- 2018 - 2023 免疫性神経疾患を修飾する新たな内分泌性制御因子と環境因子のクロストーク
- 2016 - 2020 乳児期における腸内細菌叢の構成、新たなバイオマーカーとアレルギー疾患の発症の解明
- 2016 - 2019 神経性やせ症の病態解明と新パラダイムの創出:腸内細菌による体重・行動特性の制御
- 2016 - 2019 Molecular mechanisms for IgA-mediated regulations of host-microbiota symbiosis
- 2014 - 2017 不耕起栽培畑地土壌の物質循環系メタゲノム解析
- 2014 - 2016 心不全における腸内細菌叢の機能的役割の解明
- 2013 - 2016 アジア人種の食と腸内フローラと健康に関する調査研究
- 2013 - 2016 水田メタゲノミクス:持続的生産を支える土壌-根圏微生物とその機能の全貌解明
- 2012 - 2016 多発性硬化症と腸内細菌・腸管免疫の関連に関する研究
- 2010 - 2016 ゲノム科学の総合的推進に向けた大規模ゲノム情報生産・高度情報解析支援
- 2012 - 2015 歯周病細菌性因子の解明を目指したプラーク由来臨床株の分離とそのゲノム解析
- 2013 - 2014 ヒト唾液中に存在する腸内常在性細菌種の特定とその特徴解明
- 2011 - 2013 腸内フローラを用いた動物個体識別法の開発
- 2010 - 2012 比較メタゲノミクスによる土壌微生物性解析の基盤構築
- 2008 - 2010 口腔・歯周病フローラのメタゲノム解析
- 2005 - 2009 微生物ゲノムシーケンシング体制の活用による微生物システム解明への基盤構築
- 2004 - 2009 生命のシステム的理解に向けたゲノム研究推進のための総合的基盤構築
- 2005 - 2007 歯根膜トランスクリプトーム解析によるオーダーメード歯周組織再生療法の新展開
- 2005 - 2007 Theileria orientalisゲノム完全解読と機能分子の比較解析
- 2005 - 微生物ゲノム及び環境微生物叢のメタゲノム研究
- 2005 - Environmental genomics
- 2001 - 2001 ダウン症候群原因遺伝子の同定とその発症機構のゲノム科学的研究
- 2000 - 2000 ダウン症候群原因遺伝子の同定とその発症機構のゲノム科学的研究
- 1995 - 1995 メチル化によるL1配列の転写制御機能の解析
- 1994 - 1994 脳における神経細胞死により誘起される遺伝子発現の分子機構に関する研究
- 1992 - 1993 アミロイド沈着に起因する神経難病の分子遺伝学的解析
- 1992 - 1992 ヒトゲノム反復配列L1の転写機構に関する研究
- 1989 - 1991 アミロイド沈着に起因する神経難病の分子遺伝学的解析
- 1986 - 1986 家族性アミロイドーシス病因解析への分子遺伝学的アプローチ
- 1986 - 1986 Ca∂発光蛋白Aequorinの遺伝子工学的手法による構造解析と純化
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