研究者
J-GLOBAL ID：200901083788745339   更新日: 2025年12月13日

坊農 秀雅

ボウノウ ヒデマサ | BONO HIDEMASA
所属機関・部署：
広島大学 大学院統合生命科学研究科

広島大学 大学院統合生命科学研究科 について


職名： 教授
その他の所属（所属・部署名・職名） (2件)：
  • 広島大学  ゲノム編集イノベーションセンター   副センター長
  • 情報・システム研究機構  データサイエンス共同利用基盤施設 ライフサイエンス統合データベースセンター   客員教授
ホームページURL (1件)： https://bonohu.hiroshima-u.ac.jp/
研究分野 (10件)： 代謝、内分泌学 ,  生命、健康、医療情報学 ,  データベース ,  バイオ機能応用、バイオプロセス工学 ,  遺伝育種科学 ,  腫瘍生物学 ,  分子生物学 ,  システムゲノム科学 ,  昆虫科学 ,  ゲノム生物学
研究キーワード (21件)： バイオDX ,  公共データベース ,  トランスクリプトーム解析 ,  ゲノム編集 ,  メタ解析 ,  オープンデータ ,  酸素生物学 ,  オープンアクセス ,  アノテーション ,  酸化ストレス ,  パーキンソン病 ,  がん ,  オープンソースソフトウェア ,  データベース ,  トランスクリプトーム ,  低酸素 ,  配列解析 ,  機能アノテーション ,  バイオインフォマティクス ,  ゲノム ,  遺伝子発現解析
競争的資金等の研究課題 (23件)：
  • 2024 - 2027 ハダカデバネズミの「健康長寿」システムを構成する分子基盤の解明
  • 2023 - 2027 組織擬態を成立させる識別制御の仕組みの解明
  • 2022 - 2027 新規脳内小タンパク質NPGLによる生活習慣病発症防止メカニズムの解明
  • 2021 - 2023 データ駆動型ゲノム育種を実現するデータ解析基盤技術の開発
  • 2020 - 2023 酸素ホメオスターシス制御を切り口とした麻酔に伴う免疫応答変容の分子基盤解明
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論文 (168件)：
  • Misako Imai, Miyuki Kanda, Moriya Mino, Kazuhiko Koike, Keisuke Okuhara, Hidemasa Bono. High-quality genome assembly and functional annotation of Hiroshima-derived Pacific oyster Magallana gigas. bioRxiv. 2025. 2025.11.20.688662
  • Takayuki Isagawa Masaki Suimye Morioka Hiroaki Semba Daigo Sawaki Tatsuyuki Sato Masaki Wake Hiroki Sugimoto Shigeru Sato Kazutoshi Ono Chuluun-Erdene Ariunbold Thuc Toan Pham Ryohei Tanaka Toshinaru Kawakami Masamichi Ito Shun Minatsuki Yasutomi Higashikuni Hidemasa Bono Hiroshi Harada Masataka Asagiri Ichiro Manabe Christian Stockmann Takahide Kohro Takahiro Kuchimaru Norihiko Takeda. LPS Induces Limited Activation of Hypoxia-Inducible Factor-1alpha (HIF1A) in Macrophages. Journal of Biological Chemistry. 2025
  • Sora Yonezawa, Hidemasa Bono. Functional Annotation of Novel Heat Stress-responsive Genes in Rice Utilizing Public Transcriptomes and Structurome. bioRxiv. 2025. 2025.09.29.679423
  • Mitsuo Shintani, Hidemasa Bono. Meta-analysis of public RNA-sequencing data of drought and salt stresses in different phenotypes of resistant and susceptible Oryza sativa cultivars. Quantitative Plant Biology. 2025. 6
  • Rahmawati Aisyah, Ruj Vatanapahu, Moe Mihara, Takashi Tagawa, Mai Kanazawa, Hiroshige Kuwahara, Siyi Chen, Hidemasa Bono, Thanutchaporn Kumrungsee, Noriyuki Yanaka. Anti-Obesity Effects of Peucedanum Japonicum Thunb Root Extract With Induction of Hepatic Cyp2b10 Gene Expression in Mice. Journal of Food Science. 2025. 90. 9. e70524
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MISC (64件)：
  • 奥原 啓輔, 横井 翔, 中村 保一, 坊農 秀雅. バイオDX産学共創拠点におけるデータベース基盤技術開発. トーゴーの日2021. 2021. 1
  • 藤岡周助, 藤岡周助, 岡香織, 河村佳見, 河村佳見, 菰原義弘, 中條岳志, 山村祐紀, 大岩祐基, 須藤洋一, et al. ハダカデバネズミの炎症応答の減弱は発がん耐性に寄与している. 日本薬学会年会要旨集(Web). 2021. 141st. 29V08-am11S
