研究者
J-GLOBAL ID：200901072722483790   更新日: 2024年11月19日

近藤 次郎

コンドウ ジロウ | Jiro Kondo
所属機関・部署：
上智大学 理工学部物質生命理工学科

上智大学 理工学部物質生命理工学科 について


職名： 教授
ホームページURL (1件)： https://jkondo.wixsite.com/sophia-biophysics
研究分野 (3件)： 薬系分析、物理化学 ,  生物物理学 ,  構造生物化学
研究キーワード (5件)： X線結晶解析 ,  薬剤耐性 ,  抗生物質 ,  生体機能応用デバイス ,  物理系薬学
競争的資金等の研究課題 (36件)：
  • 2022 - 2027 RNAターゲット創薬のためのRNA分子設計・共結晶化・試料調製支援と高度化
  • 2024 - 2026 疾病関連マイクロRNAと低分子リガンド複合体の立体構造解析
  • 2023 - 2026 分子レベルの構造生物模倣科学による新しいコンセプトの核酸医薬品の開発
  • 2023 - 2026 アナログ分子模型・デジタル画像処理融合型分子モデリングツールの開発
  • 2023 - 2025 蛍光性DNA-銀ナノクラスターのX線結晶解析
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論文 (109件)：
  • Takenori Dairaku, Kanako Nozawa-Kumada, Tetsuya Ono, Kentaro Yoshida, Yoshitomo Kashiwagi, Yoshiyuki Tanaka, Jiro Kondo, Makoto Tanabe. DNA Duplex Containing Ag+-Mediated Cytosine-Cytosine Base Pairs as a Catalyst Precursor for the 4-Nitrophenol Reduction with NaBH4. Inorganic Chemistry. 2024
  • Kohei Nomura, Seongjin An, Yoshiaki Kobayashi, Jiro Kondo, Ting Shi, Hirotaka Murase, Kosuke Nakamoto, Yasuaki Kimura, Naoko Abe, Kumiko Ui-Tei, et al. Synthesis of 2′-formamidonucleoside phosphoramidites for suppressing the seed-based off-target effects of siRNAs. Nucleic Acids Research. 2024. 52. 10754-10774
  • Vanessa Rück, Vlad A. Neacșu, Mikkel B. Liisberg, Christian B. Mollerup, Park Hee Ju, Tom Vosch, Jiro Kondo, Cecilia Cerretani. Atomic Structure of a DNA-Stabilized Ag11 Nanocluster with Four Valence Electrons. Advanced Optical Materials. 2024. 12. 7. 2301928
  • 近藤次郎. RNAターゲット創薬とRNA創薬のための立体構造解析戦略. 実験医学増刊号. 2024. 42. 2. 129-135
  • Anna Gonzàlez-Rosell, Sami Malola, Rweetuparna Guha, Nery R. Arevalos, María Francisca Matus, Meghen E. Goule, Esa Haapaniemi, Benjamin B. Katz, Tom Vosch, Jiro Kondo, et al. Chloride Ligands on DNA-Stabilized Silver Nanoclusters. Journal of the American Chemical Society. 2023
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MISC (8件)：
  • 近藤次郎. 立体構造解析に基づく核酸医薬品設計技術. 月刊バイオインダストリー. 2018. 35. 3. 56-64
  • 近藤 次郎. DNAナノメディシンのStructure-Based Design (特集 ナノメディシンの研究開発と応用). 化學工業. 2016. 67. 11. 828-836
  • 近藤次郎. DNAナノメディシンのStructure-Based Design. 月刊化学工業. 2016. 27. 11. 28-36
  • 近藤次郎. 核酸構造生物学の最前線. SOPHIA SCI-TECH 上智大学理工学振興会会報. 2016. 27. 2-7
  • 近藤次郎. ノンコーディング核酸の「動き」を見て「働き」を理解する. 日本RNA学会会報. 2015. 32. 12-14
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特許 (5件)：
書籍 (10件)：
  • 核酸医薬 モダリティ・合成・分析・DDSの最新動向
    NTS 2024
  • 生体高分子結晶のX線構造解析: -実践手法と基礎理論-
    丸善出版 2022 ISBN:4621307061
  • 核酸科学ハンドブック
    講談社サイエンティフィク 2020
  • BasePairPuzzle
    StudioMIDAS 2019
  • Nucleic Acid Crystallography -Methods and Protocols (Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), v. 1320.; Springer protocols (Series) ) "Crystallographic Studies of the Ribosomal A-Site Molecular Switches by Using Model RNA Oligomers"
    Springer 2016 ISBN:9781493927623
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講演・口頭発表等 (143件)：
  • Participation Report on RNA 3D structure prediction at CASP16: Usage and limitations of AlphaFold3
    (1st Asia&Pacific Bioinformatics Joint Conference 2024)
  • How does the number of bases in loops of G-rich repeats affect the formation of G-quadruplexes and their stability?
    (XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) 2024)
  • X-ray Crystallography of Nucleic Acids by the Counter-diffusion Method in a Microgravity Environment
    (XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) 2024)
  • Educational tools for learning the three-dimensional structure of nucleic acids
    (XXV International Round Table on Nucleosides, Nucleotides and Nucleic Acids (IRT2024) 2024)
  • 2’位化学修飾核酸の導入によるsiRNAの標的特異性の向上
    (日本核酸医薬学会第9回年会 2024)
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学歴 (3件)：
  • 2001 - 2004 東京工業大学 生命理工学研究科 分子生命科学専攻
  • 1999 - 2001 東京工業大学 生命理工学研究科 分子生命科学専攻
  • 1995 - 1999 立命館大学 理工学部 生物工学科
学位 (3件)：
  • 学士(工学) (立命館大学)
  • 修士(理学) (東京工業大学)
  • 博士(理学) (東京工業大学)
経歴 (6件)：
  • 2023/04 - 現在 上智大学 理工学部 物質生命理工学科 教授
  • 2015/04 - 2023/03 上智大学 理工学部 物質生命理工学科 准教授
  • 2010/04 - 2015/03 上智大学 理工学部 物質生命理工学科 助教
  • 2009/01 - 2010/03 ストラスブール大学 博士研究員
  • 2006/04 - 2008/12 ルイ・パスツール大学 博士研究員
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受賞 (8件)：
  • 2023/11 - 日本感性工学会 かわいい感性デザイン賞 BasePairPuzzle
  • 2022/03 - 上智大学理工学部 Attractive Lecture Award 2020 基礎生物学
  • 2020/03/31 - 田中貴金属記念財団 2019年度「貴金属に関わる研究助成金」奨励賞 貴金属とDNAを融合させたバイオ・ナノデバイスのStructure-Based Design
  • 2018/12/18 - 上智大学理工学部 Attractive Lecture Award 2018 生物物理学
  • 2017/12/19 - 上智大学理工学部 Attractive Lecture Award 2017 基礎生物学
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所属学会 (11件)：
日本結晶学会 ,  The RNA Society ,  日本RNA学会 ,  日本化学会 ,  日本生化学会 ,  日本薬学会 ,  日本生物物理学会 ,  IS3NA (The International Society of Nucleosides, Nucleotides & Nucleic Acids) ,  日本核酸医薬学会 ,  日本核酸化学会 ,  ホスト-ゲスト・超分子化学研究会
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