- 2023 - 2027 ステークホルダーの役割分担によるエヒメアヤメ自生地の復元
- 2021 - 2024 コウノトリ野生復帰事業の現状評価と真のワイルドライフマネジメントの提案と実行
- 2020 - 2024 文化的景観の維持管理における保存会組織の役割と指定物件の保全状況に及ぼす効果
- 2016 - 2019 コウノトリ野生復帰の全国展開と生物多様性の保全・再生に関する実践科学的研究
- 2014 - 2018 コウノトリを頂点とする食物網構造の時空間推定-豊岡盆地の景観変遷との関係-
- 2014 - 2018 野外コウノトリの生理学的および病理学的モニタリング手法の開発
- 2012 - 2016 アダプティブ・マネジメントによるコウノトリ野生復帰の研究と実行
- 2010 - 2012 野外および飼育下からなるコウノトリのメタ個体群における遺伝的管理の最適化
- 2007 - 2009 コウノトリはなぜ豊岡盆地で生き残れたのか?-標本と歴史資料が語る生態系のしくみ-
- 2003 - 2005 景観生態学的手法および分子生態学的手法を用いた都市内残存緑地の機能評価
- 2002 - 2004 戦略的環境アセスメントのための地域景観情報の総合化
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