小形公亮

オガタコウスケ | Ogata Kosuke

所属機関・部署：
職名：助教

研究分野 (1件)：ゲノム生物学

研究キーワード (4件)：タンパク質リン酸化 , 液体クロマトグラフィー , 質量分析 , プロテオミクス

競争的資金等の研究課題 (6件)：

2023 - 2026 リン酸化修飾タンパク質構造ダイナミクスの包括的解析
2023 - 2025 生体試料中プロテオフォームの一斉計測システムの開発
2020 - 2024 天然ステルスエキソソームの解析とデリバリーキャリア開発への応用
2024 - 血中タンパク質の質的異常の包括的検出法の開発
2022 - 2023 Host determinants of innate immunity and viral infection under hypoxia

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論文 (16件)：

Taylor Battellino, Darien Yeung, Haley Neustaeter, Vic Spicer, Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama, Oleg V. Krokhin. Retention time prediction for post-translationally modified peptides: Ser, Thr, Tyr-phosphorylation. Journal of Chromatography A. 2024
Ryota Tomioka, Ayana Tomioka, Kosuke Ogata, Hsin-Ju Chan, Li-Yu Chen, Ulises H. Guzman, Yue Xuan, Jesper V. Olsen, Yu-Ju Chen, Yasushi Ishihama. Extending the Coverage of Lys-C/Trypsin-Based Bottom-up Proteomics by Cysteine S-Aminoethylation. Journal of the American Society for Mass Spectrometry. 2024
Ayana Tomioka, Ryota Tomioka, Issei Mori, Yosuke Isobe, Makoto Arita, Koshi Imami, Eisuke Kanao, Kosuke Ogata, Yasushi Ishihama. One thousand samples per day capillary-flow LC/MS/MS for high-speed, high-sensitivity and in-depth proteomics. 2023
Kosuke Ogata, Shunsuke Takagi, Naoyuki Sugiyama, Yasushi Ishihama. Motif-Targeting Phosphoproteome Analysis of Cancer Cells for Profiling Kinase Inhibitors. Cancers. 2022. 15. 1. 78-78
Taylor Battellino, Kosuke Ogata, Victor Spicer, Yasushi Ishihama, Oleg Krokhin. Acetic Acid Ion Pairing Additive for Reversed-Phase HPLC Improves Detection Sensitivity in Bottom-up Proteomics Compared to Formic Acid. Journal of Proteome Research. 2022. 22. 1. 272-278

MISC (36件)：

Deep profiling of proteome structural changes with enzymatic reactions. HUPO2022. 2022
小形公亮, 石濱泰. カルシウムイオンの添加によるリン酸化タンパク質のトリプシン消化効率の改善. 第45回日本分子生物学会年会. 2022
小形公亮, 石濱泰. 小さなセルの大きな世界-高感度分析技術が照らしだすシングルセルプロテオーム. 化学. 2022. 77. 5
前田朝登, 小形公亮, 杉山直幸, 石濱泰. In vitroリン酸化タグを用いたタンパク質の構造変化検出法の開発. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2022. 142nd
小形公亮, CHANG Chih-Hsiang, YEUNG Darien, SPICER Victor, KROKHIN Oleg, 石濱泰, 石濱泰. イオンモビリティスペクトロメトリーによる新次元ペプチド分離. 質量分析総合討論会講演要旨集. 2022. 70th

講演・口頭発表等 (28件)：

酵素反応による基質選択的サブプロテオーム解析法の開発
(第20回次世代を担う若手のためのフィジカル・ファーマフォーラム(PPF2023) 2023)
Enzyme-based marking of proteome structures (EZMAP) to identify structural features of the proteome
(AOMSC-KSMS 2023 2023)
プロテオームにおける限定的タンパク質消化産物の選択的計測
(第35回バイオメディカル分析科学シンポジウム 2023)
質量分析によるプロテオーム立体構造解析のための酵素反応の開拓
(日本プロテオーム学会 2023年大会 2023)
プロテオーム試料を基質とした酵素反応における基質タンパク質構造の影響
(第71回質量分析総合討論会 2023)

学位 (1件)：

経歴 (2件)：

受賞 (9件)：

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所属学会 (7件)：

ヒトプロテオーム機構 , American Society for Mass Spectrometry , 日本分子生物学会 , 日本質量分析学会 , クロマトグラフィー科学会 , 日本薬学会 , 日本プロテオーム学会

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小形 公亮