研究者
J-GLOBAL ID：200901050268195802   更新日: 2024年02月27日

舟橋 啓

フナハシ アキラ | Funahashi Akira
所属機関・部署：
慶應義塾 理工学部 生命情報学科

慶應義塾 理工学部 生命情報学科 について


職名： 教授
ホームページURL (1件)： https://fun.bio.keio.ac.jp/
研究分野 (2件)： 生命、健康、医療情報学 ,  システムゲノム科学
研究キーワード (3件)： 計算生物学 ,  定量生物学 ,  システム生物学
競争的資金等の研究課題 (24件)：
  • 2022 - 2028 先端バイオイメージング支援プラットフォーム
  • 2022 - 2026 極限的な乾燥耐性を実現させるゲノム保護・修復機構の解明
  • 2020 - 2026 構造的・動力学的制約を活用した多元混合化学情報の解読とその応用
  • 2021 - 2026 機械学習を用いた精巣組織培養の自動最適化による精子形成の理解
  • 2020 - 2023 深層学習を用いた細胞追跡アルゴリズムの開発
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論文 (126件)：
  • Anna Niarakis, Marek Ostaszewski, Alexander Mazein, Inna Kuperstein, Martina Kutmon, Marc E. Gillespie, Akira Funahashi, Marcio Luis Acencio, Ahmed Hemedan, Michael Aichem, et al. Drug-target identification in COVID-19 disease mechanisms using computational systems biology approaches. Frontiers in Immunology. 2024. 14
  • Shohei Tada, Yoshitaka Yamazaki, Kazunori Yamamoto, Ken Fujii, Takahiro G. Yamada, Noriko F. Hiroi, Akatsuki Kimura, Akira Funahashi. Switching from weak to strong cortical attachment of microtubules accounts for the transition from nuclear centration to spindle elongation in metazoans. Heliyon. 2024. 10. 3. e25494-e25494
  • James C. Schaff, Anuradha Lakshminarayana, Robert F. Murphy, Frank T. Bergmann, Akira Funahashi, Devin P. Sullivan, Lucian P. Smith. SBML Level 3 Package: Spatial Processes, Version 1, Release 1. Journal of Integrative Bioinformatics. 2023
  • Chikahiro Imashiro, Yangyan Jin, Motoaki Hayama, Takahiro G. Yamada, Akira Funahashi, Katsuhisa Sakaguchi, Shinjiro Umezu, Jun Komotori. Titanium Culture Vessel Presenting Temperature Gradation for the Thermotolerance Estimation of Cells. Cyborg and Bionic Systems. 2023. 4
  • Anna Niarakis, Marek Ostaszewski, Alexander Mazein, Inna Kuperstein, Martina Kutmon, Marc E. Gillespie, Akira Funahashi, Marcio Luis Acencio, Ahmed Hemedan, Michael Aichem, et al. A Versatile and Interoperable Computational Framework for the Analysis and Modeling of COVID-19 Disease Mechanisms. 2022
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MISC (59件)：
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書籍 (8件)：
  • 機械学習を生命科学に使う! : シークエンスや画像データをどう解析し、新たな生物学的発見につなげるか?
    羊土社 2020 ISBN:9784758103916
  • 数でとらえる細胞生物学
    羊土社 2020 ISBN:9784758121064
  • 組織としての生命
    慶應義塾大学出版会 2019
  • バイオインフォマティクス入門
    慶應義塾大学出版会 2015
  • Modeling and Simulation Using CellDesigner
    Springer 2014 ISBN:9781493908042
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講演・口頭発表等 (70件)：
  • 深層学習が駆動する定量生物学の新展開
    (データ駆動生物学ワークショップ 2021)
  • CellDesigner: A modeling tool for biochemical networks
    (Computational Modeling in Biology Network 2020 (COMBINE 2020) 2020)
  • 一細胞系譜解析による低グルコース培養下大腸菌集団のATP濃度多様性の解明
    (日本数理生物学会 2020年度 年会 2020)
  • ライブセルイメージングと深層学習を用いた 胚発生過程定量システムの構築
    (第81回応用物理学会秋季学術講演会 2020)
  • 深層学習を用いたマウス発生過程における定量的指標の獲得
    (第30回日本サイトメトリー学会学術集会 2020)
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学歴 (3件)：
  • 2000 - 2000 慶應義塾大学 理工学研究科 計算機科学専攻
  • 1997 - 1997 慶應義塾大学 理工学研究科 計算機科学専攻
  • 1995 - 1995 慶應義塾大学 理工学部 電気工学科
学位 (1件)：
  • 博士(工学) (慶應義塾大学)
経歴 (13件)：
  • 2022/04 - 現在 慶應義塾大学理工学部生命情報学科 教授
  • 2017/04 - 現在 山口大学大学院 医学系研究科 医学系研究科 非常勤講師
  • 2007/04 - 現在 システム・バイオロジー研究機構(SBI) 客員研究員
  • 2020/08 - 2023/03 群馬大学 数理データ科学教育研究センター 客員教授
  • 2009/04 - 2022/03 慶應義塾大学理工学部生命情報学科准教授
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委員歴 (19件)：
  • 2023/04 - 現在 日本学術振興会 学術変革領域研究(B) スケール横断分析 アドバイザー
  • 2020/05 - 現在 Google Summer of Code 2020 Google Summer of Code Mentors
  • 2019/04 - 現在 科学技術振興機構 JST未来事業「共通基盤」領域 専門アドバイザー
  • 2011/02 - 現在 Frontiers Frontiers in Systems Biology Associate Editor
  • 2008 - 現在 定量生物学の会 定量生物学の会 コアメンバー
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受賞 (1件)：
  • 2015/10 - 日本学術振興会 平成27年度科学研究費審査委員表彰
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