研究者
J-GLOBAL ID:200901084345719960
更新日: 2024年09月27日
遠藤 俊徳
エンドウ トシノリ | Endo Toshinori
所属機関・部署:
職名:
教授
研究分野 (6件):
進化生物学
, 多様性生物学、分類学
, 機能生物化学
, ゲノム生物学
, 生物分子化学
, 生命、健康、医療情報学
研究キーワード (5件):
遺伝子進化と生物進化
, 正の自然淘汰
, 機械学習による機能予測
, 遺伝子構造・機能
, 情報生物学
競争的資金等の研究課題 (11件):
- 2018 - 2023 動植物ゲノム配列解析にもとづくヤポネシアへのヒトの移動の推定
- 2019 - 2022 遺伝的クローンであるアリの適応的な表現型個体差を産み出す分子機構の解明
- 2014 - 2018 多様な無脊椎動物の比較解析基盤としての比較ゲノムデータベース構築
- 2014 - 2016 高速分子動力学法によるHCV抗ウイルス薬耐性化予測仮想アッセイシステムの構築
- 2012 - 2014 インターメア機能配列の情報量規準と機械学習による同定および進化的解析
- 2005 - 2009 病態のシステム的理解と疾患情報モデルの構築
- 2008 - GPGPUによる高速マルチプルアラインメント法の開発
- 2008 - Development of GPGPU based multiple sequence alignment method
- 2005 - オーファンエンザイム情報に基づく遺伝子機能予測
- 2005 - Prediction of the function of hypothetical genes based on the information of orphan enzymes
- 2002 - 2004 ゲノムの遺伝子プロファイルによる生物の形態形成機構の解明
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論文 (48件):
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Yi Cong, Toshinori Endo. A Quadruple Revolution: Deciphering Biological Complexity with Artificial Intelligence, Multiomics, Precision Medicine, and Planetary Health. OMICS: A Journal of Integrative Biology. 2024
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Kazumichi Fujiwara, Shunpei Kubo, Toshinori Endo, Toyoyuki Takada, Toshihiko Shiroishi, Hitoshi Suzuki, Naoki Osada. Inference of selective forces on house mouse genomes during secondary contact in East Asia. Genome Research. 2024
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Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Advancing Antibody-antigen Interface Analysis in Docking Scoring Functions for Precision Docking Analysis. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 40-47
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Sangeetha Ratnayake, Axel Martinelli, Toshinori Endo, Naoki Osada. Exploring The Interplay Between Scoring Functions and Physico-chemical Properties in Antibody-antigen Docking. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2024. 17. 10-17
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So Nakagawa, Shoichi Sakaguchi, Atsushi Ogura, Katsuhiko Mineta, Toshinori Endo, Yoshiyuki Suzuki, Takashi Gojobori. Current trends in RNA virus detection through metatranscriptome sequencing data. FEBS open bio. 2023. 13. 6. 992-1000
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MISC (135件):
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藤原一道, 久保俊平, 遠藤俊徳, 高田豊行, 城石俊彦, 鈴木仁, 長田直樹. 進化ダイナミクスの解読:東アジアにおけるハツカネズミ亜種の交雑を探索. 日本進化学会大会プログラム・講演要旨集(Web). 2023. 25th
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細川竜聡, 里村和浩, 長田直樹, 遠藤俊徳. De novo Gene Birth:ゲノムの非コード領域から新たに誕生する遺伝子. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2023. 95th (CD-ROM)
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CONG Yi, 長田直樹, 遠藤俊徳. 疾患特異的遺伝子発現データによるドラッグリポジショニング予測. 日本分子生物学会年会プログラム・要旨集(Web). 2023. 46th
