- 2019 - 2022 等脚目キクイムシ属の食性多様性と種分化および消化酵素系の適応
- 2015 - 2018 チリの湿地性植物群の変遷史から読み解く南半球特異的植物相の成立過程
- 2013 - 2017 マングローブ林の保全と再生に必要な遺伝的多様性の解析:主要構成種5群の解析
- 2009 - 2012 植物鉱化ゴミ化石を中心としたチリパタゴニアにおける南極関連植物相成立史の解明
- 2006 - 2009 連鎖地図ベースでのハイマツ・キタゴヨウ交雑帯の解析
- 2007 - 2008 化石DNA解析によるハイマツ・キタゴヨウ間の遺伝子浸透の進行過程の推定
- 2006 - 2008 南米中南部における古第三紀以降の植生変遷と地球科学的変動に関する研究
- 2003 - 2005 ハイマツ・キタゴヨウ交雑帯のデモグラフィク・ジェネティックス
- 2002 - 2005 南米南部における白亜紀以降の植生変遷の解明
- 2002 - 2004 針葉樹類における異時性による属分化現象の解析
- 2002 - 2004 マツ属種間の系統関係の葉緑体・ミトコンドリア・複数の核遺伝子による再構築
- 2001 - 2003 南半球におけるタバコ属植物(ナス科)進化の統合研究
- 2000 - 2001 系統情報と化石情報による、ゴンドワナ関連植物の進化史の復元
- 2000 - 2001 ゴンドワナ分布裸子植物Podocarpus(マキ科)における系統進化学的研究
- 1999 - 2001 トランスアンデス型分布植物の起源と分散過程の解析-北からか、南からか
- 1998 - 2000 中新世石化化石による現生型植物の分化過程の解明
- 1998 - 2000 ヒガンバナ属(ヒガンバナ科)の進化史の解明-植物における種分化のケーススタディ-
- 1998 - 2000 東南アジア熱帯の島嶼群における植物の種分化機構と遺伝的多様性の研究
- 1998 - 1999 花化石に基づく単子葉植物の祖先形態の追跡
- 1998 - 1999 植物の周南極分布の起源に関する総合研究
- 1997 - 1998 胚珠の起源と系統進化の解析-花の進化史解明に向けて
- 1996 - 1997 環南太平洋地域におけるゴンドワナ要素植物の進化の総合研究
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