- 2019 - 2023 プラスチドシグナルによる核遺伝子発現制御の普遍性と多様性
- 2016 - 2019 プラスチドシグナル研究の新展開
- 2014 - 2018 概日時計機構を利用した植物のストレス応答戦略
- 2014 - 2016 内部共生による宿主-オルガネラ間の遺伝子発現協調機構の成立
- 2013 - 2015 葉緑体における光環境感覚と細胞応答機構
- 2012 - 2015 核・葉緑体制御ループによる葉緑体ゲノム機能の統御機構
- 2012 - 2014 共生による葉緑体光応答系の成立と進化
- 2012 - 2014 クロマチン免疫沈降法を利用した色素体分化機構の解析
- 2008 - 2012 色素体分化に際した情報伝達・転写制御の分子機構
- 2008 - 2012 Molecular Mechanism for Transcriptional Regulation in Plastid Development
- 2009 - 2010 クロマチン免疫沈降法を利用した葉緑体転写制御機構の解析
- 2000 - 2002 プラスチド分化における核と葉緑体間のクロストーク -葉緑体形質転換系を用いて-
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