新海暁男

Shinkai Akeo

所属機関・部署：
ホームページURL (2件)： http://www.riken.jp/ , http://www.riken.jp/en/

研究分野 (5件)：応用生物化学 , ゲノム生物学 , 機能生物化学 , 構造生物化学 , 分子生物学

研究キーワード (5件)： DNA , 遺伝子 , タンパク質 , セントラルドグマ , CRISPR-Cas

競争的資金等の研究課題 (3件)：

2016 - 2020 高分解能な立体構造解析による、高度好熱菌獲得免疫システムの解明
2013 - 2016 1つの細胞が持つ新奇なウイルス防御システムの体系的理解
2010 - 2013 mRNA発現解析に基づいた、機能未知遺伝子の分類

論文 (79件)：

Akeo Shinkai, Hideharu Hashimoto, Chikako Shimura, Hiroaki Fujimoto, Kei Fukuda, Naoki Horikoshi, Masaki Okano, Hitoshi Niwa, Erik W Debler, Hitoshi Kurumizaka, et al. The C-terminal 4CXXC-type zinc finger domain of CDCA7 recognizes hemimethylated DNA and modulates activities of chromatin remodeling enzyme HELLS. NUCLEIC ACIDS RESEARCH. 2024. 52. 17. 10194-10219
Jurre A Steens, Yifan Zhu, David W Taylor, Jack P K Bravo, Stijn H P Prinsen, Cor D Schoen, Bart J F Keijser, Michel Ossendrijver, L Marije Hofstra, Stan J J Brouns, et al. SCOPE enables type III CRISPR-Cas diagnostics using flexible targeting and stringent CARF ribonuclease activation. NATURE COMMUNICATIONS. 2021. 12. 1. 5033
David W. Taylor, Yifan Zhu, Raymond H. J. Staals, Jack E. Kornfeld, Akeo Shinkai, John van der Oost, Eva Nogales, Jennifer A. Doudna. Structures of the CRISPR-Cmr complex reveal mode of RNA target positioning. SCIENCE. 2015. 348. 6234. 581-585
Hideaki Takano, Yoshihiro Agari, Kenta Hagiwara, Ren Watanabe, Ryuta Yamazaki, Teruhiko Beppu, Akeo Shinkai, Kenji Ueda. LdrP, a cAMP receptor protein/FNR family transcriptional regulator, serves as a positive regulator for the light-inducible gene cluster in the megaplasmid of Thermus thermophilus. MICROBIOLOGY-SGM. 2014. 160. 2650-2660
Raymond H. J. Staals, Yifan Zhu, David W. Taylor, Jack E. Kornfeld, Kundan Sharma, Arjan Barendregt, Jasper J. Koehorst, Marnix Vlot, Nirajan Neupane, Koen Varossieau, et al. RNA Targeting by the Type III-A CRISPR-Cas Csm Complex of Thermus thermophilus. MOLECULAR CELL. 2014. 56. 4. 518-530

MISC (10件)：

新海暁男. Type III CRISPR エフェクター複合体の活性とその調節機構. 生化学. 2021. 93. 6. 845-850
新海暁男. 高度好熱菌Thermus thermophilus由来Type III-B CRISPR-Cmr複合体の構造と機能. 生化学. 2015. 87. 4. 454-458
新海暁男. CRISPR-Casシステムの構造と機能. 生物物理. 2014. 54. 5. 247-252
新海暁男. 高度好熱菌Thermus thermophilus HB8株のCRISPR-Cas系を構成するCmr複合体の構造と機能. ライフサイエンス新着論文レビュー. 2013
新海暁男. CRISPR. 生化学. 2011. 83. 9. 863

特許 (7件)：

書籍 (2件)：

動物学の百科辞典
丸善出版 2018 ISBN:9784621303092
ポストシークエンスタンパク質実験法(2)試料調製法
東京化学同人 2002 ISBN:9784807911356

講演・口頭発表等 (65件)：

The C-terminal 4CXXC-type zinc finger domain of CDCA7 recognizes hemimethylated DNA and modulates activities of chromatin remodeling enzyme HELLS
(FASEB Science Research Conference, Biological Methylation: Fundamental Mechanisms 2024)
CDCA7のジンクフィンガードメインに依存した、DNA複製とカップルして形成されたヘテロクロマチンへのHELLS-CDCA7の集積
(第17回日本エピジェネティクス研究会年会 2024)
CDCA7のジンクフィンガードメインに依存した、クロマチンリモデリング酵素HELLS-CDCA7タンパク質複合体の活性化
(第17回日本エピジェネティクス研究会年会 2024)
クロマチンリモデリング酵素HELLSと複合体を形成するCDCA7タンパク質の機能ドメインの同定
(第16回日本エピジェネティクス研究会年会 2023)
クロマチンリモデリング酵素HELLSとCDCA7タンパク質との機能的相互作用
(第14回日本エピジェネティクス研究会年会 2021)

学歴 (3件)：

1988 - 1991 東京大学大学院農学系研究科博士後期課程(農芸化学専攻)
1986 - 1988 名古屋大学大学院農学研究科博士前期課程(農芸化学専攻)
1982 - 1986 名古屋大学農学部農芸化学科

学位 (1件)：

農学博士 (東京大学)

経歴 (5件)：

2024/04 - 現在理化学研究所上級研究員
2002/10 - 2024/03 理化学研究所先任研究員
2006/04 - 2013/03 理化学研究所チームリーダー
1991/04 - 2002/09 協和発酵工業(株) 東京研究所研究員
1999/11 - 2001/06 ワシントン大学客員研究員

委員歴 (1件)：

2013/10 - 2017/09 BMC Microbiology Associate Editor

所属学会 (3件)：

日本分子生物学会 , 日本生化学会 , 日本エピジェネティクス研究会

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