研究者
J-GLOBAL ID:202001004641573576   更新日: 2024年09月11日

藤原 豊史

フジワラ トヨフミ | Fujiwara Toyofumi
所属機関・部署:
職名: 特任准教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
研究分野 (2件): 生命、健康、医療情報学 ,  医用システム
研究キーワード (6件): 遺伝性疾患 ,  難病 ,  希少疾患 ,  表現型 ,  AI ,  データベース
競争的資金等の研究課題 (6件):
  • 2024 - 2027 重症新生児に対する迅速なゲノム診断の医療実装に関する研究開発
  • 2023 - 2026 国際共有を前提とした症例情報統合化技術の開発
  • 2022 - 2025 日本語の症例報告への自動アノテーション技術の開発
  • 2021 - 2024 希少・遺伝性疾患の個別化医療および研究推進に向けた症例データベースの構築と公開
  • 2020 - 2023 希少・難治性疾患のゲノム医療推進に資する情報基盤の高度化とその応用
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論文 (16件):
  • 高月 照江, 池田 秀也, 井手 隆広, 大田 達郎, 小野 浩雅, 片山 俊明, 川島 秀一, 申 在紋, 建石 由佳, 千葉 啓和, et al. 統合データベース探索フレームワークTogoDXの開発とその応用. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 池田 秀也, 千葉 啓和, 藤原 豊史, 五斗 進, 井手 隆広, 川島 秀一, 箕輪 真理, 三橋 信孝, 守屋 勇樹, 内藤 雄樹, et al. TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • Yasunori Yamamoto, Toyofumi Fujiwara. Online tools for efficient paper writing. Human Genome Variation. 2022. 9. 1
  • Toyofumi Fujiwara, Jae-Moon Shin, Atsuko Yamaguchi. Advances in the development of PubCaseFinder, including the new application programming interface and matching algorithm. Human Mutation. 2022
  • Atsuko Yamaguchi, Jae-Moon Shin, Toyofumi Fujiwara. Gene Ranking based on Paths from Phenotypes to Genes on Knowledge Graph. The 10th International Joint Conference on Knowledge Graphs. 2021. 131-134
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MISC (16件):
  • 地引 芳乃, 浅野 由衣, 仁宮 洸太, 申 在紋, 佐々木 貴規, 菊池 敦生, 藤原 豊史. 症例情報管理システムの構築と公開. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 仁宮洸太, 櫛田達矢, 高月照江, 菊池敦生, 藤原豊史. 研究から医療までの網羅的な希少疾患関連知識の集約/共有プラットフォーム. 月刊「細胞」. 2021. 53. 13. 834-839
  • 仁宮 洸太, 高月 照江, 菊池 敦生, 櫛田 達矢, 山田 涼太, 浅野 由衣, 山本 泰智, Orion Buske, 片山 俊明, 桝屋 啓志, et al. 日本の難病に関する中心的基盤となる難病オントロジーNANDOと難病ポータルサイトNanbyoDataの正式リリース. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 地引 芳乃, 土肥 栄祐, 仁宮 洸太, 建石 由佳, 山本 泰智, 佐々木 貴規, 藤原 豊史. 診療録からの症状半自動抽出システム「POET」の開発. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 藤原 豊史, 仁宮 洸太. オントロジーを用いた希少・遺伝性疾患診断支援 (特集 人工知能技術の医療応用). 人工知能 : 人工知能学会誌 : journal of the Japanese Society for Artificial Intelligence. 2020. 35. 4. 480-486
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書籍 (4件):
  • 実験医学 2024年1月号 Vol.42 No.1
    羊土社 2024
  • みんなのバイオDX 実験医学 2021年12月号 Vol.39 No.19
    羊土社 2021
  • バリアントデータ検索&活用変異・多型情報を使いこなす達人レシピ 実験医学別冊
    羊土社 2020
  • Precision Medicine 2019年12月臨時増刊号
    北隆館 2019
講演・口頭発表等 (56件):
  • Advancements and prospects of PubCaseFinder, a generic name for three services related to rare and genetic diseases
    (2023 Annual Conference of Korean Society for Bioinformatics 2023)
  • Building of the Nanbyo Disease Ontology (NANDO) and portal site for intractable disease information(NanbyoData)
    (IIBMP 2023 2023)
  • PubCaseFinder: Advancements and Prospects in Rare and Genetic Disease Search Services
    (IIBMP 2023 2023)
  • PubCaseFinder: 希少・遺伝性疾患に特化した症例情報管理システムの開発
    (第30回日本遺伝子診療学会大会 2023)
  • PubCaseFinder CaseSharing: A management system for case information on rare diseases
    (ESHG Conference 2023 2023)
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Works (5件):
  • PanelSearch ー 遺伝子パネルデータ検索システム
    藤原豊史 2023 - 現在
  • CaseSharing ー 症例情報管理システム
    藤原豊史 2023 - 現在
  • NANDO ー 難病オントロジー
    藤原 豊史 2020 -
  • NanbyoData ー 難病情報ポータル
    藤原 豊史 2020 -
  • PubCaseFinder ー 希少・遺伝性疾患検索システム
    藤原 豊史 2017 -
学歴 (1件):
  • 2015 - 2018 東京大学大学院 新領域創成科学研究科 メディカル情報生命専攻
学位 (1件):
  • 博士(医科学) (東京大学)
経歴 (6件):
  • 2024/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 バイオデータ研究拠点 特任准教授
  • 2024/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任准教授
  • 2023/12 - 現在 国立研究開発法人国立国際医療研究センター ゲノム医科学プロジェクト 客員研究員
  • 2023/12 - 2024/03 国立研究開発法人国立精神・神経医療研究センター 疾病研究第三部 客員研究員
  • 2019/04 - 2024/03 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任助教
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受賞 (2件):
  • 2021/10 - 日本人類遺伝学会第66回大会 / 第28回日本遺伝子診療学会大会 大会賞 診療録からの症状半自動抽出システムPOETの開発
  • 2019/10 - American Society of Human Genetics Reviewers' Choice Abstracts PubCaseFinder and PhenoTouch for differential diagnosis in rare disease.
所属学会 (2件):
日本人類遺伝学会 ,  日本遺伝子診療学会
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