研究者
J-GLOBAL ID：200901012864943310   更新日: 2024年02月01日

佐藤 健吾

サトウ ケンゴ | SATO Kengo
所属機関・部署：
東京電機大学 システムデザイン工学部情報システム工学科

東京電機大学 システムデザイン工学部情報システム工学科 について


職名： 教授
ホームページURL (2件)： https://www.sato-lab.org/ ,  https://www.sato-lab.org/en/
研究分野 (3件)： システムゲノム科学 ,  生命、健康、医療情報学 ,  知能情報学
研究キーワード (6件)： 計算生物学 ,  機械学習 ,  配列解析 ,  バイオインフォマティクス ,  生命データサイエンス ,  データマイニング
競争的資金等の研究課題 (11件)：
  • 2022 - 2025 修飾塩基を含むRNAの二次構造解析技術の確立
  • 2019 - 2022 ナノポアシークエンサーを用いたRNA二次構造決定法の開発
  • 2017 - 2022 人工知能を用いた化学コミュニケーション空間の多様性と共通性の解明
  • 2019 - 2021 GenomeGAN: 敵対的生成ネットワークによるインシリコゲノム合成
  • 2016 - 2020 次世代シークエンシングデータを利用した機械学習によるRNA二次構造予測の高精度化
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論文 (66件)：
  • Kengo Sato, Michiaki Hamada. Recent trends in RNA informatics: a review of machine learning and deep learning for RNA secondary structure prediction and RNA drug discovery. Briefings in Bioinformatics. 2023
  • Manato Akiyama, Yasubumi Sakakibara, Kengo Sato. Direct inference of base-pairing probabilities with neural networks improves prediction of RNA secondary structures with pseudoknots,. Genes. 2022. 13. 11. 2155
  • Soichiro Nishiyama, Kengo Sato, Ryutaro Tao. Integer programming for selecting set of informative markers in paternity inference,. BMC Bioinformatics. 2022. 23. 1. 265-265
  • Kengo Sato, Yuki Kato. Prediction of RNA secondary structure including pseudoknots for long sequences,. Briefings in Bioinformatics. 2022. 23. 1
  • Shunya Kashiwagi, Kengo Sato, Yasubumi Sakakibara. A max-margin model for predicting residue-base contacts in protein-RNA interactions,. Life. 2021. 11. 11. 1135
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MISC (20件)：
  • 佐藤健吾. MXfold2: 深層学習にもとづくRNAの高精度な二次構造予測プログラム,. バイオサイエンスとインダストリー. 2021. 79. 6
  • 佐藤健吾. 世界最高精度のRNA二次構造予測を達成 --- 熱力学モデルと深層学習の効果的な組合せ,. 化学. 2021. 76. 7
  • Li J, Nakai K, Zheng Y, Sato K, Wong L. Introduction to Selected Papers from GIW2018. Journal of Bioinformatics and Computational Biology. 2018. 16. 6
  • 青木言太, 土谷麻里子, 小坂威雄, 長谷純崇, 佐藤健吾, 水野隆一, 大家基嗣, 榊原康文. がん細胞株におけるderived RNAのプロファイル解析. 日本RNA学会年会要旨集. 2017. 19th
  • 伊藤 詩乃, 田中 佑岳, 佐藤 健吾, 洪 繁, 狩野 芳伸, 榊原 康文. RF-002 医師国家試験を自動解答するプログラムの構築(F分野:人工知能・ゲーム,査読付き論文). 情報科学技術フォーラム講演論文集. 2015. 14. 2. 11-16
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書籍 (5件)：
  • RNA Secondary Structure Prediction Based on Energy Models,
    Springer Science+Business Media 2023 ISBN:9781071627679
  • Readings in Japanese Natural Language Processing
    Stanford Univ Center for the Study 2016
  • バイオインフォマティクス入門
    慶應義塾大学出版会 2015 ISBN:9784766422511
  • 実験医学増刊「生命科学の最先端に役立つバイオデータベースとウェブツール総集編」
    羊土社 2008
  • Grammatical Inference: Algorithms and Applications,
    Springer 2006
講演・口頭発表等 (38件)：
  • プライバシー保護技術を用いた遺伝子発現差異解析
    (情報処理学会第73回バイオ情報学研究会 2023)
  • RNA secondary structure prediction using deep learning with thermodynamic integration
    (RNA Nanotechnology (Gordon Research Conference) 2023)
  • Extending a deep learning-based RNA secondary structure prediction algorithm for RNA modifications
    (情報処理学会第72回バイオ情報学研究会 2022)
  • 熱力学モデルを統合した深層学習によるRNA二次構造予測
    (第21回情報科学技術フォーラム(FIT2022) 2022)
  • Extending a deep learning-based RNA secondary structure prediction algorithm for RNA modifications
    (第11回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP 2022) 2022)
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学歴 (3件)：
  • 1997 - 2003 慶應義塾大学 大学院理工学研究科 開放環境科学専攻
  • 1995 - 1997 慶應義塾大学 大学院理工学研究科 計算機科学専攻
  • 1991 - 1995 慶應義塾大学 理工学部 数理科学科
学位 (3件)：
  • 学士(理学) (慶應義塾大学)
  • 修士(工学) (慶應義塾大学)
  • 博士(工学) (慶應義塾大学)
経歴 (6件)：
  • 2022/04 - 現在 東京電機大学 システムデザイン工学部 情報システム工学科 教授
  • 2011/04 - 2022/03 慶應義塾大学 理工学部生命情報学科 専任講師
  • 2006/04 - 2015/03 産業技術総合研究所 生命情報工学研究センター 研究員・ポスドク
  • 2009/11 - 2011/03 東京大学 大学院新領域創成科学研究科 情報生命科学専攻 専任講師
  • 2006/04 - 2009/10 バイオ産業情報化コンソーシアム 研究員・ポスドク
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委員歴 (19件)：
  • 2023/04 - 現在 情報処理学会バイオ情報学研究会 主査
  • 2023/04 - 現在 IPSJ Transactions on Bioinformatics 編集委員長
  • 2021/04 - 現在 IPSJ Transactions on Bioinformatics 副編集長
  • 2021 - 現在 Genes (Basel) Section Editor
  • 2021 - 現在 Frontiers in Genetics Associate Editor
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受賞 (5件)：
  • 2020/09 - 日本バイオインフォマティクス学会 第9回生命医薬情報学連合大会 ポスター賞
  • 2017/10 - 日本バイオインフォマティクス学会 第6回生命医薬情報学連合大会 ポスター賞
  • 2016/10 - 日本バイオインフォマティクス学会 第5回生命医薬情報学連合大会 研究奨励賞
  • 2013/03 - 情報処理学会 山下記念研究賞
  • 2008/12 - 日本バイオインフォマティクス学会 Oxford Jornals JSBi Prize
所属学会 (8件)：
日本RNA学会 ,  日本分子生物学会 ,  情報処理学会バイオ情報学研究会 ,  International Society for Computational Biology ,  日本バイオインフォマティクス学会 ,  情報処理学会 ,  日本マーモセット研究会 ,  言語処理学会
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