, 伊原徳子, 長谷川陽一, 釣崎恵里子, 二村典宏, 岩井淳治, 樋口有未, 藤野健, 鈴木穣, 笠原雅弘, et al. 無花粉スギMS4の原因はCjTKPR1の1塩基置換変異である. 育種学研究. 2022. 24
  • 横山稔之, 坂本祥駿, 関真秀, 鈴木穣, 笠原雅弘. ゲノム構造の差異を可視化するグラフゲノムブラウザ. 可視化情報学会誌. 2020. 40. 156
  • 笠原 雅弘. スギゲノムの解読と解析. 京都大学化学研究所スーパーコンピュータシステム研究成果報告書. 2019. 2018. 83-83
もっと見る
書籍 (1件):
  • Large-scale genome sequence processing
    Imperial College Press, Distributed by World Scientific 2006 ISBN:9781860946356
講演・口頭発表等 (9件):
  • 分離集団の薄いショットガンシーケンシングによるシャジクモ遺伝学的地図の構築
    (日本植物分類学会大会研究発表要旨集 2018)
  • ロングリードによるヒトゲノム構造多型検出に向けて
    (日本生化学会大会(Web) 2017)
  • グラフゲノムブラウザ
    (日本生化学会大会(Web) 2017)
  • カイコの雄化誘導遺伝子Mascの進化に迫る
    (日本応用動物昆虫学会大会講演要旨 2016)
  • 1分子シークエンシングによる非モデル生物の新規ゲノム解析
    (日本動物学会大会予稿集 2014)
もっと見る
学位 (1件):
  • 博士(科学) (東京大学)
※ J-GLOBALの研究者情報は、researchmapの登録情報に基づき表示しています。 登録・更新については、こちらをご覧ください。

前のページに戻る