- 2018 - 2021 海藻類バイオマーカーを用いた沿岸環境汚染の診断法の開発
- 2016 - 2019 分子系統地理学的解析で探る最終氷期における日本周辺の海藻植生と日本海の海況の変遷
- 2013 - 2016 ゲノム情報と形態形質進化から探るコンブ目植物による「海の森」の成立
- 2011 - 石灰化大型海藻類の遺伝的多様性と地球規模環境変動に対する脆弱性に関する研究
- 2010 - 細胞微細構造・細胞壁多糖およびゲノム情報で探る褐藻類多細胞進化の鍵
- 2009 - 研究開発「藻類の収集・保存・提供一付加価値向上と品質管理体制整備」
- 2007 - 大型船舶のバラスト水・船体付着で越境移動する海洋生物の動態把握と定着の早期検出
- 2007 - 藻類の収集・保存・提供一付加価値向上と品質管理体制整備
- 2006 - 管状マスチゴネマの起源の探索とその多様性から見たクロミスタ系統群の進化系統
- 2006 - 褐藻イソガワラ目の分子系統分類と生物地理に関する研究
- 2005 - 細胞微細構造,光合成色素と分子系統から探る褐藻類の初期進化と高次系統
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