- 2019 - 2022 ゲノム組成の変化を伴ってヨザルで実現した暗環境への適応:霊長類全般での再現性
- 2018 - 2019 眼の不合理な構造の謎:視細胞内レンズの進化的起源から迫る
- 2015 - 2019 ヒトと類人猿のゲノムの大きな違い:組換え頻度に関する仮説のゲノム編集を用いた検証
- 2014 - 2017 霊長類ゲノムをモデルとした塩基配列進化の総合的研究
- 2012 - 2016 アジア霊長類と病原体の宿主寄生体関係史の探索
- 2011 - 2016 染色体維持におけるヘテロクロマチンの機能
- 2015 - 2016 縦列反復配列の正確な塩基配列決定
- 2010 - 2014 ゲノム不毛地帯(RCRO)の進化と意義
- 2013 - 2014 染色体構成の急速な変化がみられる霊長類:反復配列の関与に関する仮説の検証
- 2012 - 2014 ヒト上科で種特異的に生じている反復配列増減の比較ゲノム実験に基づく定量的な解析
- 2011 - 2012 ヒトでの構成的ヘテロクロマチンの消失:機構解明へ向けた痕跡部分の構造解析
- 2007 - 2008 メダカの転移因子の突発的転移頻度上昇の機構
- 2005 - 2006 脊椎動物で唯一の自家受精魚Rivulusmarmoratus実験系の立ち上げ
- 2005 - 2006 メダカ卵形成開始機構の解析から性分化の分子カスケードへ迫る
- 2004 - 2005 メダカの自然発生突然変異率への転移性遺伝因子の関与
- 1998 - 2002 メダカ転移因子 Tol2 の転移制御機構の解明および遺伝子改変系の構築
- 1998 - 2002 遺伝的組み換えの新展開:DNAの切断と再結合
- 2001 - Contribution of mobile genetic elements to genome rearrangements
- 1998 - 1999 メダカ転移因子による遺伝子改変系の構築:mRNA卵内注入による転移の活性化
- 1987 - 1998 基盤研究 (C)
- 1997 - 1998 メダカのDNA型転移因子の転移機構
- 1997 - 1998 メダカのAC様トランスポゾンによる小型実験魚類の遺伝子改変系構築
- 1995 - Evolution of genes controlling body color
- 1993 - 1993 トランスポゾンの転移に必要なホストの遺伝子の同定
- 1987 - 1988 DNAレベルにおけるショウジョウバエ集団の遺伝的変異の解析
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