- 2020 - 2024 概日リズムの撹乱に由来する植物生育不安定性とノンパラメトリック栽培環境最適化
- 2022 - 2024 概日時計サイレンシング法を用いた滞在性微弱シグナル環境におけるリズム変調の解明
- 2021 - 2024 生物時計の同調あるいは撹乱による収穫後青果物の品質制御
- 2020 - 2022 位相応答曲線の高速同定法による植物の環境応答と発生の時空間統合モデルの構築
- 2020 - 2022 植物概日時計における位相特異点群の自発生成と内部ノイズ定量化
- 2016 - 2019 無相関多元環境栽培試験による環境応答モデルの高速同定
- 2017 - 2019 植物個体別の成長解析に基づく収量予測および生産安定化技術
- 2015 - 2019 精密環境オミクスデータに基づく植物生産不安定性の解明
- 2015 - 2018 野生トランスクリプトームの数理モデリングと植物工場による再現
- 2014 - 2018 注入同期の実現可能限界を達成する最適設計論の確立および応用開拓
- 2015 - 2017 脱分化を誘起する体内時計のトポロジカル同期制御
- 2013 - 2016 細胞から個体までの全階層を繋ぐ包括的代謝制御体系「体内時計制御工学」の基盤研究
- 2015 - 2016 体内時計のトポロジカルチャージによる植物の脱分化現象の解明
- 2013 - 2015 体内時計の同調臨界点における代謝不安定化機構のオミクス解析と数理モデル
- 2014 - 2015 次世代水素社会の実現
- 2013 - 2015 植物工場における超高速環境パラメータ最適化手法の開発
- 2013 - 2015 成長点の体内時計が自発形成する脱同期パターンの物理特性と生理機能の解明
- 2011 - 2014 変分解析を軸とした同期・引き込み最適化アルゴリズムの開拓と現実的問題への応用
- 2011 - 2013 遺伝子発現診断制御技術を搭載した高機能植物工場システムの開発
- 2009 - 2013 体内時計に見る植物システムの創発原理
- 2011 - 2013 振動子ネットワークによる概日リズムの定量的数理モデルの構築とその制御への応用
- 2006 - 2011 医・農・工融合によるヒトチオレドキシン1産生レタスの生産技術の開発
- 2010 - 2011 サーカディアン共鳴現象の解明と応用による高機能組換えレタスの高生産
- 2009 - 2010 数理モデルに基づく植物概日リズムの制御技術の開発と植物工場への応用
- 2008 - 2010 振動子ネットワークによるSCNニューロンのモデル化とその概日リズムへの応用
- 2008 - 2009 定量的数理方程式の構築による植物概日リズムの解明とその植物工場への応用
- 2008 - 2009 植物の時計細胞ネットワークに生じたスパイラルパターンのマルチスケール解析
- 2007 - 2009 植物振動子ネットワークにおける位相特異点群の生成消滅ダイナミクス
- 2006 - 2008 アクティブ緑化技術を用いた「緑の都市風」創生構想
- 2003 - 2004 リズム形成における振動子群の引き込みと確率同期現象
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