飯田緑

飯田緑 | IIDA MIDORI

所属機関・部署：
職名：准教授

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , 水圏生命科学 , 化学物質影響

研究キーワード (6件)：ドラックリポジショニング , 魚類 , ダイオキシン , バイオインフォマティクス , ネットワーク生物学 , 環境毒性学

競争的資金等の研究課題 (16件)：

2022 - 2025 ネットワーク生物学と機械学習によって生物種横断的に化学物質の複合影響を予測する
2021 - 2024 トランスクリプトーム情報と生体分子間相互作用ネットワークを用いた薬剤の組み合わせ効果の予測
2021 - 2022 深層学習により再構築したマダイ固有のインタラクトームを用いた、マダイ幼魚への抗生物質(オキシテトラサイクリン)の影響評価
2020 - 2021 アンプリコン解析用ソフトウェア(CLiCKAR: click to analyze pooled amplicon sequence data using R)の大規模計算機システムでの運用
2020 - 2021 マダイ(Pagrus major)肝臓プロテオームにおける抗生物質の影響評価

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論文 (24件)：

Md Mamunur Rashid, Momoko Hamano, Midori Iida, Michio Iwata, Toshiyuki Ko, Seitaro Nomura, Issei Komuro, Yoshihiro Yamanishi. Network-based identification of diagnosis-specific trans-omic biomarkers via integration of multiple omics data. Biosystems. 2024. 105122-105122
Miyuki Suzuki, Midori Iida, Toshinori Hayashi, Ken-Ichi T Suzuki. CRISPR-Cas9-Based Functional Analysis in Amphibians: Xenopus laevis, Xenopus tropicalis, and Pleurodeles waltl. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2637. 341-357
Midori Iida, Hoa Thanh Nguyen, Fumiya Takahashi, Su-Min Bak, Kazuki Kanda, Hisato Iwata. Effects of exposure to oxytetracycline on the liver proteome of red seabream (Pagrus major) in a real administration scenario. Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology. 2022. 256. 109325-109325
Momoko Hamano, Seitaro Nomura, Midori Iida, Issei Komuro, Yoshihiro Yamanishi. Prediction of single-cell mechanisms for disease progression in hypertrophic remodelling by a trans-omics approach. Scientific Reports. 2021. 11. 1. 8112-8112
Midori Iida, Miyuki Suzuki, Yuto Sakane, Hiroyo Nishide, Ikuo Uchiyama, Takashi Yamamoto, Ken-Ichi T Suzuki, Satoshi Fujii. A simple and practical workflow for genotyping of CRISPR-Cas9-based knockout phenotypes using multiplexed amplicon sequencing. Genes to cells : devoted to molecular & cellular mechanisms. 2020. 25. 7. 498-509

MISC (9件)：

飯田緑, 岩田通夫, 山西芳裕. ネットワーク医学による創薬の実際. 糖尿病と代謝. 2022. 49. 2. 31-34
飯田緑, 山西芳裕. ネットワーク生物学で紐解く化学物質と生体の関係性. 環境ホルモン学会研究発表会プログラム・要旨集. 2021. 23rd (Web)
Nguyen Hoa Thanh, Yamamoto Kimika, Iida Midori, Agusa Tetsuro, Hirano Masashi, Ochiai Mari, Kim Eun-Young, Iwata Hisato. 妊娠中にビスフェノールAに曝露したラットの肝臓トランスクリプトーム分析それらの産仔のトランスクリプトームとの比較(Hepatic transcriptome profiles of rats exposed to bisphenol A during pregnancy: comparison with those oftheir offspring). 環境ホルモン学会研究発表会要旨集. 2017. 20回. 74-74
伊藤匠平, 飯田緑, Nguyen Thanh Hoa, 阿草哲郎, 平野将司, 落合真理, 金恩英, 岩田久人. ビスフェノールAの出生前曝露によるニワトリ新生雛の肝臓トランスクリプトームへの影響の雌雄差. 環境ホルモン学会研究発表会要旨集. 2017. 20回. 68-68
高橋秀尚, 柴田美音, 瀧川一学, 渡部昌, 築山忠維, 山本淳一, 山口雄輝, 藤井聡, 飯田緑, RANJAN Amol, et al. メディエーター複合体による転写終結制御機構. 日本生化学会大会(Web). 2017. 90th. ROMBUNNO.4P2T15-06(3P-0635) (WEB ONLY)-0635)]

書籍 (2件)：

講演・口頭発表等 (38件)：

PREDICTION OF SYNERGISTIC DRUG COMBINATIONS BASED ON INTERACTOME AND TRANSCRIPTOME
(JSPS/INSERM JOINT SCIENTIFIC SEMINAR in 2022 2022)
ネットワーク生物学ベースの薬剤の組み合わせ予測手法の構築
(CBI学会2022年大会 2022)
ネットワーク生物学を用いた化学物質の疾患への影響評価
(令和4 年度日本魚病学会秋季大会 2022)
ネットワーク生物学を用いた化学物質の影響評価と予測
(第49回日本毒性学会 2022)
養殖条件下でのオキシテトラサイクリン曝露によるマダイ(Pagrus major) 肝臓プロテオームへの影響評価
(環境化学物質 3 学会合同大会 2022)

Works (2件)：

click to analyze pooled amplicon sequence data using R (CLiCKAR)
Midori Iida, Miyuki Suzuki, Yuto Sakane, Hiroyo Nishide, Ikuo Uchiyama, Takashi Yamamoto, Ken-Ichi T Suzuki, Satoshi Fujii 2020 - 現在
2020年日本バイオインフォマティクス学会年会大会ポスター

経歴 (5件)：

受賞 (1件)：

所属学会 (1件)：

バイオインフォマティクス学会

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