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遠藤俊徳. メンデル生誕200年記念 6 日本における遺伝学の発展. 生物の科学 遺伝. 2022. 76. 4. 286-289
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柴山竜三郎, 遠藤俊徳, 長田直樹, 谷口浩二. シングルセルRNA-seqデータを用いた老化細胞除去後の非CpG island遺伝子群の発現変動解析. 日本遺伝学会大会プログラム・予稿集. 2022. 94th (CD-ROM)
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書籍 (18件):
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生物の科学 遺伝 Vol.76 No.4 特集:メンデル生誕200年記念
エヌ・ティー・エス 2022 ISBN:486043756X
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遺伝学の百科事典 : 継承と多様性の源
丸善出版 2022 ISBN:9784621306604
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改訂 遺伝単 -遺伝学用語集 対訳付き (『生物の科学 遺伝』別冊No.25)
エヌ・ティー・エス 2021 ISBN:4860437128
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遺伝単-遺伝学用語集 対訳付き (生物の科学 遺伝 別冊No.22)
エヌ・ティー・エス 2017 ISBN:4860434994
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分子生物学のためのバイオインフォマティクス入門 : 生物情報解析の理論とアルゴリズム
共立出版 2001 ISBN:4320055802
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講演・口頭発表等 (1件):
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Evolutionary analysis of Mollicutes based on standardized phylogenetic tree
(2013)
学歴 (3件):
- 1993 - 1996 総合研究大学院大学 生命科学研究科 遺伝学専攻
- 1990 - 1993 東京大学 大学院理学系研究科 生物化学専攻
- 1986 - 1990 東京大学 理学部 生物化学科
学位 (2件):
- 博士(理学) (総合研究大学院大学)
- Master.of Science (The University of Tokyo)
経歴 (13件):
- 2019/04 - 現在 北海道大学 大学院情報科学研究院 教授
- 2016/12 - 現在 北海道大学 数理・データサイエンス教育研究センター
- 2020/04 - 2021/03 北海道大学 大学院情報科学院 生体情報工学コース長
- 2020/04 - 2021/03 北海道大学 大学院情報科学研究院情報科学専攻 生命人間情報科学部門長
- 2004/04 - 2019/03 北海道大学 大学院情報科学研究科 教授
- 2015/04 - 2017/03 北海道大学 情報学企画委員会 委員長
- 2014/04 - 2015/03 北海道大学 大学院情報科学研究科 生命人間情報科学専攻長
- 2014/04 - 2015/03 北海道大学 工学部情報エレクトロニクス 学科長
- 2008/04 - 2009/03 北海道大学 大学院情報科学研究科 生命人間情報科学専攻長
- 2000/04 - 2004/03 東京医科歯科大学 難治疾患研究所 講師
- 1999/05 - 2000/03 理化学研究所 ゲノム科学総合研究センター 研究員
- 1997/04 - 1999/04 独立行政法人日本学術振興会
- 1996/04 - 1997/03 国立研究開発法人新エネルギー・産業技術総合開発機構 研究員
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委員歴 (15件):
- 2019/04 - 現在 日本バイオインフォマティクス学会 北海道地域部会長
- 2016/12 - 現在 数理・データサイエンス教育強化拠点コンソーシアム 委員
- 2011/04 - 現在 日本情報処理学会 バイオ情報学研究会論文誌編集委員会
- 2011/04 - 現在 日本情報処理学会 バイオ情報学研究会運営委員会
- 2009 - 現在 日本遺伝学会 幹事
- 2020/09 - 2022/10 日本遺伝学会 第94回大会長
- 2018/04 - 2022/03 札幌市IoTイノベーション推進コンソーシアム BI研究部会委員
- 2003 - 2021/06 生き物文化誌学会 常任理事
- 2016/09 - 2019/03 日本バイオインフォマティクス学会 評議員
- 2016/10 - 2017/12 第6回生命医薬情報学連合大会 (IIBMP) / 日本バイオインフォマティクス学会年会 大会長
- 2011 - Society for Molecular Biology and Evolution 年会準備委員
- 2011 - Society for Molecular Biology and Evolution Annual meeting committee member
- 2008 - 2010 日本遺伝学会 第82回大会実行委員
- 2005 - 2007 日本バイオインフォマティクス学会 幹事
- 2005 - 2007 日本バイオインフォマティクス学会 北海道地域部会長
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所属学会 (7件):
日本バイオインフォマティクス学会
, 生き物文化誌学会
, 日本遺伝学会
, 日本進化学会
, 日本情報処理学会
, Society for Molecular Biology and Evolution
, 日本情報処理学会バイオ情報学研究会
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