研究者
J-GLOBAL ID：200901086154329960   更新日: 2024年04月22日

稲垣 祐司

イナガキ ユウジ | Inagaki Yuji
所属機関・部署：
筑波大学 計算科学研究センター

筑波大学 計算科学研究センター について


職名： 教授
研究分野 (2件)： 多様性生物学、分類学 ,  進化生物学
競争的資金等の研究課題 (18件)：
  • 2019 - 2023 ミトコンドリアDNAポリメラーゼの多様性と進化の全容解明
  • 2018 - 2022 海洋原生生物に共生する細菌多様性の実態解明
  • 2017 - 2020 非光合成生物の光適応進化の全容解明
  • 2016 - 2019 渦鞭毛藻細胞内に発見された新たな共生体痕跡核ゲノムの解読
  • 2016 - 2019 海洋バクテリアの長期炭素隔離機能に対する海洋酸性化の影響評価
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論文 (135件)：
  • Nakayama, Takuro, Yabuki, Akinori, Nomura, Mami, Shiba, Kogiku, Inaba, Kazuo, Inagaki, Yuji. Convergent reductive evolution of cyanobacteria in symbiosis with Dinophysiales dinoflagellates. bioRχiv. 2024
  • Harada, Ryo, Hirakawa, Yoshihisa, Yabuki, Akinori, Kim, Eunsoo, Yazaki, Euki, Kamikawa, Ryoma, Kentaro, Nakano, Eliáš, Marek, Inagaki, Yuji. Encyclopaedia of family A DNA polymerases localized in organelles: Evolutionary contribution of bacteria including the proto-mitochodrion. Molecular Biology and Evolution. 2024. 41. 2. msae014
  • Harada, Ryo, Inagaki, Yuji. Gleaning Euglenozoa-specific DNA polymerases in public single-cell transcriptome data. Protist. 2023. 174. 6. 125997
  • Kume, Keitaro, Tsubasa, Gen, Kazuki, Abe, Hiroshi, Komatsuzaki, Euki, Yazaki, Goro, Tanifuji, Ryoma, Kamikawa, Inagaki, Yuji, Hashimoto, Tetsuo. Transcriptome data sets of free-living diplomonads, Treponema sp, and Hexamita sp. MICROBIOLOGY RESOURCE ANNOUNCEMENTS. 2023. 12. 11. e0050623-e0050623
  • Harada, Ryo, Kume, Keitaro, Horie, Kazumasa, Nakayama, Takuro, Inagaki, Yuji, Amagasa, Toshiyuki. AtLASS: A scheme for end-to-end prediction of splice sites using attention-based bi-LSTM. IPSJ Transactions on Bioinformatics. 2023. 16. 20-27
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MISC (109件)：
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書籍 (4件)：
  • 共生微生物
    化学同人 2016 ISBN:9784759817287
  • Reference modules in Materials Science and Engineering 2016
    2016
  • ロングブランチの誘惑--分子系統解析のダークサイド
    藻類 2007
  • アピコンプレクサ類の退化葉緑体は緑藻起源か?
    藻類 2004
講演・口頭発表等 (147件)：
  • Morphology, ultrastructure and phylogeny of a new species of <i>Glissandra</i> (Protista incertae sedis).
    (ICOP2017 2017)
  • 光合成関連遺伝子に着目した緑色渦鞭毛藻TGD株のヌクレオモルフゲノムの解析.
    (日本藻類学会第48回大会)
  • ディプロモナス類の寄生虫化に伴う遺伝子レパートリーの変化:近縁自由生活種とのオルソログ比較解析
    (第93回日本寄生虫学会大会)
  • I′′型ルビスコの発見:I/I′型ルビスコに対する祖先的タンパク質群.
    (日本共生生物学会第7回大会)
  • クレン古細菌におけるPCNA複合体の進化.
    (日本共生生物学会第7回大会)
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経歴 (1件)：
  • 2016/04 - 現在 筑波大学 計算科学研究センター 教授
受賞 (3件)：
  • 2008/08 - 日本進化学会 日本進化学会研究奨励賞
  • 2007/04 - 文部科学省 科学技術分野の文部科学大臣表彰若手科学者賞
  • 1993/04 - 公益信託森安大学院生奨学基金
所属学会 (6件)：
International Society of Protistologists ,  日本藻類学会 ,  Society for Molecular Biology and Evolution ,  日本分子生物学会 ,  日本進化学会 ,  International Society for Evolutionary Protistology
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