研究者
J-GLOBAL ID:201901011746598898
更新日: 2024年09月19日
境 祐二
サカイ ユウジ | Sakai Yuji
所属機関・部署:
職名:
特任准教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (2件):
-
東京大学
大学院医学系研究科
客員研究員
-
特定国立研究開発法人理化学研究所
数理創造プログラム
客員研究員
研究分野 (4件):
細胞生物学
, 生物物理学
, 遺伝学
, 生物物理、化学物理、ソフトマターの物理
研究キーワード (8件):
理論生物学
, 生物物理学
, 細胞生物学
, 分子生物学
, ソフトマター物理学
, オルガネラ
, 染色体
, オートファジー
競争的資金等の研究課題 (9件):
- 2024 - 2028 フェリチン液滴オートファジーの分子メカニズムの総合的理解
- 2023 - 2027 オートファジー膜ダイナミクスの理論的解明
- 2023 - 2025 細胞内分解機構の理論的解明
- 2023 - 2024 分子動力学計算を用いた細胞内脂質輸送機構の解明
- 2020 - 2023 分裂期染色体形成ダイナミクスの理論的解明
- 2018 - 2020 数理手法を用いたオートファジー・ダイナミクスの解明
- 2018 - 2020 数理手法を用いた分裂期染色体ダイナミクスの解明
- 2013 - 2018 植物個体発生を支える代謝ネットワークの解明
- 2009 - 2011 信頼性の高い有効模型によるQCD相構造の定量的解明
全件表示
論文 (47件):
-
Kayo Hibino, Yuji Sakai, Sachiko Tamura, Masatoshi Takagi, Katsuhiko Minami, Toyoaki Natsume, Masa A Shimazoe, Masato T Kanemaki, Naoko Imamoto, Kazuhiro Maeshima. Single-nucleosome imaging unveils that condensins and nucleosome-nucleosome interactions differentially constrain chromatin to organize mitotic chromosomes. Nature communications. 2024. 15. 1. 7152-7152
-
Yuji Sakai, Satoru Takahashi, Ikuko Koyama-Honda, Chieko Saito, Noboru Mizushima. Experimental determination and mathematical modeling of standard shapes of forming autophagosomes. Nature communications. 2024. 15. 1. 91-91
-
Tetsuya Kotani, Yuji Sakai, Hiromi Kirisako, Chika Kakuta, Soichiro Kakuta, Yoshinori Ohsumi, Hitoshi Nakatogawa. A mechanism that ensures non-selective cytoplasm degradation by autophagy. Nature Communications. 2023. 14. 1. 5815-5815
-
Zi Yang, Saori R. Yoshii, Yuji Sakai, Haruka Chino, Roland L. Knorr, Noboru Mizushima. Autophagy adaptors mediate Parkin-dependent mitophagy by forming sheet-like liquid condensates. 2023
-
Saori Shinoda, Yuji Sakai, Takahide Matsui, Masaaki Uematsu, Ikuko Koyama-Honda, Jun-ichi Sakamaki, Hayashi Yamamoto, Noboru Mizushima. Syntaxin 17 recruitment to mature autophagosomes is temporally regulated by PI4P accumulation. eLife. 2023
もっと見る
MISC (59件):
-
堀江(川俣)朋子, 境祐二, 野田展生, 大隅良典. 液胞で働くメンブレンアーゼをロック/アンロックするために. 脂質生化学研究. 2024. 66
-
山本渓一, 境祐二, 望月敦史. 魚類の網膜における錐体モザイク形成に関する力学モデルを用いた考察. 日本数理生物学会年会(Web). 2023. 2023
-
小山(本田)郁子, 境祐二, 高橋暁, 高橋暁, 齊藤知恵子, 立川正志, 水島昇. マクロオートファジーにおける細胞質ゾーニング. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
-
境祐二, 境祐二, 高橋暁, 本田郁子, 齊藤知恵子, 水島昇. 未閉鎖オートファゴソームの標準形態の実験的決定と理論モデル. 日本生化学会大会(Web). 2023. 96th
-
日比野佳代, 日比野佳代, 日比野佳代, 境祐二, 鐘巻将人, 鐘巻将人, 前島一博, 前島一博. ヒト染色体凝縮過程の単一ヌクレオソームイメージング. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2022. 94th (CD-ROM)
もっと見る
講演・口頭発表等 (26件):
-
Modeling mitotic chromatin dynamics
(遺伝研研究会「第2回ゲノムモデリング研究会」 2024)
-
Experimental determination and theoretical model of standard shapes of forming autophagosomes
(ICBP 2023 - International Conference on Biological Physics 2023)
-
Molecular dynamics of autophagosomal lipid transfer Atg2
(CCP2023 - 34th IUPAP Conference on Computational Physics 2023)
-
オートファゴソーム形成の数理モデル
(ERATO 水島細胞内分解ダイナミクスプロジェクト 最終シンポジウム「細胞内分解研究の未来を拓く」 2023)
-
分裂期染色体形成の数理モデル
(第75回日本細胞生物学会大会 2023)
もっと見る
学歴 (1件):
- 2007 - 2012 九州大学大学院 理学系研究科 物理学専攻
学位 (1件):
経歴 (8件):
- 2024/05 - 現在 横浜市立大学 理学部 理学科 生命ナノシステム科学研究科 物質システム科学専攻 特任准教授
- 2022/04 - 2024/03 京都大学 医生物学研究所 特定准教授
- 2017/04 - 2022/03 東京大学 大学院医学系研究科 助教
- 2014/04 - 2022/03 成蹊大学 理工学部 非常勤講師
- 2015/04 - 2017/03 特定国立研究開発法人理化学研究所 理論科学連携研究推進グループ 特別研究員
- 2014/04 - 2016/03 特定国立研究開発法人理化学研究所 理論生物学研究室 特別研究員
- 2012/04 - 2014/03 特定国立研究開発法人理化学研究所 仁科加速器研究センター 基礎科学特別研究員
- 2009/04 - 2012/03 九州大学 大学院理学研究院 物理学部門 日本学術振興会特別研究員(DC1)
全件表示
前のページに戻る