- 2023 - 2027 検出誤差に対して頑健な環境DNAメタバーコーディングの進展
- 2021 - 2025 河川水生昆虫の高信頼性DNAリファレンス整備による環境DNAを用いた金属影響評価
- 2021 - 2024 堆積物中における水生植物の埋土種子の種多様性評価と生育可能性を考慮した保全地選択
- 2020 - 2023 環境DNA分析による検出誤差を踏まえた種多様性評価手法の開発と検証
- 2018 - 2023 環境DNAを用いた回遊性魚類の移動経路の回復と生息地復元に基づく流域生態系の再生
- 2015 - 2019 次世代型生態系観測技術の確立と湖沼生態系への適用
- 2015 - 2018 景観遺伝学に基づく草地性昆虫類の生息地ネットワーク評価とその体系的保全研究
- 2012 - 2016 DNAバーコーディングを適用したユスリカ科昆虫の水質指標性と多様性の研究
- 2011 - 2013 コスモポリタンを使った種の壁の操作実験
- 2006 - 2008 アジア産ヒラタクワガタにおける形態形質変異の遺伝的基盤および種分化機構の解明
- 2000 - 2002 アズキゾウムシに寄生する利己的遺伝因子Wolbachiaの感染動態と共進化の解明
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