研究者
J-GLOBAL ID：201901000952853789
更新日: 2024年02月01日
八木 清
ヤギ キヨシ | Yagi Kiyoshi
所属機関・部署：
職名：
専任研究員
ホームページURL (1件)：
https://tms.riken.jp/
研究分野 (2件)：
生物物理学
, 基礎物理化学
研究キーワード (10件)：
非調和振動解析
, QM/MM法
, 分子動力学
, 量子化学
, 励起状態ダイナミクス
, 蛍光プローブ
, 高分子材料
, 振動スペクトル
, 金属酵素
, 脂質二重膜
競争的資金等の研究課題 (6件)：
論文 (75件)：
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Shingo Ito, Kiyoshi Yagi, Yuji Sugita. Allosteric regulation of beta-reaction stage I in tryptophan synthase upon the alpha-ligand binding. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS. 2023. 158. 11
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Hiroki Otaki, Shun-ichi Ishiuchi, Masaaki Fujii, Yuji Sugita, Kiyoshi Yagi. Similarity scores of vibrational spectra reveal the atomistic structure of pentapeptides in multiple basins. ChemRxiv. 2023. 10.26434/chemrxiv-2023-qn9rc
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Kenjiro Hanaoka, Shimpei Iwaki, Kiyoshi Yagi, Takuya Myochin, Takayuki Ikeno, Hisashi Ohno, Eita Sasaki, Toru Komatsu, Tasuku Ueno, Motokazu Uchigashima, et al. General Design Strategy to Precisely Control the Emission of Fluorophores via a Twisted Intramolecular Charge Transfer (TICT) Process. Journal of the American Chemical Society. 2022. 144. 43. 19778-19790
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Shingo Ito, Kiyoshi Yagi, Yuji Sugita. Computational Analysis on the Allostery of Tryptophan Synthase: Relationship between alpha/beta-Ligand Binding and Distal Domain Closure. JOURNAL OF PHYSICAL CHEMISTRY B. 2022. 126. 17. 3300-3308
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八木清. 量子化学と分子動力学の融合が拓く高分子の分子機能解析. 溶液化学研究会誌. 2022
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MISC (5件)：
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城田 幸一郎, 八木 清, 杉田 有治, 小林 俊秀. 脂質分子クラスターをラマン分光と計算化学でみる. 液晶 : 日本液晶学会誌 : journal of the Japanese Liquid Crystal Society. 2018. 22. 3. 184-191
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Kiyoshi Yagi, Pai-Chi Li, Koichiro Shirota, Toshihide Kobayashi, Yuji Sugita. Statistically weight averaged vibrational spectrum over molecular fragments for studying the amide I vibration of sphingomyelin bilayer. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 2015. 249
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Bo Thomsen, Kiyoshi Yagi, Yuji Sugita. Calculating the infrared spectra of the eigenion using anharmonic vibrational theory. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 2015. 249
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So Hirata, Olaseni Sode, Murat Keeli, Kiyoshi Yagi, Jinjin Li. Response to "Comment on 'Fermi resonance in solid CO2 under pressure'" [J. Chem. Phys. 140, 177101 (2014)]. JOURNAL OF CHEMICAL PHYSICS. 2014. 140. 17
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So Hirata, Olaseni Sode, Murat Keceli, Kiyoshi Yagi. Predictive chemical computing in condensed phases. ABSTRACTS OF PAPERS OF THE AMERICAN CHEMICAL SOCIETY. 2009. 237
学歴 (3件)：
- 2001 - 2004 東京大学 工学系研究科 応用化学専攻 博士課程修了
- 1999 - 2001 東京大学 工学系研究科 応用化学専攻 修士課程修了
- 1995 - 1999 東京大学 工学部 応用化学科
学位 (1件)：
経歴 (6件)：
受賞 (2件)：
- 2022/03 - 理化学研究所 理研栄峰賞 「富岳」に最適化された GENESIS の開発と公開、およびSARS-Cov-2 スパイクタンパク質の MD シミュレーション」
- 2015/09 - 分子科学会 奨励賞 非調和性を考慮した分子振動状態理論の開発と応用
所属学会 (7件)：
日本生物物理学会
, 理論化学会
, 日本蛋白質科学会
, 日本分光学会
, 分子科学会
, アメリカ化学会
, 日本化学会
