- 2019 - 2024 生物群集における共進化過程に着目した生態系復元の実証研究
- 2019 - 2024 山腹崩壊後の植生遷移の制限要因の解明と多様な窒素固定植物による植林技術の開発
- 2021 - 2023 ミュゼオミクスの挑戦:過去の個体数変動における進化的救助の貢献を推定する
- 2021 - 2022 シロツメクサ都市適応進化と都市-生態-進化連関:ニッチモデリングによるアプローチ
- 2016 - 2020 景観群集ゲノミクス・アプローチによる群集生態-進化動態の統合的解明
- 2016 - 2019 植物と昆虫の相互作用における進化-生態ダイナミクス
- 2015 - 2018 複合生態系における寄生者感染動態と群集動態の関係の統合理解
- 2013 - 2015 ダムが森林の生物多様性に与える影響:渓畔林樹種の分散経路としての河川機能に着目して
- 2014 - 2015 フィールドにおける群集と進化のフィードバックループの解明
- 2013 - 2015 適応進化と生態系ネットワークのフィードバック機構の解明
- 2010 - 2013 植物の食害誘導反応がつなぐ植食性昆虫の群集と進化のダイナミクス
- 2009 - 2010 河川の流水特性が植物の再生長を介して流域の生物多様性に与える影響
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