酒井雄介

サカイユウスケ | SAKAI Yusuke

所属機関・部署：

研究キーワード (7件)： DNAナノテクノロジー , 原子間力顕微鏡 , RNA modification , transfer RNA , 遺伝暗号解読 , 分子機械 , DNA折り紙

競争的資金等の研究課題 (10件)：

2023 - 2025 DNAの階層的自己組織化によるマルチスケールな二次元ナノ配列プラットフォーム
2023 - 2025 DNAナノ構造体のための汎用分子モーターモジュールの開発
2021 - 2024 dna-origami-db for automation of DNA origami research
2022 - 2023 DNAオリガミと人工代謝系の融合によるマルチプレックス検出機構の開発
2021 - 2023 Sensitive and Specific Long RNA Detecting Nanodevice for Future Lab-Test Diagnosis

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論文 (11件)：

Yusuke Sakai, Gerrit D. Wilkens, Karol Wolski, Szczepan Zapotoczny, Jonathan G. Heddle. Topogami: Topologically Linked DNA Origami. ACS Nanoscience Au. 2022. 2. 1. 57-63
Shiu, S.C.-C., Sakai, Y., Tanner, J.A., Heddle, J.G. Fret-mediated observation of protein-triggered conformational changes in dna nanostructures. Methods in Molecular Biology. 2021. 2208. 69-80
Sakai, Y., Kimura, S., Suzuki, T. Dual pathways of tRNA hydroxylation ensure efficient translation by expanding decoding capability. Nature Communications. 2019. 10. 1. 2858
Sakai, Y., Islam, M.S., Adamiak, M., Shiu, S.C.-C., Tanner, J.A., Heddle, J.G. DNA aptamers for the functionalisation of DNA origami nanostructures. Genes. 2018. 9. 12. 571-571
Shiu, Simon Chi-Chin, Kinghorn, Andrew B, Sakai, Yusuke, Cheung, Yee-Wai, Heddle, Jonathan G, Tanner, Julian A. The Three S's for Aptamer-Mediated Control of DNA Nanostructure Dynamics: Shape, Self-Complementarity, and Spatial Flexibility. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2018. 19. 18

MISC (2件)：

特許 (1件)：

講演・口頭発表等 (13件)：

「dna-origami-db」で目指すDNA 折り紙研究の自動化 (ポスターセレクション)
(「細胞を創る」研究会 16.0 2023)
The On-Chip Nucleic Acids Fractionation aimed at parallelised preparation of DNA nanosystems
(分子サイバネティクス・超越分子システム合同シンポジウム2023 2023)
DNA折り紙研究を加速し、民主化する
(第6回分子ロボティクス年会 2022)
DNAで超分子デバイスを作る。DNA超分子で超分子システムを作る。
(第9回ゆらぎ界面研究会 2022)
Toward Realistic Development of Challenging DNA Nanorobot
(International Workshop on Molecular Cybernetics: Toward Chemical AI 2022)

Works (2件)：

学歴 (3件)：

経歴 (5件)：

2020/09 - 現在特定国立研究開発法人理化学研究所生命機能科学研究センター研究員
2016/10 - 2020/08 Jagiellonian University in Krakow Malopolska Centre of Biotechnology Scientific Assistant
2017/09 - 2019/08 Jagiellonian University in Krakow Malopolska Centre of Biotechnology POLONEZ3 Fellow
2016/04 - 2016/09 東京大学大学院工学系研究科リサーチアシスタント
2013/04 - 2016/03 東京大学大学院工学系研究科学振特別研究員(DC1)

受賞 (4件)：

2021/11 - 第5回分子ロボティクス年次大会若手研究奨励賞長鎖DNAの酵素的カテナン化による「Topogami」の構築
2019/07 - FEBS Letter Daily Poster Award DNA origami nanocapsules for controllable cargo accessibility.
2017/02 - Horizon 2020 Marie Sklodowska-Curie Actions Seal of Excellence Supramolecular Protein Inhibition via Nanoscale-device
2015/12 - Oxford University Press NAR Breakthrough Article Biogenesis and growth phase-dependent alteration of 5-methoxycarbonylmethoxyuridine in tRNA anticodons

所属学会 (3件)：

情報計算化学生物学会(CBI学会) , 日本生物物理学会 , 計測自動制御学会

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酒井 雄介