研究者
J-GLOBAL ID:201801020154089925   更新日: 2024年11月05日

石谷 孔司

イシヤ コウジ | Ishiya Koji
所属機関・部署:
職名: 助教
研究分野 (4件): 生命、健康、医療情報学 ,  進化生物学 ,  ゲノム生物学 ,  応用人類学
研究キーワード (9件): バイオインフォマティクス ,  ゲノミクス ,  メタゲノム ,  古代ゲノム ,  集団遺伝 ,  進化系統解析 ,  ソフトウェア開発 ,  機械学習 ,  進化
競争的資金等の研究課題 (10件):
  • 2024 - 2026 生物考古情報の復元に向けたパレオメタゲノミクス技術の開発
  • 2021 - 2026 半定住狩猟採集民の社会組織と葬制:骨考古学先端技術との連携による先史社会の復元
  • 2023 - 2026 メタゲノムを利用した試料属性推定システムの構築
  • 2020 - 2025 パレオゲノミクス解析プラットフォーム開発とその応用
  • 2021 - 2024 シン・パレオゲノミクスが創る博物館資料群活用の新展開
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論文 (23件):
  • Koji Ishiya, Fuzuki Mizuno, Jun Gojobori, Masahiko Kumagai, Yasuhiro Taniguchi, Osamu Kondo, Masami Matsushita, Takayuki Matsushita, Li Wang, Kunihiko Kurosaki, et al. High-coverage genome sequencing of Yayoi and Jomon individuals shed light on prehistoric human population history in East Eurasian. bioRχiv. 2024
  • Rikako Sato, Harutake Yamazaki, Kazuki Mori, Sachiyo Aburatani, Koji Ishiya, Yosuke Shida, Wataru Ogasawara, Kosuke Tashiro, Satoru Kuhara, Hiroaki Takaku. Identification and characterization of the suppressed lipid accumulation-related gene, SLA1, in the oleaginous yeast Lipomyces starkeyi. Bioscience, Biotechnology, and Biochemistry. 2024
  • 石谷孔司. バイオインフォマティクスによるバイオものづくり -情報科学が加速するバイオものづくりの新展開. 化学と工業. 2024. 77. 4. 281-283
  • Koji Ishiya, Takeaki Taniguchi. Recognition of differential culture conditions with dimensional reduction approach. Journal of Physics: Conference Series. 2024. 2701. 1. 012139-012139
  • Fuzuki Mizuno, Fuyuki Tokanai, Masahiko Kumagai, Koji Ishiya, Saburo Sugiyama, Michiko Hayashi, Kunihiko Kurosaki, Shintaroh Ueda. Bioarchaeological study of ancient Teotihuacans based on complete mitochondrial genome sequences and diet isotopes. Annals of human biology. 2023. 50. 1. 390-398
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MISC (1件):
  • 岩崎理紗, 石谷孔司, 神澤秀明, 河合洋介, 五條堀淳, 颯田葉子. diffuse typeの胃がんのリスクアレルが日本人で高頻度に至った進化的要因の解明. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2020. 22nd
特許 (1件):
講演・口頭発表等 (22件):
  • 考古試料からの 網羅的なパレオメタゲノム評価技術の開発
    (日本微生物生態学会第37回広島大会 2024)
  • Human biological sex determination using X/Y-linked k-mer signatures
    (1st Asia & Pacific Bioinformatics Joint Conference (APBJC2024) 2024)
  • パレオゲノミクス解析プラットフォーム: 効率化とオンサイト解析の実現に向けて
    (第78回日本人類学会大会 2024)
  • Application of Latent Semantic Analysis to Metagenomic Data
    (the 23rd European Conference on Computational Biology 2024)
  • Recognition of differential culture conditions with dimensional reduction approach
    (12th International Conference on Mathematical Modeling in Physical Sciences 2023)
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Works (2件):
  • MitoIMP
    石谷 孔司 2019 -
  • MitoSuite
    石谷 孔司 2017 -
学歴 (1件):
  • 2015 - 2018 東京大学大学院 理学系研究科生物科学専攻 博士課程
学位 (1件):
  • 理学(博士) (東京大学)
経歴 (8件):
  • 2024/07 - 現在 金沢大学 サピエンス進化医学研究センター 助教
  • 2021/06 - 現在 金沢大学 古代文明・文化資源学研究所 客員研究員
  • 2023/10 - 2024/06 国立研究開発法人産業技術総合研究所 主任研究員
  • 2021/09 - 2024/06 早稲田大学理工学術院 客員講師
  • 2020/04 - 2023/09 国立研究開発法人産業技術総合研究所 研究員
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受賞 (3件):
  • 2022/11 - 日本DNA多型学会 若手研究賞
  • 2017/12 - 日本DNA多型学会 優秀研究賞
  • 2013/03 - 理学部優秀学生賞
所属学会 (5件):
日本DNA多型学会 ,  日本進化学会 ,  日本人類学会 ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  European Society for Evolutionary Biology
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