研究者
J-GLOBAL ID:200901050764823848   更新日: 2024年04月11日

小柳 香奈子

コヤナギ カナコ | Koyanagi Kanako
所属機関・部署:
職名: 准教授
ホームページURL (1件): https://www.ist.hokudai.ac.jp/div/bio/en/laboratories/genome-science/
研究分野 (3件): システムゲノム科学 ,  進化生物学 ,  ゲノム生物学
研究キーワード (13件): 系統解析 ,  エピジェネティクス ,  細胞系譜 ,  細胞分化 ,  イネ ,  ヒト ,  ウイルス ,  比較ゲノム解析 ,  ゲノム構造 ,  発現制御 ,  分子進化 ,  進化 ,  ゲノム
競争的資金等の研究課題 (12件):
  • 2022 - 2025 細胞分化にともなうエピゲノム変遷過程の単一細胞解像度での推定
  • 2016 - 2020 体細胞ヒストン修飾情報の系統解析によるヒトの細胞系譜および細胞分化過程の推定
  • 2013 - 2017 体細胞エピゲノム情報の系統解析による哺乳類の細胞系譜および細胞分化過程の推定
  • 2014 - 2016 ゲノムに潜む鎮痛ペプチド・エンドモルフィンは酸化ストレスのRNA編集で誕生する
  • 2013 - 2016 地域の育種集団におけるFNPsハプロタイプを用いた高速ゲノム育種法の開発
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論文 (44件):
  • Kanako O Koyanagi. Inferring chromatin accessibility during murine hematopoiesis through phylogenetic analysis. BMC research notes. 2023. 16. 1. 222-222
  • Nozomi Saito, Sunlu Chen, Katsuya Kitajima, Zhitong Zhou, Yohei Koide, Jaymee R Encabo, Maria Genaleen Q Diaz, Il-Ryong Choi, Kanako O Koyanagi, Yuji Kishima. Phylogenetic analysis of endogenous viral elements in the rice genome reveals local chromosomal evolution in Oryza AA-genome species. Frontiers in plant science. 2023. 14. 1261705-1261705
  • Sunao Sugita, Yoshihiko Usui, Hidemi Watanabe, Laura Panto, Miyabi Iida, Keisuke Suginoshita, Kanako O Koyanagi, Akihiro Nishida, Yasuo Kurimoto, Masayo Takahashi, et al. Adenovirus-associated uveitis with necrotizing retinitis. Ophthalmology. 2022. 130. 4. 443-445
  • Fujino Kenji, Kawahara Yoshihiro, Koyanagi Kanako O., Shirasawa Kenta. Translation of continuous artificial selection on phenotype into genotype during rice breeding programs. Breeding Science. 2021. 71. 2. 125-133
  • Kanako O. Koyanagi. Inferring changes in histone modification during cell differentiation by ancestral state estimation based on phylogenetic trees of cell types: Human hematopoiesis as a model case. Gene. 2019. 721S. 100021-100021
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MISC (72件):
  • 周止桐, 川原善浩, 渡邉日出海, 小柳香奈子. Inferring the evolutionary origins of mutations involved in rice domestication in Japan. 日本分子生物学会年会. 2023
  • 小柳香奈子. オープンクロマチン情報の系統解析による細胞分化過程の推定. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2023. 95th (CD-ROM)
  • 和島史明, 小柳香奈子, 渡邉日出海. 疾患関連一塩基多型の民族間不均一分布に関する分析. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • 杉之下景介, 小柳香奈子, 渡邊日出海. 長鎖DNA全長の配列非依存定温増幅法の開発. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2022. 45th
  • 藤原 遼人, 小柳 香奈子, 渡邉 日出海. 霊長類北限環境に生息するニホンザルの排泄物メタゲノム解析による食性の解明. 霊長類研究 Supplement. 2022. 38. 64
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書籍 (1件):
  • 進化-分子・個体・生態系
    メディカルサイエンスインターナショナル 2009 ISBN:4895926214
講演・口頭発表等 (17件):
  • 比較ゲノム解析によるO. sativa ssp. japonicaとイネ属AAゲノム種のイントログレッション領域の探索
    (日本育種学会第145回講演会 2024)
  • オミクス情報の系統解析による細胞分化過程推定の可能性
    (第46回日本分子生物学会年会 フォーラム1F-15「ゲノム起源を討論する学問所」 2023)
  • オープンクロマチン情報の系統解析による細胞分化過程の推定
    (日本遺伝学会第95回大会 2023)
  • エピゲノム情報の系統解析による細胞分化過程の推定
    (遺伝研研究集会「生命科学を支える分子系統学」 2022)
  • Inferring cell differentiation processes based on phylogenetic analysis of epigenomes
    (The 24th Hokkaido University - Seoul National University Joint Symposium 2021)
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学位 (1件):
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (6件):
  • 2019 - 現在 北海道大学 大学院情報科学研究院 准教授
  • 2007 - 2019 北海道大学 大学院情報科学研究科 准教授
  • 2004 - 2007 北海道大学 大学院情報科学研究科 助教授
  • 2003 - 2004 奈良先端科学技術大学院大学 情報科学研究科 助手
  • 2001 - 2003 生物情報解析研究センター 特別研究員
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委員歴 (3件):
  • 2021 - 2022 日本遺伝学会第94回大会実行委員
  • 2016 - 2019 日本進化学会 2019年大会準備委員
  • 2016 - 2017 IIBMP2017 実行委員
受賞 (2件):
  • 2021 - 公益財団法人 秋山記念生命科学振興財団 研究助成〈一般〉 リアルタイム選別による未知DNA配列解読-北海道イネゲノム難解読領域への応用-
  • 2005 - 日本遺伝学会 第77回日本遺伝学会BP賞 脊椎動物特異的なゲノム構造進化の発見
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