- 2024 - 2028 MD計算と機械学習による高速AFM像中のタンパク質の状態解析
- 2023 - 2026 生体分子シミュレータを基にした大規模推論システムの開発と応用
- 2024 - 2025 超並列分子シミュレーションによる膜タンパ ク質の構造機能動態解析
- 2021 - 2024 メガダルトン生命機能深化ダイナミクス
- 2021 - 2024 ベイズ統計学を組み入れた次世代構造モデリングプラットフォームの構築と応用
- 2021 - 2022 拡張アンサンブル法による生体分子動態の解析
- 2019 - 2022 連成解析によるクライオ電顕構造モデリング法の開発
- 2020 - 2021 分子動力学シミュレーションに基づく遺伝情報転写機構の解明
- 2019 - 2020 分子動力学計算によるRNAポリメラーゼII複合体の動態解析
- 2018 - 2020 High-resolution structure prediction of flexible proteins by multiple cryo-EM data fitting
- 2015 - 2018 多量体型イオンチャネルのゲーティング原理の解明
- 2016 - 2017 プロトン透過が関与する膜タンパク質の動作原理の解明
- 2015 - 2016 拡張アンサンブルシミュレーションによる膜輸送体の動作原理の解明
- 2014 - 2015 多自由度複雑系の自由エネルギー解析へ向けた分子シミュレーション法の開発
- 2014 - 2015 表面張力レプリカ交換法による生体膜構造の分子ダイナミクス解析
- 2012 - 2014 分子動力学シミュレーションによる膜タンパク質の機能・ダイナミクス解析
- 2011 - 2012 膜タンパク質-脂質二重膜複合体の構造モデリング法の開発
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