研究者
J-GLOBAL ID:200901028956985706   更新日: 2024年02月01日

堀池 徳祐

ホリイケ トクマサ | Tokumasa Horiike
所属機関・部署:
職名: 准教授
研究分野 (2件): ゲノム生物学 ,  進化生物学
研究キーワード (3件): 系統樹 ,  バイオインフォマティクス ,  大量データ解析
競争的資金等の研究課題 (2件):
  • 2022 - 2026 分子進化シミュレーションによる長枝誘引の発生メカニズム解明と解消法の提案
  • 2010 - 2012 系統解析用オーソログデータセット作成システムの開発
論文 (30件):
  • 堀池徳祐, 渡邊知輝. ゲノムデータの分子系統解析への応用と今後の展望. 化学と生物. 2023. 6. 257-259
  • Tomoaki Watanabe, Akinori Kure, Tokumasa Horiike. OrthoPhy: A program to construct ortholog datasets using taxonomic information. Genome Biology and Evolution. 2023. 3. 1-16
  • Watanabe Tomoaki, Horiike Tokumasa. The Evolution of Molybdenum Dependent Nitrogenase in Cyanobacteria. Biology. 2021. 10. 4. 329
  • 伊藤玄, 古屋康則, 堀池徳祐, 向井貴彦. 伊勢湾周辺域におけるアカハライモリの遺伝的集団構造. 爬虫両棲類学会報. 2020. 2020. 2. 139-150
  • 伊藤 玄, 古屋 康則, 堀池 徳祐, 向井 貴彦. トウカイコガタスジシマドジョウの遺伝的集団構造. 魚類学雑誌. 2020. 67. 1. 41-50
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MISC (1件):
特許 (2件):
  • 無根系統樹の同型判定方法をコンピュータ上で実行可能なプログラム,それを記録したコンピュータ読取可能な記録媒体および無根系統樹の同型判定装置
  • 相同性解析システム、相同性解析方法、相同性解析プログラム及び取引成立システム
書籍 (2件):
  • CELLULAR ORIGIN AND LIFE IN EXTREME HABITATS (Volume 3: Symbiosis, Nucleus Symbiosis Hypothesis Formation of Eukaryotic Cell Nuclei by the Symbiosis of Archaea in Bacteria)
    Springer 2004
  • サイバネティック・ルネサンス
    工業調査会 1999
講演・口頭発表等 (54件):
  • indel マーカーを作成するプ ログラム LINDA(Large INDel Analyzer)の開発
    (園芸学会 2023)
  • 分類情報を用いたオーソログデータセット作成プログラムOrthoPhyの開発
    (第17回日本ゲノム微生物学会年会 2023)
  • 食虫植物の収斂タンパク質検出と正の自然選択検定
    (第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023)
  • NGSロングリードを利用した挿入・欠失マーカー作成プログラムの開発
    (第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023)
  • Farris系統樹で発生する長枝誘引
    (第23回静岡ライフサイエンスシンポジウム 2023)
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学位 (1件):
  • 博士(工学) (群馬大学)
経歴 (1件):
  • 静岡大学 創造科学技術研究部 統合バイオサイエンス部門 創造科学技術研究部 特任助教
所属学会 (3件):
日本情報処理学会 ,  日本進化学会 ,  日本ゲノム微生物学会
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