飯田緑

飯田緑 | IIDA MIDORI

所属機関・部署：
職名：准教授

研究分野 (3件)：生命、健康、医療情報学 , 水圏生命科学 , 化学物質影響

研究キーワード (6件)：ドラックリポジショニング , 魚類 , ダイオキシン , バイオインフォマティクス , ネットワーク生物学 , 環境毒性学

競争的資金等の研究課題 (16件)：

2022 - 2025 ネットワーク生物学と機械学習によって生物種横断的に化学物質の複合影響を予測する
2021 - 2024 トランスクリプトーム情報と生体分子間相互作用ネットワークを用いた薬剤の組み合わせ効果の予測
2021 - 2022 深層学習により再構築したマダイ固有のインタラクトームを用いた、マダイ幼魚への抗生物質(オキシテトラサイクリン)の影響評価
2020 - 2021 アンプリコン解析用ソフトウェア(CLiCKAR: click to analyze pooled amplicon sequence data using R)の大規模計算機システムでの運用
2020 - 2021 マダイ(Pagrus major)肝臓プロテオームにおける抗生物質の影響評価

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論文 (26件)：

Midori Iida, Yurika Kuniki, Kenta Yagi, Mitsuhiro Goda, Satoko Namba, Jun-ichi Takeshita, Ryusuke Sawada, Michio Iwata, Yoshito Zamami, Keisuke Ishizawa, et al. A network-based trans-omics approach for predicting synergistic drug combinations. Communications Medicine. 2024. 4. 1
Kazuhiro Maeda, Masashi Hirano, Taka Hayashi, Midori Iida, Hiroyuki Kurata, Hiroshi Ishibashi. Elucidating Key Characteristics of PFAS Binding to Human Peroxisome Proliferator-Activated Receptor Alpha: An Explainable Machine Learning Approach. Environmental science & technology. 2024. 58. 1. 488-497
Md Mamunur Rashid, Momoko Hamano, Midori Iida, Michio Iwata, Toshiyuki Ko, Seitaro Nomura, Issei Komuro, Yoshihiro Yamanishi. Network-based identification of diagnosis-specific trans-omic biomarkers via integration of multiple omics data. Biosystems. 2024. 105122-105122
Miyuki Suzuki, Midori Iida, Toshinori Hayashi, Ken-Ichi T Suzuki. CRISPR-Cas9-Based Functional Analysis in Amphibians: Xenopus laevis, Xenopus tropicalis, and Pleurodeles waltl. Methods in molecular biology (Clifton, N.J.). 2023. 2637. 341-357
Midori Iida, Hoa Thanh Nguyen, Fumiya Takahashi, Su-Min Bak, Kazuki Kanda, Hisato Iwata. Effects of exposure to oxytetracycline on the liver proteome of red seabream (Pagrus major) in a real administration scenario. Comparative Biochemistry and Physiology Part C: Toxicology & Pharmacology. 2022. 256. 109325-109325

MISC (9件)：

飯田緑, 岩田通夫, 山西芳裕. ネットワーク医学による創薬の実際. 糖尿病と代謝. 2022. 49. 2. 31-34
飯田緑, 山西芳裕. ネットワーク生物学で紐解く化学物質と生体の関係性. 環境ホルモン学会研究発表会プログラム・要旨集. 2021. 23rd (Web)
Nguyen Hoa Thanh, Yamamoto Kimika, Iida Midori, Agusa Tetsuro, Hirano Masashi, Ochiai Mari, Kim Eun-Young, Iwata Hisato. 妊娠中にビスフェノールAに曝露したラットの肝臓トランスクリプトーム分析それらの産仔のトランスクリプトームとの比較(Hepatic transcriptome profiles of rats exposed to bisphenol A during pregnancy: comparison with those oftheir offspring). 環境ホルモン学会研究発表会要旨集. 2017. 20回. 74-74
伊藤匠平, 飯田緑, Nguyen Thanh Hoa, 阿草哲郎, 平野将司, 落合真理, 金恩英, 岩田久人. ビスフェノールAの出生前曝露によるニワトリ新生雛の肝臓トランスクリプトームへの影響の雌雄差. 環境ホルモン学会研究発表会要旨集. 2017. 20回. 68-68
高橋秀尚, 柴田美音, 瀧川一学, 渡部昌, 築山忠維, 山本淳一, 山口雄輝, 藤井聡, 飯田緑, RANJAN Amol, et al. メディエーター複合体による転写終結制御機構. 日本生化学会大会(Web). 2017. 90th. ROMBUNNO.4P2T15-06(3P-0635) (WEB ONLY)-0635)]

書籍 (2件)：

講演・口頭発表等 (47件)：

Predicting the Combined Effects of Environmental Pollutants Using a Network-Based Approach
(2024)
Inferring the Health Outcomes of PFAS Using a Network Biology Approach
(International Symposium on Toxicity Assessment (ISTA) 2024)
Network-based Approach to Exploring Mechanisms of Action for PFAS
(International Symposium on Toxicity Assessment (ISTA) 2024)
ネットワ-ク科学を用いた海洋漂着プラスチックレンジペレットに吸着した環境汚染物質の複合影響の予測
(第3回環境化学物質合同大会 2024)
モレレットワニ (Crocodylus moreletii) の鱗甲トランスクリプトームのde novoアセンブリと機能同定
(第3回環境化学物質合同大会 2024)

Works (2件)：

click to analyze pooled amplicon sequence data using R (CLiCKAR)
Midori Iida, Miyuki Suzuki, Yuto Sakane, Hiroyo Nishide, Ikuo Uchiyama, Takashi Yamamoto, Ken-Ichi T Suzuki, Satoshi Fujii 2020 - 現在
2020年日本バイオインフォマティクス学会年会大会ポスター

経歴 (5件)：

受賞 (2件)：

所属学会 (1件)：

バイオインフォマティクス学会

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