  • Hiromasa Ono, Hidemasa Bono. RefEx: Dataset for Reference Gene Expression. Practical Guide to Life Science Databases. 2021. in press-133
  • 坊農秀雅. 注目を集める生命科学データ解析. 電脳会議. 2019. 193. 7-7
  • 小野浩雅, 坊農秀雅. 遺伝子発現解析の基準となるデータを快適に検索できるウェブツール「RefEx」. 実験医学. 2018. 36. 6. 999-1003
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書籍 (35件)：
  • 論文に出る遺伝子 デルジーン300
    羊土社 2024 ISBN:9784758122771
  • Dr. Bonoのゲノム解読 - NGSによるシークエンシングとデータ解析の今 -
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2024 ISBN:4815731209
  • 生命科学研究のためのデジタルツール入門 第2版
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2024 ISBN:4815731063
  • 生命科学者のためのDr.Bonoデータ解析道場 第2版
    メディカル・サイエンス・インターナショナル 2023 ISBN:9784815730888
  • 改訂版RNA-Seqデータ解析 WETラボのための超鉄板レシピ
    羊土社 2023 ISBN:9784758122672
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講演・口頭発表等 (212件)：
  • 昆虫BioDXによるスーパー昆虫作出に向けて
    (第70回日本応用動物昆虫学会大会 2026)
  • バイオDXによるデジタル育種基盤技術開発
    (スーパーコンピュータワークショップ2025 「生命科学を加速するバイオインフォマティクスとスーパーコンピュータ」 2026)
  • Meta-Analysis of Wild Relatives and Domesticated Crops to an Integrated Crop Breeding Database - Toward Digital Breeding
    (Plant and Animal Genome Conference / PAG 33 2026)
  • Improvement of Meta-Analysis Methods for Public Gene Expression Data: Applications to Livestock Domestication Studies Using Conventional Methods and Hypoxia-Responsive Gene Discovery Using Machine Learning
    (Plant and Animal Genome Conference / PAG 33 2026)
  • RNAOffScan:DNA言語モデルを活用した Cytosine base editorのRNAオフターゲット予測ツール
    (第48回 日本分子生物学会年会 2025)
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Works (8件)：
  • AOE (All of gene expression)
    坊農秀雅 2014 - 2024
  • CRISPRdirect
    内藤雄樹, 日野公洋, 坊農秀雅, 程久美子 2014 -
  • RefEx (Reference Expression dataset)
    小野浩雅, 坊農秀雅 2011 -
  • GGRNA
    内藤雄樹, 坊農秀雅 2011 -
  • DBCLS SRA
    仲里猛留, 大田達郎, 坊農秀雅 2011 -
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学歴 (4件)：
  • 1997 - 2000 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻 生物物理学系 博士後期課程
  • 1995 - 1997 京都大学 大学院理学研究科 生物科学専攻 生物物理学系 修士課程
  • 1993 - 1995 東京大学 教養学部 基礎科学科第一
  • 1991 - 1993 東京大学 理科二類
学位 (1件)：
  • 博士(理学) (京都大学)
経歴 (12件)：
  • 2025/04 - 現在 広島大学 理学部生物科学科 学科長
  • 2025/04 - 現在 広島大学 ゲノム編集イノベーションセンター 副センター長
  • 2023/10 - 現在 広島大学 大学院統合生命科学研究科 教授
  • 2022/04 - 現在 広島大学 プラチナバイオ共同研究講座バイオDX研究室 共同研究講座教授
  • 2020/04 - 現在 情報・システム研究機構 ライフサイエンス統合データベースセンター 客員教授
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委員歴 (15件)：
  • 2024/08 - 2026/06 (社)日本ゲノム編集学会 広報委員会委員
  • 2025/05 - 2026/03 文部科学省 科学技術・学術政策研究所 科学技術予測・政策基盤調査研究センター 専門調査員
  • 2024/06 - 2025/07 IJMS Guest Editor
  • 2025/04 - 2025/06 東京大学 非常勤講師
  • 2020/04 - 2025/03 大学共同利用機関法人情報・システム研究機構 データサイエンス共同利用基盤施設ライフサイエンス統合データベースセンター 客員教授
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所属学会 (3件)：
日本ゲノム編集学会 ,  日本癌学会 ,  日本分子生物学会
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