研究者
J-GLOBAL ID:202401012822886691   更新日: 2024年11月16日

守屋 勇樹

モリヤ ユウキ | Moriya Yuki
所属機関・部署:
職名: 特任研究員
研究分野 (3件): 生命、健康、医療情報学 ,  データベース ,  ゲノム生物学
研究キーワード (3件): Webアプリケーション ,  データベース ,  バイオインフォマティクス
競争的資金等の研究課題 (5件):
  • 2024 - 2025 質量分析オミックスデータの解釈を促すエンリッチメント解析基盤の構築
  • 2024 - 2025 オミクス解析のための自動簡易アノテーションツールと系統情報表示ツールの開発
  • 2019 - 2020 文字列高速検索技術とRDFを用いたタンパク質配列同定リソースの開発とその応用
  • 2016 - 2019 深層学習による質量ピーク探知法の開発
  • 2017 - 2018 文字列高速検索技術とRDFを用いたタンパク質同定リソースの開発
論文 (29件):
  • Shujiro Okuda, Akiyasu C Yoshizawa, Daiki Kobayashi, Yushi Takahashi, Yu Watanabe, Yuki Moriya, Atsushi Hatano, Tomoyo Takami, Masaki Matsumoto, Norie Araki, et al. jPOST environment accelerates the reuse and reanalysis of public proteome mass spectrometry data. Nucleic Acids Research. 2024
  • Nobutaka Mitsuhashi, Hirokazu Chiba, Yuki Moriya, Toyoyuki Takada. BioHackJP 2023 Report R1: Mapping human genome variations to their mouse counterparts for identifying disease model mouse strains. BioHackrXiv. 2024
  • Hirotsugu Shiroma, Youssef Darzi, Etsuko Terajima, Zenichi Nakagawa, Hirotaka Tsuchikura, Naoki Tsukuda, Yuki Moriya, Shujiro Okuda, Susumu Goto, Takuji Yamada. Enteropathway: the metabolic pathway database for the human gut microbiota. BioRxiv. 2023
  • 高月 照江, 池田 秀也, 井手 隆広, 大田 達郎, 小野 浩雅, 片山 俊明, 川島 秀一, 申 在紋, 建石 由佳, 千葉 啓和, et al. 統合データベース探索フレームワークTogoDXの開発とその応用. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 池田 秀也, 千葉 啓和, 藤原 豊史, 五斗 進, 井手 隆広, 川島 秀一, 箕輪 真理, 三橋 信孝, 守屋 勇樹, 内藤 雄樹, et al. TogoID: データベース統合の基盤となるID変換サービス. トーゴーの日2022. 2022. 1
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MISC (6件):
  • 平川 英樹, 藤澤 貴智, 守屋 勇樹, 信定 知江, 長崎 英樹, 森 宙史, 福島 敦史, Ghelfi Andrea, 市原 寿子, 中村 保一, et al. 植物ゲノム統合データベースPlant GARDEN、微生物、メタボローム統合データベース間の連携検索システムの開発. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 藤澤 貴智, 平川 英樹, 守屋 勇樹, 信定 知江, 金谷 重彦, 有田 正規, 田畑 哲之, 磯部 祥子, 東 光一, 中村 保一, et al. MicrobeDB.jpからMicrobiome Datahubへ: 微生物・植物・メタボロームのデータ統合と統合微生物データベースの再構築. トーゴーの日2022. 2022. 1
  • 奥田 修二郎, 渡辺 由, 守屋 勇樹, 河野 信, 山本 格, 松本 雅記, 高見 知代, 小林 大樹, 荒木 令江, 吉沢 明康, et al. jPOST プロテオーム統合データベースプロジェクト. 生命科学系学会合同年次大会. 2017. 2017年度. [3P-0171]
  • 守屋 勇樹, 河野 信, 奥田 修二郎, 渡辺 由, 山本 格, 松本 雅記, 高見 知代, 小林 大樹, 荒木 令江, 吉沢 明康, et al. jPOST プロテオームデータベースの開発. 生命科学系学会合同年次大会. 2017. 2017年度. [3P-0173]
  • 吉沢 明康, 田畑 剛, 守屋 勇樹, 河野 信, 奥田 修二郎, 渡辺 由, 山本 格, 松本 雅記, 高見 知代, 小林 大樹, et al. jPOST 同定結果のFDR改善を目指す再解析プロトコルの開発. 生命科学系学会合同年次大会. 2017. 2017年度. [3P-0172]
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書籍 (2件):
  • 実験医学 Vol. 41 No. 16
    羊土社 2023
  • 化学と生物 Vol. 44 No. 1
    日本農芸化学会 2006
講演・口頭発表等 (28件):
  • TogoDX/Human: An application for integrated exploration of human-related data
    (CBI学会2023年大会 2023)
  • TogoDX/Human: An application for integrated exploration of human-related data
    (第12回生命医薬情報学連合大会 2023)
  • TogoDX/Human: An application for integrated exploration of human-related data
    (第45回日本分子生物学会年会 2022)
  • SPARQL support の機能開発
    (トーゴーの日シンポジウム 2022)
  • MetaStanza:汎用型データ可視化ウェブアプリケーションの開発
    (トーゴーの日シンポジウム 2021)
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Works (15件):
  • TogoDX/Human - ヒトのデータを統合的に探索・俯瞰
    TogoDX/Human development team 2021 -
  • TogoID - データベースのID間の対応関係を検索および変換
    TogoID development team 2021 -
  • Endpoint browser - 視覚的SPARQLエンドポイント探索
    守屋勇樹 2019 -
  • jPOST database - 標準化プロテオームデータベース
    jPOST deveropment team 2017 -
  • SPARQList - SPARQLクエリをREST API化するためのアプリケーション
    片山俊明, 守屋勇樹, 川島秀一 2017 -
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学歴 (2件):
  • 2001 - 2006 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻
  • 1996 - 2000 北海道大学 理学部 生物学科
経歴 (6件):
  • 2024/04 - 現在 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員
  • 2017/04 - 2024/03 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員
  • 2016/04 - 2017/03 情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員
  • 2014/04 - 2016/03 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター 特任研究員
  • 2006/12 - 2014/03 京都大学 化学研究所 附属バイオインフォマティクスセンター 研究員
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