研究者
J-GLOBAL ID:200901047306085004   更新日: 2024年04月22日

YING BEIWEN

イン ベイウェン | YING BEIWEN
所属機関・部署:
職名: 准教授
ホームページURL (1件): https://www.u.tsukuba.ac.jp/~ying.beiwen.gf/index.html
研究分野 (7件): 生命、健康、医療情報学 ,  計算科学 ,  生態学、環境学 ,  応用微生物学 ,  進化生物学 ,  システムゲノム科学 ,  分子生物学
研究キーワード (7件): バイオインフォマティクス ,  機械学習 ,  細胞培養 ,  遺伝子発現 ,  実験進化 ,  ゲノム縮小 ,  細胞増殖
競争的資金等の研究課題 (11件):
  • 2021 - 2023 細胞培養のデータ駆動型最適化の基盤技術の開発
  • 2021 - 2022 ラクトバチルス菌検査キットの培養速度の向上
  • 2019 - 2022 ゲノム縮小と増殖速度の相関の機構解明
  • 2020 - 2021 細胞培養(培地)の最適化プラットフォームの開発
  • 2014 - 2016 極限貧栄養環境下で増殖する細胞の創出
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論文 (71件):
  • HITOMI, Kenya, ISHII, Yoichiro, YING, BEIWEN. Experimental evolution for the recovery of growth loss due to genome reduction. eLife. 2024
  • HASHIZUME, Takamasa, YING, BEIWEN. Challenges in developing cell culture media using machine learning. BIOTECHNOLOGY ADVANCES. 2024. 70
  • HITOMI, Kenya, ISHII, Yoichiro, YING, BEIWEN. Diversity for commonality in the evolutionary changes of the reduced genome to regain the growth fitness. eLife. 2024
  • ZHANG, Shuyang, AIDA, Honoka, YING, BEIWEN. Employing Active Learning in Medium Optimization for Selective Bacterial Growth. Applied Microbiology. 2023. 3. 4. 1355-1369
  • ZHANG, Shuyang, AIDA, Honoka, YING, BEIWEN. Active learning for medium optimization for selective bacterial culture. bioRxiv. 2023
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MISC (2件):
  • Kashiwagi Akiko, Sakurai Takahiro, Tsuru Saburo, Ying Bei-Wen, Mori Kotaro, Yomo Tetsuya. FM-P1 Construction of Escherichia coli gene expression level perturbation collection(Section VIII Fermentation and Microbial Technology). Journal of bioscience and bioengineering. 2009. 108. 1. S118-S119
  • Tsuru Saburo, Ying Bei-Wen, Mori Kotaro, Ushioda Junya, Kashiwagi Akiko, Yomo Tetsuya. 2P-143 栄養枯渇に対する適応応答における遺伝子発現の確率性(細胞生物的課題(接着,運動,骨格,伝達,膜),第47回日本生物物理学会年会). 生物物理. 2009. 49. 0
特許 (5件):
  • 培養環境判定システム、培養装置、要求取得装置及びプログラム
  • 培養環境判定装置、培養システム、培養環境判定方法、培養方法、及びプログラム
  • 微生物培養用合成培地及び微生物の培養方法
  • 培養環境判定装置、培養環境判定方法、及びプログラム
  • リボソームディスプレイ
書籍 (4件):
  • Stress and Environmental Regulation of Gene Expression and Adaptation in Bacteria
    2016 ISBN:9781119004882
  • Advances in Applied Biotechnology
    2012
  • Protein Engineering Handbook
    2009
  • Cell-Free Expression
    2007
講演・口頭発表等 (77件):
  • 細菌の増殖を特徴づける化学成分の機械学習支援型探索
    (日本農芸化学会2024年度東京大会)
  • 細菌の多剤耐性に影響を与える化学成分の網羅的探索
    (日本農芸化学会2024年度東京大会)
  • 機械学習による微生物の選択的増殖の培地開発
    (日本農芸化学会2024年度東京大会)
  • 大腸菌増殖を特徴づける遺伝的要件と化学環境の横断的探索
    (日本ゲノム微生物学会第18回大会)
  • Compensation of medium composition to genome reduction
    (日本ゲノム微生物学会第18回大会)
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学歴 (1件):
  • 2000 - 2005 東京大学 新領域創成科学研究科
学位 (1件):
  • 博士(生命科学) (東京大学)
経歴 (4件):
  • 2013 - 現在 筑波大学 准教授
  • 2007 - 2013 大阪大学 助教、特任准教授
  • 2006 - 2007 フランス国立科学研究センター 研究員
  • 2005 - 2006 東京大学 リサーチフェロ-
委員歴 (5件):
  • 2023 - 現在 Biology Editorial Board Member
  • 2020 - 現在 BMC Microbiology Editorial Board Member
  • 2019 - 現在 Scientific reports (Nature Publishing Group) Editorial Board Member
  • 2018 - 現在 Frontiers in Microbiology Associate Editor
  • 2015 - 2021 日本ゲノム微生物学会 評議員
所属学会 (3件):
日本農芸化学会 ,  日本微生物生態学会 ,  日本ゲノム微生物学会
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