研究者
J-GLOBAL ID：200901030274803988   更新日: 2024年02月01日

白井 剛

シライ ツヨシ | Shirai Tsuyoshi
所属機関・部署：
長浜バイオ大学 バイオサイエンス学部

長浜バイオ大学 バイオサイエンス学部 について


職名： 教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (1件)：
  • 滋賀大学  データサイエンス学部   特別招聘教授
研究分野 (3件)： 生物物理学 ,  構造生物化学 ,  生命、健康、医療情報学
研究キーワード (4件)： 構造生物学 ,  情報生物学 ,  Structural Biology ,  Bioinformatics
競争的資金等の研究課題 (26件)：
  • 2023 - 2028 光合成ユビキティ:あらゆる地球環境で光合成を可能とする超分子構造制御
  • 2021 - 2026 疾患-治療薬経路グラフの高次元化研究
  • 2020 - 2024 天然変性ヒストン様蛋白質による、結核菌の個性の創出と多様性獲得の分子機構
  • 2020 - 2023 新規テクノロジー開発を見据えた新規Casタンパク質候補の機能解析
  • 2017 - 2022 創薬等ライフサイエンス研究を促進する研究支援とデータサイエンス
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論文 (109件)：
  • Kohdai Yamada, Ryouhei Shioya, Kohei Nishino, Hirotake Furihata, Atsushi Hijikata, Mika K. Kaneko, Yukinari Kato, Tsuyoshi Shirai, Hidetaka Kosako, Tatsuya Sawasaki. Proximity extracellular protein-protein interaction analysis of EGFR using AirID-conjugated fragment of antigen binding. Nature Communications. 2023. 14. 1
  • Tatsuro Nishikino, Atsushi Hijikata, Seiji Kojima, Tsuyoshi Shirai, Masatsune Kainosho, Michio Homma, Yohei Miyanoiri. Changes in the hydrophobic network of the FliGMC domain induce rotational switching of the flagellar motor. iScience. 2023. 26. 8. 107320-107320
  • Jun-ichi Akagi, Masayuki Yokoi, Yumi Miyake, Tsuyoshi Shirai, Tomohiro Baba, Young-Man Cho, Fumio Hanaoka, Kaoru Sugasawa, Shigenori Iwai, Kumiko Ogawa. A formamidopyrimidine derivative from the deoxyguanosine adduct produced by food contaminant acrylamide induces DNA replication block and mutagenesis. Journal of Biological Chemistry. 2023. 105002-105002
  • Takahiro Hayashi, Naoko Yano, Kengo Kora, Atsushi Yokoyama, Kanako Maizuru, Taisei Kayaki, Kinuko Nishikawa, Mitsujiro Osawa, Akira Niwa, Toshiki Takenouchi, et al. Involvement of mTOR pathway in neurodegeneration in NSF-related developmental and epileptic encephalopathy. Human molecular genetics. 2023. 32. 10. 1683-1697
  • Yasuhiro Isogai, Hiroshi Imamura, Tomonari Sumi, Tsuyoshi Shirai. Improvement of Protein Solubility in Macromolecular Crowding during Myoglobin Evolution. Biochemistry. 2022
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MISC (57件)：
  • 小川智久, 中江摂, LAKUDZALA Agness Ethel, 永沼孝子, 村本光二, 比江森恵子, 平林淳, 舘野浩章, 塩生真史, 白井剛. マベ真珠由来ジャカリン様レクチンのX線構造解析による立体構造と糖鎖認識能の解明. 日本糖質学会年会要旨集. 2018. 37th. 108
  • 真柳浩太, 沖啓輔, 石野園子, 宮崎直幸, 岩崎憲治, 神田大輔, 白井剛, 石野良純. PolD-PCNA-DNA複合体の単粒子解析. 日本生化学会大会(Web). 2017. 90th. ROMBUNNO.2P-0585 (WEB ONLY)-0585]
  • Hirokazu Nishida, Yoda Takuya, Maiko Tanabe, Toshiyuki Tsuji, Takao Yoda, Tsuyoshi Shirai, Haruko Takeyama, Yoshizumi Ishino. Exonuclease processivity of archaeal replicative DNA polymerase in association with PCNA is expedited by mismatches in DNA. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2016. 91. 6. 367-367
  • 真柳 浩太, 石野 園子, 高藤 三加, 光岡 薫, 白井 剛, 清成 信一, 西田 洋一, 神田 大輔, 森川 耿右, 石野 良純. 分子認識と環境応答における分子機構解明を目指す電子顕微鏡学 単粒子解析により明らかにされたreplisomeの切り替え機構(Switching mechanism of the replisome as revealed by single particle analysis). 日本生化学会大会プログラム・講演要旨集. 2016. 89回. [1S13-4]
  • Hirokazu Nishida, Takuya Yoda, Maiko Tanabe, Tsuyoshi Shirai, Haruko Takeyama, Yoshizumi Ishino. Effects of the PCNA-DNA interactions on the DNA polymerase/exonuclease reactions by archaeal replicative DNA polymerase. GENES & GENETIC SYSTEMS. 2015. 90. 6. 388-388
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特許 (3件)：
  • 耐熱性ミスマッチエンドヌクレアーゼ変異体
  • 高速グラフマッチ検索装置及び方法
  • 耐熱性ミスマッチエンドヌクレアーゼの利用方法
書籍 (7件)：
  • データサイエンス入門
    学術図書出版社 2019 ISBN:9784780607017
  • The Encyclopedia of Bioinformatics and Computational Biology
    Elsevier 2018
  • タンパク質の立体構造入門 : 基礎から構造バイオインフォマティクスへ
    講談社 2010 ISBN:9784061538818
  • Experimental glycoscience
    Springer-Verlag 2008 ISBN:9784431779230
  • Protein Adaptation in Extremophiles
    Nova Science Publishers Inc. 2008 ISBN:9781604560190
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講演・口頭発表等 (20件)：
  • バイオインフォマティクスによる古代遺伝子の再現と機能解析
    (生命・自然科学における複雑現象解明のための統計的アプローチ 2018)
  • 水棲哺乳類ミオグロビンの分子進化:二つの適応戦略
    (第56回日本生物物理学会年会 2018)
  • マベガイ真珠由来ジャッカリン関連レクチンのX線構造解析による立体構造の解明と糖鎖認識機構
    (第12回東北糖鎖研究会 2018)
  • マベ真珠由来ジャカリン様レクチンのX線構造解析による立体構造と糖鎖認識能の解明
    (第37回日本糖質学会年会 2018)
  • 海洋哺乳類ミオグロビンの分子進化:自然はどのようにして高溶解度で安定な蛋白質を作り出したか?
    (第5回富山・バーゼル医薬品研究開発シンポジウム 2018)
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学位 (1件)：
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経歴 (3件)：
  • 長浜バイオ大学バイオサイエンス学科 教授
  • 生物分子工学研究所 主任研究員
  • 名古屋大学工学研究科 助手
委員歴 (3件)：
  • 2018/04 - 現在 筑波大学計算科学研究センター 運営協議会委員
  • 2014/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 評議員 幹事 会長補佐
  • 2009 - 日本バイオインフォマティクス学会 幹事
所属学会 (4件)：
日本バイオインフォマティクス学会 ,  日本結晶学会 ,  日本分子生物学会 ,  日本生物物理学会
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