研究者
J-GLOBAL ID：202001021459982977
更新日: 2024年02月20日
井上 詞貴
イノウエ フミタカ | Inoue Fumitaka
所属機関・部署：
職名：
特定准教授
ホームページURL (2件)：
https://ashbi.kyoto-u.ac.jp/lab-sites/inoue_lab/
,
https://ashbi.kyoto-u.ac.jp/lab-sites/inoue_lab/en/
研究分野 (3件)：
発生生物学
, 分子生物学
, ゲノム生物学
研究キーワード (4件)：
ゲノム進化
, 神経分化
, 大規模並列レポーターアッセイ
, エンハンサー
競争的資金等の研究課題 (5件)：
- 2022 - 2027 大規模並列レポーターアッセイによるヒト特性と非コードゲノム進化の解明
- 2021 - 2024 大規模並列レポーターアッセイ法による転移因子進化メカニズムの解明
- 2021 - 2024 Evaluating the role of cis-regulatory tandem DNA repeats in human disease and evolution
- 2022 - 2023 ヒト特性を担う遺伝子制御領域の大規模機能アノテーション
- 2013 - 2013 遺伝子制御エレメントの大規模並列機能解析
論文 (32件)：
-
Davide Capauto, Yifan Wang, Feinan Wu, Scott Norton, Jessica Mariani, Fumitaka Inoue, Gregory E Crawford, Nadav Ahituv, Alexej Abyzov, Flora M Vaccarino. Characterization of enhancer activity in early human neurodevelopment using Massively Parallel Reporter Assay (MPRA) and forebrain organoids. Scientific reports. 2024. 14. 1. 3936-3936
-
Yuanqing Feng, Ning Xie, Fumitaka Inoue, Shaohua Fan, Joshua Saskin, Chao Zhang, Fang Zhang, Matthew E B Hansen, Thomas Nyambo, Sununguko Wata Mpoloka, et al. Integrative functional genomic analyses identify genetic variants influencing skin pigmentation in Africans. Nature genetics. 2024. 56. 2. 258-272
-
Jiayi Liu, Tal Ashuach, Fumitaka Inoue, Nadav Ahituv, Nir Yosef, Anat Kreimer. Optimizing sequence design strategies for perturbation MPRAs: a computational evaluation framework. Nucleic acids research. 2024
-
Xun Chen, Zicong Zhang, Yizhi Yan, Clement Goubert, Guillaume Bourque, Fumitaka Inoue. Cryptic endogenous retrovirus subfamilies in the primate lineage. 2023
-
Jiayi Liu, Tal Ashuach, Fumitaka Inoue, Nadav Ahituv, Nir Yosef, Anat Kreimer. Best practices for perturbation MPRA-a computational evaluation framework of sequence design strategies. 2023
もっと見る
MISC (3件)：
-
井上詞貴. ヒト加速領域(HAR)の機能と進化を機械学習により検証する. 実験医学. 2023. 41. 13
-
井上詞貴. 大規模並列レポーターアッセイによる神経誘導メカニズムの解読. 実験医学. 2020. 38. 4
-
井上詞貴. 視床下部におけるレプチン応答ゲノム・エピゲノム解析. 実験医学. 2019. 37. 14
講演・口頭発表等 (10件)：
-
Massively parallel dissection of regulatory code underlying neural differentiation
(第56回日本発生生物学会 2023)
-
転移因子エンハンサーバリアントの大規模機能解析
(第45回日本分子生物学会年会 2022)
-
大規模並列レポーターアッセイによるノンコーディングゲノム解読
(NGS EXPO 2022 2022)
-
大規模並列レポーターアッセイが紐解く細胞分化、進化、疾患
(第10回 都医学研シンポジウム ゲノム機能解析の進展とその医科学への応用 2020)
-
Functional Dissection of Neural Enhancers Using Massively Parallel Reporter Assays
(The 7th Annual Molecular Psychiatry Meeting 2019)
もっと見る
学歴 (3件)：
- 2005 - 2008 埼玉大学 大学院理工学研究科 博士後期課程 生物環境科学専攻
- 2003 - 2005 埼玉大学 大学院理工学研究科 博士前期課程 生体制御学専攻
- 1999 - 2003 埼玉大学 理学部 生体制御学科
経歴 (5件)：
- 2020/07 - 現在 京都大学 ヒト生物学高等研究拠点 (ASHBi) 特定准教授
- 2018/08 - 2020/06 カリフォルニア大学サンフランシスコ校
- 2017/08 - 2018/07 カリフォルニア大学サンフランシスコ校
- 2012/08 - 2017/07 カリフォルニア大学サンフランシスコ校
- 2008/04 - 2012/07 特定国立研究開発法人理化学研究所 発生・再生科学総合研究センター 研究員
受賞 (1件)：
- 2018/02 - ENCODE consortium meeting ポスター賞
所属学会 (3件)：
American society of human genetics
, 日本発生生物学会
, 日本分子生物学会
