- 2016 - 2019 細胞の生存 - 自然界における大腸菌の場合
- 2015 - 2017 放線菌染色体まるごと移動技術の確立
- 2013 - 2016 放線菌の接合伝達機構解明と人為的高速ゲノム進化への応用
- 2013 - 2016 長期定常期から分裂再開までの細胞の生存戦略
- 2012 - 2016 シナプス前性タンパク質のリン酸化による脳の機能制御機構の解明
- 2013 - 2015 接合伝達を利用した遺伝子移動システムの構築
- 2012 - 2014 放線菌線状ゲノムを利用したゲノムスワップへの挑戦
- 2011 - 2013 放線菌での二次代謝系操作に適した新規ゲノム操作システムの構築
- 2009 - 2011 放線菌遺伝子水平移動機構の解明
- 2009 - 2011 シナプス前性タンパク質のリン酸化による脳機能制御機構の解明
- 2006 - 2008 シナプス前性タンパク質のリン酸化によるシナプスおよび脳機能の制御機構の解明
- 2003 - 2007 グリア細胞における化学伝達物質およびそのレセプターの制御機構の解明
- 2004 - 2005 可溶性タンパク質のシナプス前部特異的局在機構
- 2003 - 2005 脳内サイトカインや増殖因子によるシナプス伝達制御機構の解明
- 2002 - 2003 活動依存的シナプス前機能形成機構の解明
- 微生物の進化メカニズム;ゲノム再編成機構;可視化生命科学;新規生物現象の解明;合成生物学
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