- 2022 - 2025 細胞分化にともなうエピゲノム変遷過程の単一細胞解像度での推定
- 2016 - 2020 体細胞ヒストン修飾情報の系統解析によるヒトの細胞系譜および細胞分化過程の推定
- 2013 - 2017 体細胞エピゲノム情報の系統解析による哺乳類の細胞系譜および細胞分化過程の推定
- 2014 - 2016 ゲノムに潜む鎮痛ペプチド・エンドモルフィンは酸化ストレスのRNA編集で誕生する
- 2013 - 2016 地域の育種集団におけるFNPsハプロタイプを用いた高速ゲノム育種法の開発
- 2010 - 2015 ゲノム配列解析に基づく突然変異発生特性と適応進化の解明
- 2012 - 2013 エピゲノミクスとファイロゲノミクスの融合による哺乳類細胞系譜再構築の試み
- 2010 - 2012 イネ属ゲノムに取り込まれたウイルス配列の機能探索イネツングロ病に着目して
- 2006 - 2008 ヒト染色体間の相互作用情報の抽出と染色体の核内配置との関連性に関する研究
- 2006 - 2007 比較ゲノム解析に基づくヒト固有遺伝情報の同定と機能推定
- 2004 - 2005 ヒトゲノム構造にみられる遺伝子位置の偏りの意義とその進化過程に関する研究
- 2004 - 2004 ゲノム配列の種間・種内比較に基づく進化過程の推定
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