研究者
J-GLOBAL ID:200901049131219137   更新日: 2024年10月03日

加藤 有己

カトウ ユウキ | Kato Yuki
所属機関・部署:
職名: 准教授
その他の所属(所属・部署名・職名) (1件):
  • 大阪大学  先導的学際研究機構 生命医科学融合フロンティア研究部門   准教授
ホームページURL (2件): https://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/rna/ykato/https://www.med.osaka-u.ac.jp/pub/rna/ykato/en/
研究分野 (3件): システムゲノム科学 ,  生命、健康、医療情報学 ,  情報学基礎論
研究キーワード (3件): バイオインフォマティクス ,  シングルセルゲノミクス ,  RNA配列情報解析
競争的資金等の研究課題 (18件):
  • 2024 - 2028 細胞集団の時空間アラインメント法の確立
  • 2024 - 2027 高効率な点変異置換型RNA編集を可能にするアンチセンス核酸の開発
  • 2023 - 2026 RNA編集不全に起因する自己免疫性脳症発症メカニムズの解明
  • 2023 - 2026 脳構成細胞の解析技術の基盤構築に基づく神経変性・修復機構の解明研究
  • 2022 - 2025 修飾塩基を含むRNAの二次構造解析技術の確立
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論文 (34件):
  • Kyoka Higuchi, Akiko Uyeda, Lili Quan, Shogo Tanabe, Yuki Kato, Yukio Kawahara, Rieko Muramatsu. Synaptotagmin 4 supports spontaneous axon sprouting after spinal cord injury. The Journal of Neuroscience. 2024. e1593232024-e1593232024
  • Kotaro Miyake, Pedro Henrique Costa Cruz, Izumi Nagatomo, Yuki Kato, Daisuke Motooka, Shingo Satoh, Yuichi Adachi, Yoshito Takeda, Yukio Kawahara, Atsushi Kumanogoh. A cancer-associated METTL14 mutation induces aberrant m6A modification, affecting tumor growth. Cell Reports. 2023. 42. 7. 112688-112688
  • Yanfang Xing, Taisuke Nakahama, Yuke Wu, Maal Inoue, Jung In Kim, Hiroyuki Todo, Toshiharu Shibuya, Yuki Kato, Yukio Kawahara. RNA editing of AZIN1 coding sites is catalyzed by ADAR1 p150 after splicing. Journal of Biological Chemistry. 2023. 104840-104840
  • Reiichi Sugihara, Yuki Kato, Tomoya Mori, Yukio Kawahara. Alignment of single-cell trajectory trees with CAPITAL. Nature Communications. 2022. 13. 1. 5972
  • Maal Inoue, Taisuke Nakahama, Ryuichiro Yamasaki, Toshiharu Shibuya, Jung In Kim, Hiroyuki Todo, Yanfang Xing, Yuki Kato, Eiichi Morii, Yukio Kawahara. An Aicardi-Goutières Syndrome-Causative Point Mutation in Adar1 Gene Invokes Multiorgan Inflammation and Late-Onset Encephalopathy in Mice. The Journal of Immunology. 2021. ji2100526-ji2100526
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MISC (30件):
  • 杉原 礼一, 加藤 有己, 河原 行郎. グラフ埋め込みに基づく空間オミクス解析手法の開発. NGS EXPO 2024. 2024
  • Reiichi Sugihara, Yuki Kato, Yukio Kawahara. A graph embedding approach to spatial omics analysis. 第4回関西RNAクラブ. 2024
  • Reiichi Sugihara, Yuki Kato, Yukio Kawahara. A random walk approach to cluster and integrate spatial transcriptomics data. 第25回日本RNA学会年会. 2024
  • Hyebin Yoo, Taisuke Nakahama, Yuki Kato, Yukio Kawahara. Elucidation of the pathogenic mechanism underlying Aicardi-Goutieres syndrome-like encephalopathy caused by mutations in the RNA-editing enzyme ADAR1. 第25回日本RNA学会年会. 2024
  • 杉原 礼一, 加藤 有己, 河原 行郎. グラフ埋め込みと最適輸送を用いた空間的遺伝子発現情報のアラインメント. 第77回情報処理学会バイオ情報学研究会. 2024
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学位 (1件):
  • 博士(工学) (奈良先端科学技術大学院大学)
経歴 (13件):
  • 2022/04 - 現在 大阪大学 先導的学際研究機構 生命医科学融合フロンティア研究部門 准教授
  • 2022/04 - 現在 大阪大学 大学院医学系研究科 医学専攻 准教授
  • 2020/10 - 2022/03 大阪大学 医学部 学部内講師
  • 2020/09 - 2022/03 大阪大学 先導的学際研究機構 生命医科学融合フロンティア研究部門 助教
  • 2016/04 - 2022/03 大阪大学 大学院医学系研究科 医学専攻 助教
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委員歴 (12件):
  • 2023/04 - 現在 情報処理学会 学会論文誌運営委員会 The Editorial Committee of IPSJ Transactions on Bioinformatics (TBIO)
  • 2023/04 - 現在 情報処理学会 調査研究運営委員会 バイオ情報学研究運営委員会 幹事
  • 2020/04 - 2023/03 情報処理学会 調査研究運営委員会 バイオ情報学研究運営委員会 運営委員
  • 2019/04 - 2023/03 情報処理学会 The Editorial Committee of IPSJ Transactions on Bioinformatics (TBIO) 副委員長
  • 2015/04 - 2019/03 情報処理学会 調査研究運営委員会 バイオ情報学研究運営委員
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受賞 (5件):
  • 2012/03 - 2011年度情報処理学会山下記念研究賞
  • 2009/12 - 2009 Oxford Journals - Japanese Society for Bioinformatics Prize (GIW2009 Best Poster Award)
  • 2008/12 - 2006年度バイオ情報学研究会論文賞
  • 2008/05 - 平成19年度情報処理学会論文賞
  • 2007/03 - 2006年度IPSJ Digital Courier船井若手奨励賞
所属学会 (2件):
情報処理学会 ,  International Society for Computational Biology (ISCB)
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