- 2022 - 2028 種間相互作用リプログラミングで生態系の進化と機能を操る
- 2023 - 2027 見過ごされてきた都会の微生物進化:都市化が微生物を介して自然環境に与える影響
- 2022 - 2025 酵素配列固定グラフェン複合構造の開発及び環境リスク削減への応用
- 2021 - 2024 低栄養細菌-マンガン酸化細菌培養系による有機物無添加の坑廃水処理技術の開拓
- 2021 - 2024 酸性極限環境におけるバイオフィルム樹状構造化の謎とその金属元素循環への影響の解明
- 2020 - 2023 活性汚泥の固体物性が微生物種間相互作用に与える影響の解明とその人為的な改質の試み
- 2019 - 2023 バクテリアを食べるバクテリアを用いた生態系再編成:生態系機能制御への挑戦
- 2020 - 2021 地産地消型エネルギー循環システム構築を目指した脂質高含有廃棄物からの長期安定的エネルギー回収法の開発
- 2017 - 2020 活性汚泥というブラックボックスの解剖と再構築:遺伝子発現から群中の個の挙動を見る
- 2014 - 2017 環境浄化と微生物代謝学の再考:シンプルな代謝設計でCO2からの有価物生産に挑む
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