- 2016 - 2019 炭素と窒素のモニタリングによる光合成の順化機構の解明
- 2011 - 2018 珪藻のフィジオロミクスに基づく褐色のエネルギー革命
- 2011 - 2016 CO2濃縮強化によるスーパー光合成の実現と物質生産
- 2013 - 2015 二酸化炭素のセンシングと光合成制御機構の解明
- 2011 - 2013 二酸化炭素のセンシングと葉緑体内タンパク質移動制御機構の解明
- 2010 - 2012 デジタル遺伝子発現解析による微細藻類CO2濃縮・水素発生関連遺伝子の同定と利用
- 2005 - 2010 下等植物の進化・多様性に関するゲノム研究
- 2006 - 2008 二酸化炭素センサーの構造と機能
- 2006 - 2007 半数体ゲノムにおける性染色体遺伝子の機能
- 2003 - 2005 光合成順化に関わる遺伝子ネットワーク解析による真核型無機炭素輸送体の解明
- 2002 - 2004 DNAアレイを用いた新規CO2輸送体遺伝子の単離と炭酸固定増強への利用
- 2004 - 2004 ゼニゴケY染色体トランスクリプトームの解析
- 2003 - 2003 ゼニゴケY染色体の全配列決定・アノテーション・遺伝子発現プロファイル
- 2000 - 2002 無機炭素濃縮関連遺伝子の転写調節ネットワークの解明
- 2002 - 2002 ゼニゴケY染色体の全構造の解析
- 2001 - 2002 植物の生殖器官形成プログラム
- 1998 - 2001 無機炭素輸送の制御機構
- 2000 - 2000 真核光合成微生物クラミドモナスを用いた実験系とゲノム解析の現状調査
- 1997 - 2000 植物の性の決定分化制御の分子機構
- 1999 - 1999 緑藻クラミドモナスを用いた実験系とゲノム解析の現状調査
- 1997 - 1998 ラン藻低分子量熱ショックタンパク質HSP16.6の機能解析
- 1997 - 1998 炭酸固定制御のシグナル伝達機構
- 1996 - 1996 植物におけるCO_2濃縮系の遺伝子工学的改良
- 1996 - 1996 ゼニゴケ性染色体の構造と分化機構
- 1996 - 1996 オルガネラ遺伝子転移の分子進化
- 1994 - 1996 植物の性分化に伴って発現する遺伝子の解析
- 1995 - 1995 植物におけるCO_2シグナル伝達系の解明
- 1995 - 1995 ゼニゴケ性染色体の構造と性分化機構
- 1995 - 1995 無機炭素輸送濃縮機構の環境応答
- 1994 - 1994 炭酸固定関連遺伝子クラスターの構造と機能解析
- 1994 - 1994 オルガネラのイントロンの分子進化
- 1994 - 1994 無機炭素輸送濃縮機構の環境応答
- 1993 - 1993 無機炭素固定に必須な新しい遺伝子の機能解析
- 1991 - 1992 シグナル応答の分子的解析
- 1991 - 1991 炭酸脱水酵素遺伝子の環境応答機構の解明
- 1990 - 1990 高等植物における炭酸脱水酵素の分子的機能解析
- 1988 - 1990 光合成の光化学反応中心蛋白質複合体の解析
- 1987 - 1990 微細藻類におけるカ-ボニックアンヒドラ-ゼ及び無機炭素濃縮機構誘導の分子的基礎
- 1988 - 1988 糸状性ラン藻のヘテロシスト分化における遺伝子発現調節機構の解明
- 1986 - 1986 ゼニゴケ葉緑体DNAの複製と遺伝子発現機構の解明
- Structure and function of sex chromosomes in plants
- Analysis of CO2-concentrating mechanism
- Molecular Mechanism of gene regulation and signal transduction responsive to environmental CO2.
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