山口拓実

ヤマグチタクミ | Takumi Yamaguchi

所属機関・部署：
職名：准教授
ホームページURL (1件)： http://www.jaist.ac.jp/ms/labs/t-yamaguchi/

研究分野 (4件)：生物分子化学 , 生体化学 , 生物有機化学 , 構造有機化学、物理有機化学

研究キーワード (5件)：分子シミュレーション , 糖鎖 , 分子認識 , NMR , 超分子化学

競争的資金等の研究課題 (12件)：

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論文 (55件)：

Supaphorn Seetaha, Nuntaporn Kamonsutthipaijit, Maho Yagi-Utsumi, Yanaka Seako, Takumi Yamaguchi, Supa Hannongbua, Koichi Kato, Kiattawee Choowongkomon. Biophysical Characterization of p51 and p66 Monomers of HIV-1 Reverse Transcriptase with Their Inhibitors. The protein journal. 2023
Hiroaki Tatsuoka, Takumi Yamaguchi. NMR Analyses of CarbohydrateWater and WaterWater Interactions in Water/DMSO Mixed Solvents, Highlighting Various Hydration Behaviors of Monosaccharides Glucose, Galactose and Mannose. Bulletin of the Chemical Society of Japan. 2023. 96. 2. 168-174
Shinnosuke Horiuchi, Takumi Yamaguchi, Jacopo Tessarolo, Hirotaka Tanaka, Eri Sakuda, Yasuhiro Arikawa, Eric Meggers, Guido H. Clever, Keisuke Umakoshi. Symmetry-breaking host-guest assembly in a hydrogen-bonded supramolecular system. Nature Communications. 2023. 14. 1
Yoshiki Yamaguchi, Takumi Yamaguchi, Koichi Kato. Structural Analysis of Oligosaccharides and Glycoconjugates Using NMR. Advances in Neurobiology. 2023. 163-184
Koichi Kato, Takumi Yamaguchi, Maho Yagi-Utsumi. Experimental and computational characterization of dynamic biomolecular interaction systems involving glycolipid glycans. Glycoconjugate Journal. 2022

MISC (18件)：

加藤晃一, 山口拓実. 糖鎖の動的構造解析. 糖鎖生物学. 2020. 109-110
中根健汰, 鈴木達哉, 谷中冴子, 加藤晃一, 山口拓実. 動的相互作用機構解析に基づいたレクチン高親和性糖鎖の設計. 日本化学会春季年会講演予稿集(CD-ROM). 2019. 99th
谷中冴子, 谷中冴子, 谷中冴子, 谷中冴子, 與語理那, 與語理那, 與語理那, 矢木宏和, 伊藤暁, 伊藤暁, et al. IgGのフコシル化によるFcのダイナミクスの変化がFcγ受容体との相互作用に及ぼす影響. 日本細胞生物学会大会(Web). 2019. 71st
鈴木達哉, 鈴木達哉, 谷中冴子, 谷中冴子, 渡邉東紀男, YAN Gengwei, 佐藤匡史, 矢木宏和, 山口拓実, 加藤晃一, et al. 未結合状態の糖鎖のコンフォメーション空間の改変によるレクチン親和性の向上. 日本糖質学会年会要旨集. 2019. 38th
山口拓実, 山口拓実, 鈴木達哉, 龍岡博亮, 谷中冴子, 矢木宏和, 佐藤匡史, 加藤晃一, 加藤晃一. 糖鎖コンフォメーション空間の改変による糖-タンパク質間相互作用の制御. ホスト-ゲスト・超分子化学シンポジウム講演要旨集. 2019. 17th

特許 (1件)：

書籍 (6件)：

分子シミュレーションによる糖鎖の3次元構造の動態予測, タンパク質の構造解析手法とIn silicoスクリーニングへの応用事例
技術情報協会 2023 ISBN:9784861049712
糖鎖解析技術:核磁気共鳴(NMR)法, 糖質分析
2019
NMR characterization of the conformations, dynamics, and interactions of glycosphingolipids in NMR in Glycoscience and Glycotechnology
RSC Publishing (Cambridge) 2017
NMR Characterization of the Dynamic Conformations of Oligosaccharides in Modern Magnetic Resonance
Springer, pp 737-754, 2018 2017
NMR explorations of biomolecular systems with rapid conformational exchanges in Molecular Science of Fluctuations toward Biological Functions
Springer 2016

講演・口頭発表等 (21件)：

分子シミュレーションとクラスター分析を用いた高マンノース型糖鎖の動的立体構造解析
(第42回日本糖質学会年会 2023)
Description of the dynamic conformation of oligosaccharides by combining NMR spectroscopy and molecular simulation
(第60回日本生物物理学会年会 2022)
オリゴ糖鎖の立体構造・ダイナミクスの解析と制御
(第22回若手NMR研究会 2022)
Comprehensive characterization of oligosaccharide dynamical conformations by a kernel method in conjunction with graph theoretical techniques
(Pacifichem 2021 2021)
常磁性NMR計測を活用した糖鎖の動的立体構造解析法の開発
(第38回日本糖質学会年会 2019)

学歴 (2件)：

学位 (1件)：

経歴 (2件)：

受賞 (4件)：

所属学会 (3件)：

日本核磁気共鳴学会 , 日本糖質学会 , 日本化学会

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山口 拓実