研究者
J-GLOBAL ID:201801020753773745   更新日: 2024年02月01日

堀之内 貴明

ホリノウチ タカアキ | Horinouchi Takaaki
所属機関・部署:
職名: 主任研究員
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
  • 国立研究開発法人理化学研究所  生命機能科学研究センター   客員研究員
ホームページURL (1件): https://sites.google.com/site/takaakihorinouchi/
研究分野 (3件): その他 ,  バイオ機能応用、バイオプロセス工学 ,  システムゲノム科学
競争的資金等の研究課題 (11件):
  • 2022 - 2025 DIYバイオDX:タンパク質分子進化工学の自律化による「誰でもバイオDX」の実証
  • 2019 - 2024 モデルベース設計を基盤とした指向性進化による高効率細胞プロセス創製の確立と展開
  • 2020 - 2022 実験室進化による代謝アダプテーションの状態遷移ダイナミクスの解析
  • 2019 - 2022 ゲノムスケールモデルを利用した代謝経路律速点の解消による化成品生産技術の開発
  • 2019 - 2022 ゲノム構造変化が適応進化過程に与える影響の解析
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論文 (31件):
  • Yoritaka Harazono, Haruko Shimono, Kikumi Hata, Toutai Mitsuyama, Takaaki Horinouchi. Evaluation of Microplate Handling Accuracy for Applying Robotic Arms in Laboratory Automation. 2024
  • Yuya Arai, Ko Takahashi, Takaaki Horinouchi, Koichi Takahashi, Haruka Ozaki. SAGAS: Simulated annealing and greedy algorithm scheduler for laboratory automation. SLAS technology. 2023
  • Kazuma Uesaka, Hiroya Oka, Ryuji Kato, Kei Kanie, Takaaki Kojima, Hiroshi Tsugawa, Yosuke Toda, Takaaki Horinouchi. Bioinformatics in bioscience and bioengineering: Recent advances, applications, and perspectives. Journal of bioscience and bioengineering. 2022. 134. 5. 363-373
  • Naohiro Motozawa, Takuya Miura, Koji Ochiai, Midori Yamamoto, Takaaki Horinouchi, Taku Tsuzuki, Genki N Kanda, Yosuke Ozawa, Akitaka Tsujikawa, Koichi Takahashi, et al. Automated evaluation of retinal pigment epithelium disease area in eyes with age-related macular degeneration. Scientific reports. 2022. 12. 1. 892-892
  • Ryutaro Kawai, Yoshihiro Toya, Kenta Miyoshi, Manami Murakami, Teppei Niide, Takaaki Horinouchi, Tomoya Maeda, Atsushi Shibai, Chikara Furusawa, Hiroshi Shimizu. Acceleration of target production in co-culture by enhancing intermediate consumption through adaptive laboratory evolution. Biotechnology and bioengineering. 2021. 119. 3. 936-945
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MISC (12件):
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特許 (2件):
書籍 (6件):
  • 未培養微生物研究の最新動向(監修:青柳秀紀)
    シーエムシー出版 2023 ISBN:9784781317328
  • 論文図表を読む作法 : はじめて出会う実験&解析法も正しく解釈! : 生命科学・医学論文をスラスラ読むためのFigure事典
    羊土社 2022 ISBN:9784758122603
  • 実験医学別冊 あなたのラボにAI(人工知能)×ロボットがやってくる ラボ内での全自動実験室進化システムの構築
    羊土社 2017
  • 実験医学別冊 あなたのラボにAI(人工知能)×ロボットがやってくる AI・ロボットコミュニティレポート 生命情報科学若手の会
    羊土社 2017 ISBN:9784758122368
  • 細胞工学別冊 進化の謎をゲノムで解く, “2章 進化の仕組みと原動力をゲノムで探る 適応進化はどのように起こるのか? ~進化実験によるアプローチ~”
    学研メディカル秀潤社 2015 ISBN:9784780909227
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講演・口頭発表等 (61件):
  • ロボット連携システムによるRamDA-seqプロトコルの自動化
    (第46回日本分子生物学会年会 2023)
  • 細胞懸濁におけるピペッティングパラメータの分注機による定量評価
    (第46回日本分子生物学会年会 2023)
  • ロボットでのバイオ実験自動化
    (セラミックスのためのインフォマティクス研究会2023年度機械学習ハンズオン講習会「材料DX Boot Camp」 2023)
  • バイオものづくり分野における様々なスケールのラボオートメーション
    (「マルチモーダルAI技術の多様な材料・プロセス開発への水平展開」講演会 2023)
  • 自動分注ロボットによる細胞懸濁パラメータの定量評価
    (第75回日本生物工学会大会, 2023)
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学歴 (1件):
  • 2006 - 2011 大阪大学大学院 情報科学研究科 バイオ情報工学専攻
学位 (1件):
  • 博士(情報科学) (大阪大学)
経歴 (5件):
  • 2021/08 - 現在 国立研究開発法人理化学研究所 生命システム研究センター 客員研究員
  • 2021/08 - 現在 国立研究開発法人産業技術総合研究所 人工知能研究センター 主任研究員
  • 2018/04 - 2021/07 理化学研究所 生命機能科学研究センター 研究員
  • 2016/04 - 2018/03 理化学研究所 生命システム研究センター 研究員
  • 2011/04 - 2016/03 理化学研究所 生命システム研究センター 特別研究員
委員歴 (8件):
  • 2021 - 現在 Young Asian Biochemical Engineers’ Community YABEC Japan Office, Member
  • 2019/05 - 現在 Laboratory Automation Suppliers' Association 役員・会計監査
  • 2017/04 - 現在 日本生物工学会 バイオインフォマティクス相談部会 代表
  • 2011 - 現在 日本生物工学会 代謝工学研究部会 部会員
  • 2019/04 - 2020/03 生物工学若手研究者の集い 夏のセミナー実行委員
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受賞 (1件):
  • 2022/08 - 日本生物工学会東日本支部 日本生物工学会東日本支部長賞 進化工学とデータ駆動型アプローチによる微生物ストレス耐性の理解と制御
所属学会 (4件):
生命情報科学若手の会 ,  日本分子生物学会 ,  日本生物工学会 ,  Laboratory Automation Suppliers' Association
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