近藤次郎

コンドウジロウ | Jiro Kondo

所属機関・部署：
職名：教授
ホームページURL (1件)： https://jkondo.wixsite.com/sophia-biophysics

研究分野 (3件)：薬系分析、物理化学 , 生物物理学 , 構造生物化学

研究キーワード (5件)： X線結晶解析 , 薬剤耐性 , 抗生物質 , 生体機能応用デバイス , 物理系薬学

競争的資金等の研究課題 (37件)：

2022 - 2027 RNAターゲット創薬のためのRNA分子設計・共結晶化・試料調製支援と高度化
2024 - 2026 疾病関連マイクロRNAと低分子リガンド複合体の立体構造解析
2023 - 2026 分子レベルの構造生物模倣科学による新しいコンセプトの核酸医薬品の開発
2023 - 2026 アナログ分子模型・デジタル画像処理融合型分子モデリングツールの開発
2023 - 2025 蛍光性DNA-銀ナノクラスターのX線結晶解析

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論文 (118件)：

Kai Kosugi, Ayano Sugawara, Erika Iwase, HeeJu Park, Shoji Fujiwara, Hiroki Kanazawa, Akira Ono, Jiro Kondo. Gold-Mediated Base Pairs in Nucleic Acids: Selective Coordination to Natural and Thiocarbonyl-Modified Cytosines Dependent upon the Oxidation State of Gold. Chembiochem : a European journal of chemical biology. 2025. e202500565
Juanjuan Ye, Futoshi Suizu, Keiko Yamakawa, Hiroyuki Yoneyama, Jiro Kondo, Motohiko Kato, Akira Nishiyama, Naohisa Yahagi, Kyuichi Kadota. Stromal modifying CHST15 siRNA enhances antitumor effect synergistically with anti-PD-1 immune checkpoint antibody in murine pancreatic cancer. Scientific reports. 2025. 15. 1. 20365-20365
Hidetaka Torigoe, Kei Hirabayashi, Saki Adachi, Jiro Kondo. Novel specific binding of copper ions to naturally modified base pairs involving 5-fluorouracil in duplex DNA. Dalton Transactions. 2025. 54. 7208-7213
Takahiro Atsugi, Shoji Fujiwara, Jiro Kondo, Akira Ono. Synthesis and Metal - Ion Binding Properties of Duplexes Containing Thymine Analogs with 1,2 - Diamine Groups. ChemBioChem. 2025. e2500017
Takumi Miyauchi, Kanna Yamaguchi, Satomi Saisu, Jiro Kondo. Structure-based design of a sequence-specific RNA probe that mimics the kink-turn motif. NAR Molecular Medicine. 2025. 2. 1. ugaf006

MISC (12件)：

近藤次郎. 立体構造解析に基づく核酸医薬品設計技術. 月刊バイオインダストリー. 2018. 35. 3. 56-64
大樂武範, 古板恭子, 佐藤一, 小野哲也, 吉田健太郎, 柏木良友, 中島勝幸, 近藤次郎, 根東義則, 小野晶, et al. 多核NMR分光法によるメタロ塩基対の構造決定. 日本薬学会年会要旨集(CD-ROM). 2018. 138th
近藤次郎. DNAナノメディシンのStructure-Based Design (特集ナノメディシンの研究開発と応用). 化學工業. 2016. 67. 11. 828-836
近藤次郎. DNAナノメディシンのStructure-Based Design. 月刊化学工業. 2016. 27. 11. 28-36
近藤次郎. 核酸構造生物学の最前線. SOPHIA SCI-TECH 上智大学理工学振興会会報. 2016. 27. 2-7

特許 (5件)：

核酸塩基検出剤
金属イオン捕捉剤
蛍光標識核酸プローブ
特定の立体構造を誘導する人工核酸
DNA-金属ハイブリッドナノワイヤーおよびその製造方法

書籍 (10件)：

核酸医薬モダリティ・合成・分析・DDSの最新動向
NTS 2024
生体高分子結晶のX線構造解析: -実践手法と基礎理論-
丸善出版 2022 ISBN:4621307061
核酸科学ハンドブック
講談社サイエンティフィク 2020
BasePairPuzzle
StudioMIDAS 2019
Nucleic Acid Crystallography -Methods and Protocols (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), v. 1320.; Springer protocols (Series) ) "Crystallographic Studies of the Ribosomal A-Site Molecular Switches by Using Model RNA Oligomers"
Springer 2016 ISBN:9781493927623

講演・口頭発表等 (154件)：

核酸の立体構造情報を活用した核酸医薬品のデザインと開発
(一般財団法人バイオインダストリー協会創薬モダリティ基盤研究会/ 講演会 2025)
tRNA sample preparation for structural study
(Microbes & RNA 2025 2025)
RNAの立体構造の本質的な理解にむけて
(RNAインフォマティクス道場2025 2025)
BasePairPuzzle: Molecular model for understanding the concept of RNA base pairing
(29th tRNA Conference 2024)
Verification and classification of structural motifs observed in ribosomal RNA
(29th tRNA Conference 2024)

学歴 (3件)：

2001 - 2004 東京工業大学生命理工学研究科分子生命科学専攻
1999 - 2001 東京工業大学生命理工学研究科分子生命科学専攻
1995 - 1999 立命館大学理工学部生物工学科

学位 (3件)：

学士(工学) (立命館大学)
修士(理学) (東京工業大学)
博士(理学) (東京工業大学)

経歴 (6件)：

2023/04 - 現在上智大学理工学部物質生命理工学科教授
2015/04 - 2023/03 上智大学理工学部物質生命理工学科准教授
2010/04 - 2015/03 上智大学理工学部物質生命理工学科助教
2009/01 - 2010/03 ストラスブール大学博士研究員
2006/04 - 2008/12 ルイ・パスツール大学博士研究員

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受賞 (8件)：

2023/11 - 日本感性工学会かわいい感性デザイン賞 BasePairPuzzle
2022/03 - 上智大学理工学部 Attractive Lecture Award 2020 基礎生物学
2020/03/31 - 田中貴金属記念財団 2019年度「貴金属に関わる研究助成金」奨励賞貴金属とDNAを融合させたバイオ・ナノデバイスのStructure-Based Design
2018/12/18 - 上智大学理工学部 Attractive Lecture Award 2018 生物物理学
2017/12/19 - 上智大学理工学部 Attractive Lecture Award 2017 基礎生物学

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所属学会 (11件)：

日本結晶学会 , The RNA Society , 日本RNA学会 , 日本化学会 , 日本生化学会 , 日本薬学会 , 日本生物物理学会 , IS3NA (The International Society of Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids) , 日本核酸医薬学会 , 日本核酸化学会 , ホスト-ゲスト・超分子化学研究会

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