研究者
J-GLOBAL ID:200901009532752634
更新日: 2024年10月31日
河野 秀俊
コウノ ヒデトシ | Kono Hidetoshi
所属機関・部署:
職名:
グループリーダー
研究分野 (5件):
生物物理学
, システムゲノム科学
, ゲノム生物学
, 分子生物学
, 生命、健康、医療情報学
研究キーワード (1件):
protein-DNA; nucleosome; protein design; DNA-binding protein; molecular modeling
競争的資金等の研究課題 (19件):
- 2018 - 2023 ヌクレオソーム高次構造とダイナミクスの解析によるクロマチン潜在能の解明
- 2015 - 2018 クロマチン動構造の国際共同研究ネットワーク形成
- 2013 - 2018 シミュレーション計算による動的クロマチンのダイナミクス解析
- 2013 - 2018 動的クロマチン構造と機能
- 2014 - 2017 計算と実験の融合によるDNA結合タンパク質の塩基配列選択能の高度化
- 2012 - 2017 計算・情報科学による転写サイクルにおける情報変換機構の解明
- 2011 - 2013 ヌクレオソーム構造の自由エネルギープロファイル解析
- 2009 - 2010 シミュレーション計算によるヌクレオソーム構造形成の自由エネルギー地形解析
- 2009 - 2010 DNA配列に特異的に結合するタンパク質分子設計
- 2008 - 2010 転写因子の結合とヌクレオソーム構造にもとづく遺伝子転写制御機構の推定
- 2007 - 2008 中性子散乱実験と分子動力学計算による蛋白質-DNA認識機構における水の挙動解析
- 2004 - 2004 転写因子のターゲット部位予側にもとづく遺伝子の機能及び相互作用推定
- 2003 - 2004 蛋白質の機能部位推定及びSNPによる機能変化の予側
- 2003 - 2003 転写因子のターゲット部位予側からのゲノム機能推定
- 1998 - 1998 DNA結合蛋白質の機能性cavityと立体構造安定性
- hydration around DNA/protein
- de novo design of proteins
- DNA-binding protein
- protein-DNA recognition
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論文 (151件):
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Masahiko Taguchi, Shun Sakuraba, Justin Chan, Hidetoshi Kono. Unveiling the Photoactivation Mechanism of BLUF Photoreceptor Protein through Hybrid Quantum Mechanics/Molecular Mechanics Free-Energy Calculation. ACS Physical Chemistry Au. 2024
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Akiko Fujimura, Hisashi Ishida, Tamiko Nozaki, Shuhei Terada, Yuto Azumaya, Tadashi Ishiguro, Yugo R Kamimura, Tomoya Kujirai, Hitoshi Kurumizaka, Hidetoshi Kono, et al. Designer Adaptor Proteins for Functional Conversion of Peptides to Small-Molecule Ligands toward In-Cell Catalytic Protein Modification. ACS central science. 2023. 9. 11. 2115-2128
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Hisashi Ishida, Atsushi Matsumoto, Hiroki Tanaka, Aya Okuda, Ken Morishima, Paul A Wade, Hitoshi Kurumizaka, Masaaki Sugiyama, Hidetoshi Kono. Structural and Dynamical Changes of Nucleosome upon GATA3 Binding. Journal of molecular biology. 2023. 168308-168308
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Junichi Higo, Kota Kasahara, Gert-Jan Bekker, Benson Ma, Shun Sakuraba, Shinji Iida, Narutoshi Kamiya, Ikuo Fukuda, Hidetoshi Kono, Yoshifumi Fukunishi, et al. Fly casting with ligand sliding and orientational selection supporting complex formation of a GPCR and a middle sized flexible molecule. Scientific Reports. 2022. 12. 1
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Justin Chan, Amarjeet Kumar, Hidetoshi Kono. RNAPII driven post-translational modifications of nucleosomal histones. Trends in Genetics. 2022
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MISC (31件):
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柚木康弘, 松本淳, 守島健, MARTEL Anne, PORCAR Lionel, 佐藤信浩, 與語理那, 與語理那, 與語理那, 富永大輝, et al. 時計タンパク質複合体の構造解析を通して明らかとなった中性子小角散乱法の強み. 波紋. 2022. 32. 4
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Hidetoshi Kono, Hisashi Ishida. Nucleosome unwrapping and unstacking. Current Opinion in Structural Biology. 2020. 64. 119-125
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藤巻秀, 五十嵐龍治, 高草木洋一, 安達基泰, 横谷明徳, 玉田太郎, 河野秀俊, 鹿園直哉, 今岡達彦, 赤松憲, et al. 最先端の研究開発 量子科学技術研究開発機構 第4回「量子生命科学」の発進. ΑΤΟΜΟΣ. 2019. 61. 6. 477-481
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Zhenhai Li, Jinzen Ikebe, Shun Sakuraba, Hidetoshi Kono. Distinct Roles of H3 and H2A Tails in Linker DNA Dynamics. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 373A-373A
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Hisashi Ishida, Hidetoshi Kono. The Free-Energy Landscape of the di-Nucleosome: A Critical Role of the H4 Tails for the Nucleosome-Nucleosome Conformation. BIOPHYSICAL JOURNAL. 2017. 112. 3. 216A-216A
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受賞 (2件):
- 2013/09 - 日本生物物理学会 第2回BIOPHYSICS論文賞
- 2002 - バイオインフォマティクス学会 GIW2002ベストポスター賞
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