- 2020 - 2023 淡水資源のヒ素汚染対策における嫌気性ヒ素酸化細菌の有用性の評価
- 2020 - 2023 光合成進化の鍵を握る新規クロロフレキサスの生理生態学的研究
- 2018 - 2022 多雪寒冷地域の湿原生態系におけるメタン動態の解明
- 2012 - 2016 亜熱帯湖沼のメタン栄養食物網と炭素リサイクル機能の評価
- 2011 - 2015 極限環境下の生物多様性-モデルサイトとしての南極湖沼
- 2012 - 2014 GenBankデータに基づく全球スケールでの微生物多様性分布の解明
- 2010 - 2014 環境オミクス手法による寒冷圏水界の微生物学的硫黄循環の解明
- 2008 - 2010 北方森林土壌において温暖化が及ぼす微生物と原生生物の群集構造変化と連鎖関係
- 2006 - 2009 南北両極の微生物相の多様性と系統に関する調査研究-国際極年計画の中核として
- 2006 - 2009 大規模環境変動に対する極域湖沼生態系の応答機構
- 2004 - 2007 水界の硫黄循環システムと微生物群集の共進化に関する分子生態学的研究
- 2000 - 2002 水圏生態系における硫黄代謝関連微生物への分子生態学的アプローチ
- 低温環境における物質循環に関わる微生物の生理生態学的研究
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