研究者
J-GLOBAL ID:202301006015188959   更新日: 2024年11月07日

酒井 雄介

サカイ ユウスケ | SAKAI Yusuke
所属機関・部署:
研究キーワード (7件): DNAナノテクノロジー ,  原子間力顕微鏡 ,  RNA modification ,  transfer RNA ,  遺伝暗号解読 ,  分子機械 ,  DNA折り紙
競争的資金等の研究課題 (10件):
  • 2023 - 2025 DNAの階層的自己組織化によるマルチスケールな二次元ナノ配列プラットフォーム
  • 2023 - 2025 DNAナノ構造体のための汎用分子モーターモジュールの開発
  • 2021 - 2024 dna-origami-db for automation of DNA origami research
  • 2022 - 2023 DNAオリガミと人工代謝系の融合によるマルチプレックス検出機構の開発
  • 2021 - 2023 Sensitive and Specific Long RNA Detecting Nanodevice for Future Lab-Test Diagnosis
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論文 (12件):
  • Gerrit D. Wilkens, Piotr Stępień, Yusuke Sakai, Md. Sirajul Islam, Jonathan G. Heddle. A DNA Origami Bubble Blower for Liposome Production. ACS Omega. 2024
  • Yusuke Sakai, Gerrit D. Wilkens, Karol Wolski, Szczepan Zapotoczny, Jonathan G. Heddle. Topogami: Topologically Linked DNA Origami. ACS Nanoscience Au. 2022. 2. 1. 57-63
  • Shiu, S.C.-C., Sakai, Y., Tanner, J.A., Heddle, J.G. Fret-mediated observation of protein-triggered conformational changes in dna nanostructures. Methods in Molecular Biology. 2021. 2208. 69-80
  • Sakai, Y., Kimura, S., Suzuki, T. Dual pathways of tRNA hydroxylation ensure efficient translation by expanding decoding capability. Nature Communications. 2019. 10. 1. 2858
  • Sakai, Y., Islam, M.S., Adamiak, M., Shiu, S.C.-C., Tanner, J.A., Heddle, J.G. DNA aptamers for the functionalisation of DNA origami nanostructures. Genes. 2018. 9. 12. 571-571
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MISC (2件):
  • 酒井 雄介. 研究最前線. 分子サイバネティクスニュースレター. 2022. 5. 88-88
  • 酒井 雄介. 長年の探索から埋れていたtRNA修飾酵素の同定, ゲノム微生物学の研究トレンド2. ゲノム微生物学会ニュースレター. 2019. 20. 8-13
特許 (1件):
  • Topogami and method for making interlocked single stranded dna rings
講演・口頭発表等 (16件):
  • Directional Graph Modelling for Solution Design and Experiment Automation
    (DNA 30 2024)
  • Universal molecular motor module for DNA nanodevices
    (2024)
  • Dimeric DNA origami nanocapsules for controllable cargo accessibility
    (21st Annual Conference on Foundations of Nanoscience (FNANO2024) 2024)
  • 「dna-origami-db」で目指すDNA 折り紙研究の自動化 (ポスターセレクション)
    (「細胞を創る」研究会 16.0 2023)
  • The On-Chip Nucleic Acids Fractionation aimed at parallelised preparation of DNA nanosystems
    (分子サイバネティクス・超越分子システム合同シンポジウム2023 2023)
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Works (2件):
  • protocol-designer-to-py
    酒井 雄介 2023 - 現在
  • Cadnano Tools
    酒井 雄介 2022 - 現在
学歴 (3件):
  • 2013 - 2016 東京大学 大学院工学系研究科博士課程 化学生命工学専攻
  • 2011 - 2013 東京大学 大学院工学系研究科修士課程 化学生命工学専攻
  • 2007 - 2011 東京大学 工学部 化学生命工学科
経歴 (5件):
  • 2020/09 - 現在 特定国立研究開発法人理化学研究所 生命機能科学研究センター 研究員
  • 2016/10 - 2020/08 Jagiellonian University in Krakow Malopolska Centre of Biotechnology Scientific Assistant
  • 2017/09 - 2019/08 Jagiellonian University in Krakow Malopolska Centre of Biotechnology POLONEZ3 Fellow
  • 2016/04 - 2016/09 東京大学 大学院工学系研究科 リサーチアシスタント
  • 2013/04 - 2016/03 東京大学 大学院工学系研究科 学振特別研究員(DC1)
委員歴 (1件):
  • 2024/04 - 現在 生物物理学会人工細胞モデル&分子ロボティクスサブグループ ヤングオーガナイザー
受賞 (4件):
  • 2021/11 - 第5回分子ロボティクス年次大会 若手研究奨励賞 長鎖DNAの酵素的カテナン化による「Topogami」の構築
  • 2019/07 - FEBS Letter Daily Poster Award DNA origami nanocapsules for controllable cargo accessibility.
  • 2017/02 - Horizon 2020 Marie Sklodowska-Curie Actions Seal of Excellence Supramolecular Protein Inhibition via Nanoscale-device
  • 2015/12 - Oxford University Press NAR Breakthrough Article Biogenesis and growth phase-dependent alteration of 5-methoxycarbonylmethoxyuridine in tRNA anticodons
所属学会 (4件):
日本化学会 ,  情報計算化学生物学会(CBI学会) ,  日本生物物理学会 ,  計測自動制御学会
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